ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Carica papaya mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_012116GTA43513611133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %22402095
2NC_012116CTT411911202120 %66.67 %0 %33.33 %8 %22402095
3NC_012116CTT416551667130 %66.67 %0 %33.33 %7 %22402095
4NC_012116AGG4396739781233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
5NC_012116ACA4819982101266.67 %0 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
6NC_012116GTC41432214333120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %25716502
7NC_012116ATA420203202141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
8NC_012116AGA420564205741166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
9NC_012116CTT42609626107120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
10NC_012116AGC428242282541333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
11NC_012116TCT52920429218150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
12NC_012116GTG43341633427120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
13NC_012116ATC433718337291233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_012116GCT43379933809110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
15NC_012116AGG540566405801533.33 %0 %66.67 %0 %6 %25403361
16NC_012116TTG44234442355120 %66.67 %33.33 %0 %8 %25403361
17NC_012116CAA442654426661366.67 %0 %0 %33.33 %7 %25403361
18NC_012116TCC44268342694120 %33.33 %0 %66.67 %8 %25403361
19NC_012116CCT44273442745120 %33.33 %0 %66.67 %8 %25403361
20NC_012116CTT44428644297120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
21NC_012116GAG449620496321333.33 %0 %66.67 %0 %7 %25403361
22NC_012116CAA450056500671266.67 %0 %0 %33.33 %8 %25403361
23NC_012116CTC45055250564130 %33.33 %0 %66.67 %7 %25403361
24NC_012116AAG454762547721166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
25NC_012116AGA460575605861266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
26NC_012116GAT461776617871233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %25403361
27NC_012116TTC46328863299120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
28NC_012116AGG465316653271233.33 %0 %66.67 %0 %8 %25403361
29NC_012116CTT56684666860150 %66.67 %0 %33.33 %6 %25403361
30NC_012116AGA467429674411366.67 %0 %33.33 %0 %7 %25403361
31NC_012116AAG468134681441166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
32NC_012116CTT57102071035160 %66.67 %0 %33.33 %6 %25403361
33NC_012116AGA475356753671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
34NC_012116CCT47632876339120 %33.33 %0 %66.67 %8 %25403361
35NC_012116CTT48152181532120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
36NC_012116TCT48181681827120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
37NC_012116CTT48261282622110 %66.67 %0 %33.33 %9 %25403361
38NC_012116TTA484281842911133.33 %66.67 %0 %0 %9 %25403361
39NC_012116AAC484674846861366.67 %0 %0 %33.33 %7 %25403361
40NC_012116TCT48544285454130 %66.67 %0 %33.33 %7 %25403361
41NC_012116AGA585977859901466.67 %0 %33.33 %0 %7 %25403361
42NC_012116CTT48855688567120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
43NC_012116CAG489714897261333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %25403361
44NC_012116TCT49269392704120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
45NC_012116TCT49317893188110 %66.67 %0 %33.33 %9 %25403361
46NC_012116CTG49412294132110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %25403361
47NC_012116CTT49527995291130 %66.67 %0 %33.33 %7 %25403361
48NC_012116GAG41010441010561333.33 %0 %66.67 %0 %7 %25403361
49NC_012116AGT41071861071971233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %25403361
50NC_012116GAA41075611075711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
51NC_012116AGA41105191105301266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
52NC_012116TAA41135271135381266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34664264
53NC_012116AGA41146311146421266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
54NC_012116CTA41174941175051233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34664264
55NC_012116TAT41185651185761233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34664264
56NC_012116TAA41189681189791266.67 %33.33 %0 %0 %8 %34664264
57NC_012116AGG41258511258611133.33 %0 %66.67 %0 %9 %34664264
58NC_012116AGA41264671264781266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
59NC_012116TCT4128315128326120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34664264
60NC_012116AGG41332481332601333.33 %0 %66.67 %0 %7 %34664264
61NC_012116AGA41400601400701166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34664264
62NC_012116AAG41418461418571266.67 %0 %33.33 %0 %0 %34664264
63NC_012116TCT4141953141964120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34664264
64NC_012116AGC41426031426141233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34664264
65NC_012116AAG41452561452671266.67 %0 %33.33 %0 %0 %34664264
66NC_012116GTG4151248151258110 %33.33 %66.67 %0 %9 %34664264
67NC_012116GTT4151632151643120 %66.67 %33.33 %0 %8 %34664264
68NC_012116TAA41526551526651166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34664264
69NC_012116AAG41546131546231166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34664264
70NC_012116GAA51586301586441566.67 %0 %33.33 %0 %6 %34664264
71NC_012116CAA41630511630611166.67 %0 %0 %33.33 %9 %34664264
72NC_012116CAG41651951652061233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34664264
73NC_012116TCT4167262167272110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34664264
74NC_012116GGA41689791689891133.33 %0 %66.67 %0 %9 %34664264
75NC_012116TGT4169425169435110 %66.67 %33.33 %0 %9 %34664264
76NC_012116TCT4170492170502110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34664264
