Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Monomastix sp. OKE-1 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_012101TATT33363471225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_012101AAG49469571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
3NC_012101AC6331733271150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
4NC_012101TTTC362226232110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
5NC_012101CCCT368006810110 %25 %0 %75 %9 %Non-Coding
6NC_012101CAC4784878581133.33 %0 %0 %66.67 %9 %224179472
7NC_012101TGC481738184120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %224179472
8NC_012101AAC4822882391266.67 %0 %0 %33.33 %8 %224179472
9NC_012101TTTG394359446120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
10NC_012101TAT413260132701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
11NC_012101CTT41415614166110 %66.67 %0 %33.33 %9 %224179475
12NC_012101CTA414366143771233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %224179475
13NC_012101T141619216205140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_012101AAAG318838188481175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
15NC_012101CTTT32014520157130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
16NC_012101GCT42057320584120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %224179477
17NC_012101TCT42128021291120 %66.67 %0 %33.33 %8 %224179477
18NC_012101C122190321914120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
19NC_012101AGGG323245232551125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
20NC_012101CTC42327023280110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
21NC_012101TTTC32400324013110 %75 %0 %25 %9 %224179479
22NC_012101ACA424786247971266.67 %0 %0 %33.33 %8 %224179479
23NC_012101TCTT32540225413120 %75 %0 %25 %8 %224179479
24NC_012101AGGG327661276711125 %0 %75 %0 %9 %224179531
25NC_012101CTT43025930270120 %66.67 %0 %33.33 %8 %224179480
26NC_012101TCT43048330494120 %66.67 %0 %33.33 %8 %224179480
27NC_012101CTTA332120321301125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
28NC_012101AATA335333353441275 %25 %0 %0 %8 %224179481
29NC_012101ATT435554355651233.33 %66.67 %0 %0 %8 %224179481
30NC_012101AACC335655356661250 %0 %0 %50 %8 %224179481
31NC_012101TAA437344373541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %224179481
32NC_012101ATT438495385061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %224179481
33NC_012101TTGTTT34004840065180 %83.33 %16.67 %0 %5 %224179482
34NC_012101AT740214402271450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
35NC_012101CTTT34041540426120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
36NC_012101CTT44160341614120 %66.67 %0 %33.33 %8 %224179483
37NC_012101GTTT34261342625130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
38NC_012101TTTA342649426591125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
39NC_012101TA643036430471250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
40NC_012101TGATTA343614436311833.33 %50 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
41NC_012101TCT44565845668110 %66.67 %0 %33.33 %9 %224179486
42NC_012101TTTA346182461921125 %75 %0 %0 %9 %224179533
43NC_012101AG746218462301350 %0 %50 %0 %7 %224179533
44NC_012101AAT447107471181266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_012101TTTA347956479671225 %75 %0 %0 %8 %224179488
46NC_012101AAGT348090481001150 %25 %25 %0 %9 %224179488
47NC_012101AAT448398484091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %224179488
48NC_012101AGA449368493791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
49NC_012101TTG45060550616120 %66.67 %33.33 %0 %8 %224179490
50NC_012101TTAA352263522731150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
51NC_012101TTCA352341523511125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
52NC_012101T135299653008130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
53NC_012101CTT45382353835130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
54NC_012101CAAA354098541081175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
55NC_012101ACAA356191562021275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
56NC_012101ACCG356297563071125 %0 %25 %50 %9 %Non-Coding
57NC_012101TCCCCC35781157829190 %16.67 %0 %83.33 %10 %224179525
58NC_012101TTTG35866558675110 %75 %25 %0 %9 %224179525
59NC_012101TTCT35891058921120 %75 %0 %25 %8 %224179525
60NC_012101CTTC35916259173120 %50 %0 %50 %8 %224179525
61NC_012101AAAC361418614291275 %0 %0 %25 %8 %224179494
62NC_012101GAA461495615061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %224179494
63NC_012101GAA463027630381266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
64NC_012101TAA463706637161166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
65NC_012101GAAC363725637351150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
66NC_012101TTTA464057640721625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
67NC_012101TTTC36449964509110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
68NC_012101TCAC365124651351225 %25 %0 %50 %8 %224179495
69NC_012101TTTA365677656871125 %75 %0 %0 %9 %224179496
70NC_012101CTTA366567665771125 %50 %0 %25 %9 %224179497
71NC_012101TTCT37059070600110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
72NC_012101AAG471820718311266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
73NC_012101TAAA372907729171175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_012101CAAA373788737981175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
75NC_012101ATAA374438744491275 %25 %0 %0 %0 %224179504
76NC_012101GTTT37466674676110 %75 %25 %0 %9 %224179504
77NC_012101TAA475967759771166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_012101TTTA376801768121225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_012101CAAA378215782251175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
80NC_012101ATTT378523785331125 %75 %0 %0 %9 %224179508
81NC_012101AAC478874788851266.67 %0 %0 %33.33 %8 %224179509
82NC_012101AAGTA380227802411560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
83NC_012101AAAG381879818901275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
84NC_012101GAAA382124821341175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
85NC_012101TAAG382661826721250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
86NC_012101GAAA383134831451275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
87NC_012101AGAA384303843141275 %0 %25 %0 %8 %224179512
88NC_012101AGAAA385458854721580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
89NC_012101AAAT386414864241175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_012101AGA487263872741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %224179515
91NC_012101AAAT388628886381175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
92NC_012101AAG488768887791266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
93NC_012101ATG489401894121233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %224179516
94NC_012101TTAAA390553905671560 %40 %0 %0 %6 %224179517
95NC_012101TAAA394163941731175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
96NC_012101CAAA398718987291275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
97NC_012101AGA61007321007481766.67 %0 %33.33 %0 %5 %224179530
98NC_012101GCTTGC3101103101119170 %33.33 %33.33 %33.33 %5 %224179530
99NC_012101AAAT31013081013191275 %25 %0 %0 %8 %224179530
100NC_012101GAA41017731017841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %224179530
101NC_012101TAA41022241022361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
102NC_012101TAA41024191024311366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
103NC_012101TCT4102902102912110 %66.67 %0 %33.33 %9 %224179539
104NC_012101TCT4103485103496120 %66.67 %0 %33.33 %8 %224179539
105NC_012101ATTTT31051671051821620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
106NC_012101AGCG31081491081591125 %0 %50 %25 %9 %Non-Coding
107NC_012101TTAAA31102021102161560 %40 %0 %0 %6 %224179541
108NC_012101GTG4111059111070120 %33.33 %66.67 %0 %8 %224179542
109NC_012101TTTC3112905112915110 %75 %0 %25 %9 %224179543