ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Carica papaya mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012116	TA	6	1705	1716	12	50 %	50 %	0 %	0 %	22402095
2	NC_012116	G	12	2312	2323	12	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012116	TCTT	3	7292	7303	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012116	ACA	4	8199	8210	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012116	AGAT	3	19453	19464	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012116	T	12	26004	26015	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012116	ATAG	3	31124	31135	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012116	TTCT	3	34760	34771	12	0 %	75 %	0 %	25 %	25403361
9	NC_012116	CTAGT	3	37063	37077	15	20 %	40 %	20 %	20 %	25403361
10	NC_012116	AATG	3	37327	37338	12	50 %	25 %	25 %	0 %	25403361
11	NC_012116	AC	6	40124	40135	12	50 %	0 %	0 %	50 %	25403361
12	NC_012116	CTTT	3	54392	54403	12	0 %	75 %	0 %	25 %	25403361
13	NC_012116	AGAA	3	60694	60705	12	75 %	0 %	25 %	0 %	25403361
14	NC_012116	CTT	4	71020	71031	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25403361
15	NC_012116	TGAC	3	73303	73314	12	25 %	25 %	25 %	25 %	25403361
16	NC_012116	GCCG	3	80373	80384	12	0 %	0 %	50 %	50 %	25403361
17	NC_012116	AGA	4	85977	85988	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25403361
18	NC_012116	AGAA	3	102894	102905	12	75 %	0 %	25 %	0 %	25403361
19	NC_012116	GAAG	3	106252	106263	12	50 %	0 %	50 %	0 %	25403361
20	NC_012116	TCTT	3	107933	107944	12	0 %	75 %	0 %	25 %	25403361
21	NC_012116	AT	7	111339	111352	14	50 %	50 %	0 %	0 %	25403361
22	NC_012116	CTAGG	3	113061	113075	15	20 %	20 %	40 %	20 %	34664264
23	NC_012116	TTATA	3	114784	114798	15	40 %	60 %	0 %	0 %	34664264
24	NC_012116	AT	7	127575	127588	14	50 %	50 %	0 %	0 %	34664264
25	NC_012116	CTAG	3	135820	135831	12	25 %	25 %	25 %	25 %	34664264
26	NC_012116	AAG	4	141846	141857	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34664264
27	NC_012116	AAG	4	145256	145267	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	34664264
28	NC_012116	GTAAT	3	151097	151111	15	40 %	40 %	20 %	0 %	34664264
29	NC_012116	GGTC	3	164557	164568	12	0 %	25 %	50 %	25 %	34664264
30	NC_012116	G	12	166366	166377	12	0 %	0 %	100 %	0 %	34664264
31	NC_012116	GAAT	3	166528	166539	12	50 %	25 %	25 %	0 %	34664264
32	NC_012116	CTTT	3	166754	166765	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34664264
33	NC_012116	TCTT	3	166955	166966	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34664264
34	NC_012116	GACT	3	176768	176779	12	25 %	25 %	25 %	25 %	34664264
35	NC_012116	CTGACT	3	176774	176791	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	34664264
36	NC_012116	ACTC	3	180335	180346	12	25 %	25 %	0 %	50 %	34664264
37	NC_012116	CAAG	3	185340	185351	12	50 %	0 %	25 %	25 %	34664264
38	NC_012116	A	12	190414	190425	12	100 %	0 %	0 %	0 %	34664264
39	NC_012116	ATTC	3	201963	201974	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34664264
40	NC_012116	AT	8	204028	204043	16	50 %	50 %	0 %	0 %	34664264
41	NC_012116	ACCG	3	210342	210353	12	25 %	0 %	25 %	50 %	34664264
42	NC_012116	TCAT	3	211370	211381	12	25 %	50 %	0 %	25 %	34664264
43	NC_012116	TTTC	3	228991	229002	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34664264
44	NC_012116	TA	6	229176	229187	12	50 %	50 %	0 %	0 %	34664264
45	NC_012116	CTACA	3	230861	230875	15	40 %	20 %	0 %	40 %	34664264
46	NC_012116	TTCT	3	233433	233444	12	0 %	75 %	0 %	25 %	34664264
47	NC_012116	TAT	5	235369	235383	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	34664264
48	NC_012116	AG	6	240546	240557	12	50 %	0 %	50 %	0 %	34664264
49	NC_012116	TGAA	3	248521	248532	12	50 %	25 %	25 %	0 %	25403361
50	NC_012116	GACT	3	262387	262398	12	25 %	25 %	25 %	25 %	25403361
51	NC_012116	CATT	3	268172	268183	12	25 %	50 %	0 %	25 %	25403361
52	NC_012116	TTCC	3	276845	276856	12	0 %	50 %	0 %	50 %	25403361
53	NC_012116	GAA	4	280056	280067	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25403361
54	NC_012116	CT	7	285176	285189	14	0 %	50 %	0 %	50 %	25403361
55	NC_012116	AGA	4	287477	287488	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	25403361
56	NC_012116	CTT	4	295957	295968	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	25403361
57	NC_012116	T	13	316637	316649	13	0 %	100 %	0 %	0 %	25403361
58	NC_012116	AT	6	319986	319997	12	50 %	50 %	0 %	0 %	25403361
59	NC_012116	AGAA	3	326664	326675	12	75 %	0 %	25 %	0 %	25403361
60	NC_012116	AGTG	3	327355	327366	12	25 %	25 %	50 %	0 %	25403361
61	NC_012116	GCTT	3	328634	328645	12	0 %	50 %	25 %	25 %	25403361
62	NC_012116	AGCA	3	330135	330146	12	50 %	0 %	25 %	25 %	25403361
63	NC_012116	AAGA	3	344830	344841	12	75 %	0 %	25 %	0 %	25403361
64	NC_012116	CCCG	3	346726	346737	12	0 %	0 %	25 %	75 %	25403361
65	NC_012116	AAC	4	351277	351288	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	25403361
66	NC_012116	AG	7	352974	352987	14	50 %	0 %	50 %	0 %	25403361
67	NC_012116	AT	6	357507	357518	12	50 %	50 %	0 %	0 %	25403361
68	NC_012116	ATCT	3	358134	358145	12	25 %	50 %	0 %	25 %	25403361
69	NC_012116	CTTT	3	363966	363977	12	0 %	75 %	0 %	25 %	25403361
70	NC_012116	TTAA	3	366655	366666	12	50 %	50 %	0 %	0 %	25403361
71	NC_012116	AAGG	3	382358	382369	12	50 %	0 %	50 %	0 %	25403361
72	NC_012116	TTTC	3	387772	387783	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012116	CATA	3	389804	389815	12	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012116	AT	6	400623	400634	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012116	CAAC	3	400669	400680	12	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012116	AGTGAA	3	401577	401594	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012116	AAGC	3	406730	406741	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012116	CTAGA	3	443848	443862	15	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012116	TTCA	3	446030	446041	12	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012116	GAAGC	3	446624	446638	15	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012116	CTT	4	450706	450717	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22402098
82	NC_012116	GTA	4	453470	453481	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012116	TCT	4	464229	464240	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012116	TTTC	3	476076	476087	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012116	TA	6	476261	476272	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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All Perfect Repeats of Carica papaya mitochondrion