ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pycnococcus provasolii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012097	TCCTT	3	105	118	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012097	AGCG	3	474	484	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
3	NC_012097	CCGA	3	1000	1012	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
4	NC_012097	CGGA	3	1711	1721	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
5	NC_012097	TCTT	4	5966	5981	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
6	NC_012097	TC	6	6253	6264	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
7	NC_012097	GCGA	3	6755	6765	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	224179462
8	NC_012097	ACTTA	3	8507	8522	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	224179449
9	NC_012097	TGTT	3	8629	8640	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	224179449
10	NC_012097	TTTGG	3	8814	8828	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	224179449
11	NC_012097	CCA	5	9339	9353	15	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	6 %	224179449
12	NC_012097	GTAA	3	11767	11777	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	224179449
13	NC_012097	AAGT	3	11843	11854	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	224179449
14	NC_012097	GTTT	3	12337	12348	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	224179449
15	NC_012097	GTAA	3	14071	14083	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	224179448
16	NC_012097	ATTT	3	18394	18406	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_012097	CAG	4	18766	18776	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	224179401
18	NC_012097	TA	6	19310	19320	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	224179401
19	NC_012097	ATCTC	3	20786	20799	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	224179401
20	NC_012097	GTAA	3	22348	22359	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	224179401
21	NC_012097	CTA	4	23287	23298	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	224179407
22	NC_012097	TCGC	3	24468	24479	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	224179429
23	NC_012097	CAC	4	25846	25857	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	224179414
24	NC_012097	ACA	4	26034	26045	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	224179414
25	NC_012097	TCTT	3	27874	27884	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_012097	TAG	4	28802	28813	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	224179405
27	NC_012097	TAGCT	3	29819	29832	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	224179403
28	NC_012097	TGG	4	31011	31022	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	224179400
29	NC_012097	AAG	4	33532	33542	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_012097	ATA	4	35071	35082	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_012097	TGT	4	35846	35857	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	224179411
32	NC_012097	CTT	4	35973	35983	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	224179411
33	NC_012097	TGA	4	39073	39084	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	224179461
34	NC_012097	CAA	4	41212	41223	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	224179465
35	NC_012097	AAG	4	42274	42288	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	224179408
36	NC_012097	TC	6	44540	44550	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	224179464
37	NC_012097	TAT	4	45270	45282	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_012097	TGCG	3	45629	45639	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_012097	ACCA	3	47021	47031	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	224179412
40	NC_012097	TTTA	3	47346	47356	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	224179412
41	NC_012097	CAAT	3	47558	47569	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	224179412
42	NC_012097	CTCA	3	48721	48731	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	224179412
43	NC_012097	TTTA	3	51266	51276	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	224179412
44	NC_012097	TTAT	3	51381	51392	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	224179412
45	NC_012097	GAAA	3	51611	51621	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	224179412
46	NC_012097	GAA	4	52207	52217	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	224179412
47	NC_012097	GTTT	3	52352	52363	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	224179412
48	NC_012097	CGT	4	54365	54376	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224179444
49	NC_012097	GTG	4	54387	54398	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	224179444
50	NC_012097	TGG	4	55197	55208	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	224179442
51	NC_012097	AATT	3	58832	58843	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_012097	AATT	3	59636	59647	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	224179447
53	NC_012097	ACA	4	60125	60136	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	224179447
54	NC_012097	TTC	4	61713	61724	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224179426
55	NC_012097	TCT	4	62760	62771	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	224179426
56	NC_012097	AAT	4	62978	62989	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012097	CTT	4	63715	63725	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	224179460
58	NC_012097	TTAA	3	64702	64712	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_012097	CCAA	3	66152	66164	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	224179425
60	NC_012097	CTTT	3	67207	67218	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012097	AGA	5	67267	67281	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_012097	AAG	4	68404	68414	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	224179424
63	NC_012097	TTAT	3	68829	68840	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_012097	TAA	4	69626	69637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	224179457
65	NC_012097	TC	6	70433	70444	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
66	NC_012097	A	13	70558	70570	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_012097	TGG	4	71042	71053	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	224179420
68	NC_012097	TC	6	71443	71453	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	224179420
69	NC_012097	CAC	4	71536	71546	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	224179420
70	NC_012097	TTG	4	72193	72204	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	224179420
71	NC_012097	CT	6	74570	74580	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	224179421
72	NC_012097	ACTT	3	76088	76098	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
73	NC_012097	CGA	6	76766	76783	18	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	5 %	224179443
74	NC_012097	TGC	4	76812	76822	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	224179443
75	NC_012097	TAA	4	77110	77120	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_012097	GCT	4	78315	78326	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	224179455
77	NC_012097	GCCG	3	78643	78653	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
78	NC_012097	TAAAA	3	79989	80003	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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