ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012119	ATA	4	2505	2516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012119	TA	8	10708	10723	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012119	AT	6	10725	10736	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012119	GGGA	3	16456	16467	12	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012119	TCAT	3	21961	21972	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
6	NC_012119	ACTAG	3	22833	22847	15	40 %	20 %	20 %	20 %	22436561
7	NC_012119	AC	6	26099	26110	12	50 %	0 %	0 %	50 %	22436561
8	NC_012119	AT	12	26582	26605	24	50 %	50 %	0 %	0 %	22436561
9	NC_012119	T	14	27651	27664	14	0 %	100 %	0 %	0 %	22436561
10	NC_012119	AGT	4	27972	27983	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22436561
11	NC_012119	T	14	33088	33101	14	0 %	100 %	0 %	0 %	22436561
12	NC_012119	T	12	39203	39214	12	0 %	100 %	0 %	0 %	22436561
13	NC_012119	TAT	5	45485	45499	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436561
14	NC_012119	ATGA	3	46831	46842	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436561
15	NC_012119	TCGG	3	47900	47911	12	0 %	25 %	50 %	25 %	22436561
16	NC_012119	GCTA	3	50758	50769	12	25 %	25 %	25 %	25 %	22436561
17	NC_012119	ACA	4	56389	56400	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22436561
18	NC_012119	AGTG	3	63626	63637	12	25 %	25 %	50 %	0 %	22436561
19	NC_012119	A	12	66788	66799	12	100 %	0 %	0 %	0 %	22436561
20	NC_012119	TTCC	3	68516	68527	12	0 %	50 %	0 %	50 %	22436561
21	NC_012119	AG	6	91242	91253	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436561
22	NC_012119	A	13	97317	97329	13	100 %	0 %	0 %	0 %	22436561
23	NC_012119	GAAA	3	99712	99723	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
24	NC_012119	ATGAC	3	103018	103032	15	40 %	20 %	20 %	20 %	22436561
25	NC_012119	ATCT	3	108974	108985	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
26	NC_012119	AGAA	3	110794	110805	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
27	NC_012119	TTCT	3	114478	114489	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436561
28	NC_012119	CTT	4	124335	124346	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22436561
29	NC_012119	TTTATT	3	127780	127797	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	22436561
30	NC_012119	ATT	4	127812	127823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436561
31	NC_012119	CTG	4	138059	138070	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22436561
32	NC_012119	TCTT	3	139484	139495	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436561
33	NC_012119	AGAA	3	140255	140266	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
34	NC_012119	TGGA	3	145631	145642	12	25 %	25 %	50 %	0 %	22436561
35	NC_012119	ATCA	3	151651	151662	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436561
36	NC_012119	AGA	4	154687	154698	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22436561
37	NC_012119	TCTA	3	157266	157277	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
38	NC_012119	CTAT	3	159371	159382	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436561
39	NC_012119	TA	8	159473	159488	16	50 %	50 %	0 %	0 %	22436561
40	NC_012119	GAAG	3	169391	169402	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436561
41	NC_012119	GAA	4	171008	171019	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22436561
42	NC_012119	GAAA	3	171237	171248	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436561
43	NC_012119	AAATA	3	172024	172038	15	80 %	20 %	0 %	0 %	22436561
44	NC_012119	CAAC	3	173862	173873	12	50 %	0 %	0 %	50 %	22436561
45	NC_012119	A	13	174661	174673	13	100 %	0 %	0 %	0 %	22436561
46	NC_012119	TA	6	177306	177317	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436561
47	NC_012119	AAT	4	181790	181801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22436561
48	NC_012119	TTAT	3	184218	184229	12	25 %	75 %	0 %	0 %	22436561
49	NC_012119	CGGC	3	188851	188862	12	0 %	0 %	50 %	50 %	22436561
50	NC_012119	CATT	3	205434	205445	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
51	NC_012119	GGCG	3	208263	208274	12	0 %	0 %	75 %	25 %	22436563
52	NC_012119	GAA	4	224137	224148	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22436563
53	NC_012119	GAA	4	224197	224208	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22436563
54	NC_012119	AGGGG	3	228480	228494	15	20 %	0 %	80 %	0 %	22436563
55	NC_012119	TAT	5	231552	231566	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436563
56	NC_012119	ATA	4	236619	236630	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22436563
57	NC_012119	AT	6	238425	238436	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
58	NC_012119	TTTTC	3	242548	242562	15	0 %	80 %	0 %	20 %	22436563
59	NC_012119	CTTG	3	244034	244045	12	0 %	50 %	25 %	25 %	22436563
60	NC_012119	TTAA	6	244654	244677	24	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
61	NC_012119	G	12	245373	245384	12	0 %	0 %	100 %	0 %	22436563
62	NC_012119	AGAA	3	247743	247754	12	75 %	0 %	25 %	0 %	22436563
63	NC_012119	AG	6	248222	248233	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436563
64	NC_012119	TTAT	4	259588	259603	16	25 %	75 %	0 %	0 %	22436563
65	NC_012119	AGA	4	278483	278494	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22436563
66	NC_012119	CG	7	284508	284521	14	0 %	0 %	50 %	50 %	22436563
67	NC_012119	AATC	3	285572	285583	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436563
68	NC_012119	CTTA	3	291829	291840	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