77NC_012116TGC4171031171042120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34664264
78NC_012116CAT41773231773331133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34664264
79NC_012116TTC4181880181890110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34664264
80NC_012116AAG41819651819751166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34664264
81NC_012116AGA41867191867301266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
82NC_012116CTA41923391923501233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34664264
83NC_012116TCT4193191193201110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34664264
84NC_012116CGT4196464196475120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34664264
85NC_012116GTT4196841196851110 %66.67 %33.33 %0 %9 %34664264
86NC_012116TGC4199995200006120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34664264
87NC_012116AGA42005962006071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
88NC_012116CGG4202013202024120 %0 %66.67 %33.33 %8 %34664264
89NC_012116TGT4204409204420120 %66.67 %33.33 %0 %8 %34664264
90NC_012116TAC42047702047801133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34664264
91NC_012116AAG42049022049131266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
92NC_012116ATC52075182075311433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %34664264
93NC_012116ATC42103172103271133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %34664264
94NC_012116TTA42106362106471233.33 %66.67 %0 %0 %8 %34664264
95NC_012116CTG4210972210983120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34664264
96NC_012116CTT4217949217959110 %66.67 %0 %33.33 %9 %34664264
97NC_012116ACT42192092192201233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34664264
98NC_012116ACC42198122198241333.33 %0 %0 %66.67 %7 %34664264
99NC_012116ATA42209072209171166.67 %33.33 %0 %0 %9 %34664264
100NC_012116AGC42228502228611233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %34664264
101NC_012116AAC42306572306681266.67 %0 %0 %33.33 %8 %34664264
102NC_012116CTT4231361231372120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34664264
103NC_012116GTC4231555231566120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34664264
104NC_012116ACT42345782345891233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %34664264
105NC_012116TAT62353692353851733.33 %66.67 %0 %0 %5 %34664264
106NC_012116CTG4235893235904120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %34664264
107NC_012116GAG42360082360181133.33 %0 %66.67 %0 %9 %34664264
108NC_012116GAA42373862373971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
109NC_012116TCT4242977242988120 %66.67 %0 %33.33 %8 %34664264
110NC_012116GTA42433802433901133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %34664264
111NC_012116AGA42446982447091266.67 %0 %33.33 %0 %8 %34664264
112NC_012116GAA42467012467111166.67 %0 %33.33 %0 %9 %34664264
113NC_012116CAC42529982530081133.33 %0 %0 %66.67 %9 %25403361
114NC_012116TAA42547652547761266.67 %33.33 %0 %0 %8 %25403361
115NC_012116AGA42593442593541166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
116NC_012116AGG52631202631341533.33 %0 %66.67 %0 %6 %25403361
117NC_012116ACC42634802634911233.33 %0 %0 %66.67 %8 %25403361
118NC_012116TCT4263676263686110 %66.67 %0 %33.33 %9 %25403361
119NC_012116GCC4266683266693110 %0 %33.33 %66.67 %9 %25403361
120NC_012116TAT42680382680501333.33 %66.67 %0 %0 %7 %25403361
121NC_012116CGA42681982682091233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %25403361
122NC_012116AGA42683142683261366.67 %0 %33.33 %0 %7 %25403361
123NC_012116AAC42689442689551266.67 %0 %0 %33.33 %8 %25403361
124NC_012116CTT4273809273821130 %66.67 %0 %33.33 %7 %25403361
125NC_012116TAC42740152740261233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %25403361
126NC_012116AGA42741512741611166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
127NC_012116CTT4277473277484120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
128NC_012116AAG42782822782931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
129NC_012116AGA42798962799071266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
130NC_012116GAA42800562800671266.67 %0 %33.33 %0 %0 %25403361
131NC_012116TAA42809592809691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %25403361
132NC_012116GAA42818832818941266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
133NC_012116TCA42834532834641233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %25403361
134NC_012116AGA42839832839931166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
135NC_012116AAG42843392843501266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
136NC_012116TTA42850402850511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %25403361
137NC_012116CTG4285323285333110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %25403361
138NC_012116AGA52874772874901466.67 %0 %33.33 %0 %7 %25403361
139NC_012116CTT4287988287999120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
140NC_012116CAT42908792908891133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %25403361
141NC_012116ACC42942402942501133.33 %0 %0 %66.67 %9 %25403361
142NC_012116AGA42942552942651166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
143NC_012116CTT5295954295968150 %66.67 %0 %33.33 %6 %25403361
144NC_012116GAA42961222961321166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
145NC_012116ATC43048753048861233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %25403361
146NC_012116AGA43116833116941266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
147NC_012116CTT4311758311769120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
148NC_012116AGA43191753191851166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
