ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Carica papaya mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012116	TA	8	1705	1719	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	22402095
2	NC_012116	AG	6	8596	8606	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_012116	CT	6	21313	21323	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_012116	AG	6	25935	25945	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_012116	GA	6	26590	26600	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_012116	CT	6	29092	29102	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
7	NC_012116	GA	6	30625	30636	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_012116	AC	7	40124	40137	14	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	25403361
9	NC_012116	TC	6	47004	47014	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
10	NC_012116	TC	6	47141	47152	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	25403361
11	NC_012116	GA	6	49059	49070	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	25403361
12	NC_012116	AG	8	50890	50904	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	25403361
13	NC_012116	TA	6	52969	52980	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25403361
14	NC_012116	CT	6	55047	55057	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
15	NC_012116	AG	6	60519	60529	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	25403361
16	NC_012116	TC	6	101961	101971	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
17	NC_012116	AG	6	109801	109812	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	25403361
18	NC_012116	AT	8	111339	111354	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	25403361
19	NC_012116	AG	6	113977	113988	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	34664264
20	NC_012116	TA	7	124352	124364	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	34664264
21	NC_012116	TC	6	126512	126522	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34664264
22	NC_012116	AT	11	127572	127592	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	34664264
23	NC_012116	AG	7	146611	146625	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	34664264
24	NC_012116	TA	6	159567	159578	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34664264
25	NC_012116	CT	6	163423	163433	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34664264
26	NC_012116	CG	6	165016	165027	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	34664264
27	NC_012116	AG	6	189658	189668	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34664264
28	NC_012116	AT	9	204028	204045	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	34664264
29	NC_012116	GA	6	208293	208303	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34664264
30	NC_012116	AG	6	211767	211777	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	34664264
31	NC_012116	TA	6	213639	213650	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	34664264
32	NC_012116	CT	6	228577	228587	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34664264
33	NC_012116	TA	8	229176	229190	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	34664264
34	NC_012116	AG	6	240546	240559	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	34664264
35	NC_012116	TC	6	246069	246079	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	34664264
36	NC_012116	CT	6	256752	256762	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
37	NC_012116	CT	6	258933	258943	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
38	NC_012116	TA	6	259144	259154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25403361
39	NC_012116	TA	6	262909	262919	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25403361
40	NC_012116	AT	6	275340	275351	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25403361
41	NC_012116	AT	7	277554	277566	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25403361
42	NC_012116	CT	8	285176	285190	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	25403361
43	NC_012116	AG	6	295791	295801	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	25403361
44	NC_012116	TG	6	297571	297581	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	25403361
45	NC_012116	AG	6	300940	300951	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	25403361
46	NC_012116	GA	6	301384	301394	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	25403361
47	NC_012116	GA	6	311079	311089	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	25403361
48	NC_012116	AG	7	311546	311558	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	25403361
49	NC_012116	TA	13	319973	319998	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25403361
50	NC_012116	AT	12	319986	320008	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25403361
51	NC_012116	TA	6	352068	352078	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25403361
52	NC_012116	AG	8	352974	352989	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	25403361
53	NC_012116	AT	8	357507	357521	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	25403361
54	NC_012116	AT	6	359327	359338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	25403361
55	NC_012116	CT	6	361300	361310	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
56	NC_012116	TC	6	364550	364560	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	25403361
57	NC_012116	GA	6	373877	373887	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	25403361
58	NC_012116	TA	6	378713	378723	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	25403361
59	NC_012116	TA	6	383768	383779	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_012116	AT	6	388057	388067	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_012116	CT	6	396016	396026	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
62	NC_012116	TC	6	400203	400216	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
63	NC_012116	AT	7	400623	400636	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_012116	CT	6	403514	403524	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_012116	TC	8	409413	409428	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
66	NC_012116	TC	6	432784	432794	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
67	NC_012116	AT	6	436313	436324	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_012116	CT	6	437990	438001	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
69	NC_012116	GA	6	445810	445821	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_012116	TA	6	465513	465523	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_012116	CT	6	475662	475672	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
72	NC_012116	TA	8	476261	476275	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Carica papaya mitochondrion