69	NC_012119	TTA	4	294734	294745	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436563
70	NC_012119	TAT	5	298872	298886	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436563
71	NC_012119	GTTT	3	311994	312005	12	0 %	75 %	25 %	0 %	22436563
72	NC_012119	CAT	4	317979	317990	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22436563
73	NC_012119	ACTC	3	320651	320662	12	25 %	25 %	0 %	50 %	22436563
74	NC_012119	TA	6	332483	332494	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
75	NC_012119	ATT	4	332515	332526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436563
76	NC_012119	ATA	4	332597	332608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22436563
77	NC_012119	C	13	338260	338272	13	0 %	0 %	0 %	100 %	22436563
78	NC_012119	TTAG	3	340409	340420	12	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
79	NC_012119	TCCA	3	346805	346816	12	25 %	25 %	0 %	50 %	22436563
80	NC_012119	AT	8	346934	346949	16	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
81	NC_012119	GCCC	3	353945	353956	12	0 %	0 %	25 %	75 %	22436563
82	NC_012119	AT	11	354545	354566	22	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
83	NC_012119	TA	6	354578	354589	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
84	NC_012119	GGAA	3	355548	355559	12	50 %	0 %	50 %	0 %	22436563
85	NC_012119	TA	8	356374	356389	16	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
86	NC_012119	TA	7	356394	356407	14	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
87	NC_012119	AT	6	360004	360015	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
88	NC_012119	AATG	3	368869	368880	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436563
89	NC_012119	AT	6	368950	368961	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
90	NC_012119	AT	8	368967	368982	16	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
91	NC_012119	ATTC	3	369505	369516	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
92	NC_012119	TAA	6	370089	370106	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22436563
93	NC_012119	TCTT	3	383592	383603	12	0 %	75 %	0 %	25 %	22436563
94	NC_012119	CCATCA	3	389604	389621	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	22436563
95	NC_012119	ATTG	3	394085	394096	12	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
96	NC_012119	T	12	400203	400214	12	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
97	NC_012119	CTA	4	407551	407562	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22436563
98	NC_012119	ACTA	3	413688	413699	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436563
99	NC_012119	A	16	416823	416838	16	100 %	0 %	0 %	0 %	22436563
100	NC_012119	T	13	426223	426235	13	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
101	NC_012119	CATT	3	428315	428326	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
102	NC_012119	GTAT	3	430494	430505	12	25 %	50 %	25 %	0 %	22436563
103	NC_012119	T	12	433443	433454	12	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
104	NC_012119	T	14	436417	436430	14	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
105	NC_012119	T	12	442165	442176	12	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
106	NC_012119	TCTCT	3	449794	449808	15	0 %	60 %	0 %	40 %	22436563
107	NC_012119	TA	6	450598	450609	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
108	NC_012119	GCT	4	461871	461882	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22436563
109	NC_012119	T	14	474409	474422	14	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
110	NC_012119	TAT	4	477731	477742	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22436563
111	NC_012119	A	13	478218	478230	13	100 %	0 %	0 %	0 %	22436563
112	NC_012119	TA	6	480407	480418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
113	NC_012119	TCCA	3	487621	487632	12	25 %	25 %	0 %	50 %	22436563
114	NC_012119	CTT	4	494367	494378	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22436563
115	NC_012119	ATG	4	499778	499789	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22436563
116	NC_012119	TTACT	3	502348	502362	15	20 %	60 %	0 %	20 %	22436563
117	NC_012119	ATAC	3	513249	513260	12	50 %	25 %	0 %	25 %	22436563
118	NC_012119	TTC	4	525894	525905	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22436563
119	NC_012119	T	13	526737	526749	13	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
120	NC_012119	AT	7	527556	527569	14	50 %	50 %	0 %	0 %	22436563
121	NC_012119	A	12	529041	529052	12	100 %	0 %	0 %	0 %	22436563
122	NC_012119	TGAC	3	537205	537216	12	25 %	25 %	25 %	25 %	22436563
123	NC_012119	GATG	4	538138	538153	16	25 %	25 %	50 %	0 %	22436563
124	NC_012119	A	13	544946	544958	13	100 %	0 %	0 %	0 %	22436563
125	NC_012119	GCAA	3	547530	547541	12	50 %	0 %	25 %	25 %	22436563
126	NC_012119	GCAAA	3	548352	548366	15	60 %	0 %	20 %	20 %	22436563
127	NC_012119	AGG	4	549107	549118	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22436563
128	NC_012119	T	12	555267	555278	12	0 %	100 %	0 %	0 %	22436563
129	NC_012119	TTCA	3	562041	562052	12	25 %	50 %	0 %	25 %	22436563
130	NC_012119	TAAG	3	562466	562477	12	50 %	25 %	25 %	0 %	22436563
131	NC_012119	AGGC	3	563768	563779	12	25 %	0 %	50 %	25 %	22436563
132	NC_012119	GCG	4	568858	568869	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22436563
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134	NC_012119	GCTA	3	586888	586899	12	25 %	25 %	25 %	25 %	22436563
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion