ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pyramimonas parkeae chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012099	TCT	4	393	403	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	224178060
2	NC_012099	TTA	4	1186	1197	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_012099	CCA	4	1613	1624	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
4	NC_012099	ATA	4	1785	1795	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_012099	AGA	5	3883	3896	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	224178107
6	NC_012099	GAT	4	5134	5145	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	224178107
7	NC_012099	TGG	4	5534	5545	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_012099	CCT	4	10386	10398	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	224178071
9	NC_012099	AAT	4	10785	10796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224178061
10	NC_012099	TTA	4	12221	12232	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_012099	TTA	4	13825	13836	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_012099	TTC	4	14818	14829	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
13	NC_012099	TAA	4	15273	15283	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	224178102
14	NC_012099	TGT	4	16515	16526	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	224178075
15	NC_012099	TAA	4	20338	20349	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_012099	TAA	4	22638	22649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224178076
17	NC_012099	CAC	4	24815	24826	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	224178078
18	NC_012099	CTA	4	24905	24915	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	224178078
19	NC_012099	GAA	4	26650	26661	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	224178074
20	NC_012099	GGT	4	28208	28219	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	224178028
21	NC_012099	TAT	4	31254	31266	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	224178028
22	NC_012099	AGA	4	32229	32240	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	224178029
23	NC_012099	CAG	5	32516	32530	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	224178062
24	NC_012099	TGA	4	36008	36019	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	224178034
25	NC_012099	TAA	4	36682	36693	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_012099	TCT	4	39596	39606	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	224178055
27	NC_012099	TGT	4	42400	42411	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	224178090
28	NC_012099	TTC	4	45309	45320	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224178050
29	NC_012099	CAA	4	46594	46605	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	224178027
30	NC_012099	CTT	4	48078	48089	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224178030
31	NC_012099	TTC	4	50351	50362	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224178035
32	NC_012099	GTT	4	51511	51521	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	224178049
33	NC_012099	CTT	5	52979	52992	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	224178088
34	NC_012099	TTC	4	59277	59288	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224178086
35	NC_012099	TTC	4	60078	60089	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224178086
36	NC_012099	TAT	4	60299	60310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	224178086
37	NC_012099	TTA	4	60964	60976	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_012099	AAT	4	79387	79398	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224178101
39	NC_012099	ATG	4	82065	82076	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	224178047
40	NC_012099	GTT	4	83145	83156	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224178040
41	NC_012099	ATG	4	85436	85446	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	224178045
42	NC_012099	TTC	4	86843	86854	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224178046
43	NC_012099	TGT	4	86865	86876	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	224178046
44	NC_012099	TAT	4	87281	87293	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	224178033
45	NC_012099	TAT	4	88132	88142	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012099	CTG	4	99278	99289	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	224178036

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pyramimonas parkeae chloroplast