ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012119	TAGAGA	3	2845	2862	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_012119	ACTAGA	3	4590	4607	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
3	NC_012119	AAAACA	3	56648	56665	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	22436561
4	NC_012119	AGGGAC	3	63406	63423	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	22436561
5	NC_012119	AAAGTC	3	66703	66719	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22436561
6	NC_012119	ATTCCT	3	121201	121218	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	22436561
7	NC_012119	TTTATT	3	127780	127797	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	22436561
8	NC_012119	ATCTTT	3	128463	128480	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	22436561
9	NC_012119	AGTTTC	3	128940	128957	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22436561
10	NC_012119	TCGCTC	3	169684	169700	17	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	5 %	22436561
11	NC_012119	TTTCTT	3	214598	214615	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	22436563
12	NC_012119	TGTAGA	3	216641	216658	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	22436563
13	NC_012119	CTCAGG	3	255424	255441	18	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	5 %	22436563
14	NC_012119	TCTTTT	3	273392	273410	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	22436563
15	NC_012119	TTCTGT	3	281261	281279	19	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	22436563
16	NC_012119	CAGAGC	3	307684	307700	17	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	22436563
17	NC_012119	AAACTG	3	333107	333124	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22436563
18	NC_012119	CTAGAG	3	366569	366587	19	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10 %	22436563
19	NC_012119	CTTTTC	3	370035	370053	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	22436563
20	NC_012119	AGTTTG	3	373137	373153	17	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	22436563
21	NC_012119	CCATCA	3	389604	389621	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	0 %	22436563
22	NC_012119	AATCAT	3	390234	390251	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	22436563
23	NC_012119	AGATAC	3	399146	399163	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22436563
24	NC_012119	ATGGGG	3	419333	419351	19	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	10 %	22436563
25	NC_012119	CTTTCT	4	443346	443369	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	22436563
26	NC_012119	ACTCCA	3	467305	467322	18	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	5 %	22436563
27	NC_012119	TTTTTA	3	498149	498165	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	22436563
28	NC_012119	ACATTT	3	526969	526986	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	22436563
29	NC_012119	CCTTCG	3	548324	548341	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	5 %	22436563
30	NC_012119	TCACTT	3	578037	578055	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	22436563
31	NC_012119	TTCTCT	4	587215	587238	24	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	22436563
32	NC_012119	TTTTTC	3	601058	601075	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	22436563
33	NC_012119	TCTTTC	3	604983	605000	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	22436563
34	NC_012119	TATTTA	3	626530	626547	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	22436563
35	NC_012119	AGAGGA	3	627389	627406	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	22436563
36	NC_012119	TTCTTT	3	630532	630550	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	22436563
37	NC_012119	GATAAA	3	659849	659866	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	22436563
38	NC_012119	TGTAAC	3	676084	676101	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22436563
39	NC_012119	AAAGAG	3	693495	693513	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	22436563
40	NC_012119	CAGATT	3	747062	747079	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22436563
41	NC_012119	CCTCCC	3	754434	754451	18	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	5 %	22436563
42	NC_012119	TCTTTC	3	770342	770358	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	22436563

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Vitis vinifera mitochondrion