149NC_012116AGA43193053193161266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
150NC_012116ATC43232003232101133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %25403361
151NC_012116AAG43278333278441266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
152NC_012116AGC43295773295871133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %25403361
153NC_012116TCA43365823365931233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %25403361
154NC_012116ATT43407823407931233.33 %66.67 %0 %0 %8 %25403361
155NC_012116TTA43427743427851233.33 %66.67 %0 %0 %8 %25403361
156NC_012116GCT4346788346798110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %25403361
157NC_012116CAT43479763479861133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %25403361
158NC_012116AAC63512773512931766.67 %0 %0 %33.33 %5 %25403361
159NC_012116TGC4351739351750120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %25403361
160NC_012116GGT4352522352534130 %33.33 %66.67 %0 %7 %25403361
161NC_012116CTA43530423530531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %25403361
162NC_012116TCC4353310353320110 %33.33 %0 %66.67 %9 %25403361
163NC_012116CAT43549033549131133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %25403361
164NC_012116GCC4354993355004120 %0 %33.33 %66.67 %8 %25403361
165NC_012116GAA43555563555661166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
166NC_012116AAG43578483578591266.67 %0 %33.33 %0 %8 %25403361
167NC_012116GCC4359770359781120 %0 %33.33 %66.67 %8 %25403361
168NC_012116CAC43637223637321133.33 %0 %0 %66.67 %9 %25403361
169NC_012116TAC43673143673251233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %25403361
170NC_012116CTT4368584368595120 %66.67 %0 %33.33 %8 %25403361
171NC_012116GAT43690523690621133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %25403361
172NC_012116GAT43704253704351133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %25403361
173NC_012116AGA43741353741451166.67 %0 %33.33 %0 %9 %25403361
174NC_012116GAA43764223764341366.67 %0 %33.33 %0 %7 %25403361
175NC_012116TCA43883363883471233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
176NC_012116TTC4388900388911120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
177NC_012116GGA43925163925271233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
178NC_012116AAG53926543926691666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
179NC_012116CTT4394463394473110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
180NC_012116TCT4398926398936110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
181NC_012116CTT4400050400061120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
182NC_012116CTT4402051402061110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
183NC_012116TCC4408993409004120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
184NC_012116GAT44105864105981333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
185NC_012116TCT4412173412183110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
186NC_012116CTC4414014414025120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
187NC_012116CTT4414544414554110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
188NC_012116AGC44165474165581233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
189NC_012116GAA44202584202691266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
190NC_012116TTA44218374218471133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
191NC_012116CTT4426343426354120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
192NC_012116AGC44293924294041333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
193NC_012116CTT4436501436511110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
194NC_012116CTT4436537436547110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
195NC_012116GAA44371124371241366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
196NC_012116TTC4438368438379120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
197NC_012116TCC4438448438458110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
198NC_012116TCT4439192439204130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
199NC_012116GAA44412234412331166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
200NC_012116CTT4441653441663110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
201NC_012116TGA44418464418561133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
202NC_012116TTA44487054487161233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
203NC_012116CTC4448865448876120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
204NC_012116TGC4449065449075110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
205NC_012116CAG44502504502601133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
206NC_012116CTT4450706450717120 %66.67 %0 %33.33 %0 %22402098
207NC_012116AAG44528594528691166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
208NC_012116AGT44534284534391233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
209NC_012116GTA44534704534811233.33 %33.33 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
210NC_012116GAC44581274581371133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
211NC_012116AGA44604904605001166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
212NC_012116CGA44605874605981233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
213NC_012116CTT4463515463525110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
214NC_012116TCT5464229464243150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
215NC_012116ACT44662944663051233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
216NC_012116ACC44668974669091333.33 %0 %0 %66.67 %7 %22402098
217NC_012116ATA44679924680021166.67 %33.33 %0 %0 %9 %22402098
218NC_012116AGC44699354699461233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding