ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012119	AGCAA	3	10381	10394	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012119	TTCTT	4	13186	13204	19	0 %	80 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
3	NC_012119	ACTAG	3	22833	22847	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	22436561
4	NC_012119	ACTTA	3	29930	29943	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	22436561
5	NC_012119	TTACT	3	32496	32509	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	22436561
6	NC_012119	TTCTT	3	47154	47168	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	22436561
7	NC_012119	TCAAA	3	48314	48327	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	22436561
8	NC_012119	GAGAA	3	48397	48410	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	22436561
9	NC_012119	AGGGG	3	51229	51243	15	20 %	0 %	80 %	0 %	6 %	22436561
10	NC_012119	ATGAC	3	103018	103032	15	40 %	20 %	20 %	20 %	0 %	22436561
11	NC_012119	GTAGA	3	111702	111715	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	22436561
12	NC_012119	TTCCT	3	114493	114507	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	22436561
13	NC_012119	TTTTA	3	123244	123257	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	22436561
14	NC_012119	TGGAT	3	141050	141064	15	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	22436561
15	NC_012119	AAGCG	3	156513	156527	15	40 %	0 %	40 %	20 %	6 %	22436561
16	NC_012119	AAATA	4	172019	172038	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	22436561
17	NC_012119	GGCTA	3	218222	218235	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	22436563
18	NC_012119	GAAAG	3	218751	218766	16	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	22436563
19	NC_012119	AGGGG	3	228480	228494	15	20 %	0 %	80 %	0 %	0 %	22436563
20	NC_012119	TTCCC	3	230366	230380	15	0 %	40 %	0 %	60 %	6 %	22436563
21	NC_012119	TTTTG	3	239571	239584	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	22436563
22	NC_012119	TTTTC	3	242548	242562	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	22436563
23	NC_012119	TGCGG	3	248985	248998	14	0 %	20 %	60 %	20 %	7 %	22436563
24	NC_012119	ACCTT	3	249509	249522	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	22436563
25	NC_012119	GAAGA	3	268135	268148	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	22436563
26	NC_012119	TTATT	3	268746	268760	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	22436563
27	NC_012119	TCAAT	3	270408	270421	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	22436563
28	NC_012119	AAAAT	3	311171	311184	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	22436563
29	NC_012119	ATACT	3	317010	317024	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	22436563
30	NC_012119	GAAAG	3	332415	332429	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	22436563
31	NC_012119	GGTAA	3	343442	343455	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	22436563
32	NC_012119	ATACT	3	352500	352514	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	22436563
33	NC_012119	ATTCC	3	360486	360499	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	22436563
34	NC_012119	GCATT	3	378243	378256	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	22436563
35	NC_012119	TCGCT	3	381813	381827	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	22436563
36	NC_012119	AAAAG	3	403182	403195	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	22436563
37	NC_012119	TCCTT	3	416588	416602	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	22436563
38	NC_012119	TGTAA	3	424374	424387	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	22436563
39	NC_012119	GGTAA	3	429235	429250	16	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	22436563
40	NC_012119	CCGTT	3	444467	444480	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	22436563
41	NC_012119	TCTCT	3	449794	449808	15	0 %	60 %	0 %	40 %	0 %	22436563
42	NC_012119	TCTCT	3	464437	464450	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	22436563
43	NC_012119	CTAAG	3	470858	470871	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	22436563
44	NC_012119	GAATG	3	471669	471682	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	22436563
45	NC_012119	AGAAA	3	502060	502073	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	22436563
46	NC_012119	TTACT	3	502348	502362	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	22436563
47	NC_012119	GCAAA	3	548352	548366	15	60 %	0 %	20 %	20 %	0 %	22436563
48	NC_012119	TTTTA	3	562535	562548	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	22436563
49	NC_012119	TCAAA	3	585818	585831	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	22436563
50	NC_012119	TGGTC	3	598329	598343	15	0 %	40 %	40 %	20 %	6 %	22436563
51	NC_012119	CCTTT	3	606245	606259	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	22436563
52	NC_012119	GTATA	4	611440	611459	20	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	22436563
53	NC_012119	TTCGT	3	617687	617700	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	22436563
54	NC_012119	ACCGT	3	628192	628206	15	20 %	20 %	20 %	40 %	0 %	22436563
55	NC_012119	CCTTC	4	660511	660530	20	0 %	40 %	0 %	60 %	5 %	22436563
56	NC_012119	AGTTT	3	663721	663735	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	22436563
57	NC_012119	ACTTC	3	678675	678688	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	22436563
58	NC_012119	GGTTT	3	694661	694674	14	0 %	60 %	40 %	0 %	7 %	22436563
59	NC_012119	CCCTA	4	696881	696899	19	20 %	20 %	0 %	60 %	5 %	22436563
60	NC_012119	GAAAG	3	703554	703567	14	60 %	0 %	40 %	0 %	7 %	22436563
61	NC_012119	TCTCT	3	709047	709060	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	22436563
62	NC_012119	TTTTA	3	729007	729020	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	22436563
63	NC_012119	AGTTC	3	729395	729408	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	22436563
64	NC_012119	AAGGA	3	737454	737468	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	22436563
65	NC_012119	GTCTC	3	739910	739924	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	22436563
66	NC_012119	TTTAT	3	746202	746216	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	22436563
67	NC_012119	TATAG	4	751925	751943	19	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	22436563
68	NC_012119	CAACC	3	752802	752815	14	40 %	0 %	0 %	60 %	7 %	22436563
69	NC_012119	CTGAT	3	757999	758013	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	22436563
70	NC_012119	CTGCC	4	761073	761093	21	0 %	20 %	20 %	60 %	9 %	22436563
71	NC_012119	CGGGC	3	764138	764151	14	0 %	0 %	60 %	40 %	7 %	22436563

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion