Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Syntrichia ruralis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_012052TAA41631731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_012052TTA4359736081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
3NC_012052TAT4419742081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931039
4NC_012052ATT4421042211233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931039
5NC_012052AAT4423042421366.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931039
6NC_012052AAT4662966401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931044
7NC_012052TTA4788478951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931045
8NC_012052TAA4940194111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931046
9NC_012052TAA4944294531266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931046
10NC_012052AGA412574125851266.67 %0 %33.33 %0 %8 %223931051
11NC_012052ATT513706137191433.33 %66.67 %0 %0 %7 %223931051
12NC_012052GTT41588615896110 %66.67 %33.33 %0 %9 %223931113
13NC_012052ATA516351163651566.67 %33.33 %0 %0 %6 %223931113
14NC_012052ATT516376163901533.33 %66.67 %0 %0 %6 %223931113
15NC_012052ATA416901169131366.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931113
16NC_012052AAT422326223381366.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931113
17NC_012052TAA423497235081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
18NC_012052AGA428577285891366.67 %0 %33.33 %0 %7 %223931113
19NC_012052TTA431943319541233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
20NC_012052TTA432691327021233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
21NC_012052TAT433043330541233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
22NC_012052TAT733268332882133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
23NC_012052AAT536314363271466.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931113
24NC_012052CAT437277372871133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %223931113
25NC_012052ATG438781387911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %223931113
26NC_012052TAA540183401971566.67 %33.33 %0 %0 %6 %223931113
27NC_012052AAT441727417381266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
28NC_012052TAT442468424781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
29NC_012052AAT442690427011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
30NC_012052GCA442798428091233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %223931113
31NC_012052ATA544885448981466.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931113
32NC_012052ATA545440454541566.67 %33.33 %0 %0 %6 %223931113
33NC_012052AAT448279482901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
34NC_012052TAT749817498372133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
35NC_012052TTA450621506321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
36NC_012052AAT452806528171266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
37NC_012052TAA452972529831266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
38NC_012052TCT45353453544110 %66.67 %0 %33.33 %9 %223931113
39NC_012052CAG453798538091233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %223931113
40NC_012052ATA454284542981566.67 %33.33 %0 %0 %6 %223931113
41NC_012052TTA454680546911233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
42NC_012052TAA454956549671266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
43NC_012052ATA455276552871266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
44NC_012052ATT555357553701433.33 %66.67 %0 %0 %7 %223931113
45NC_012052TTA456912569241333.33 %66.67 %0 %0 %7 %223931113
46NC_012052TAA557185571981466.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931113
47NC_012052ATT458362583721133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
48NC_012052CTA458780587901133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %223931113
49NC_012052TAA459094591051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
50NC_012052TAT461534615451233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
51NC_012052AAT464360643701166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
52NC_012052ATA464431644421266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
53NC_012052TTA465717657271133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
54NC_012052TAT466980669911233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
55NC_012052TAT468784687941133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
56NC_012052TAT469324693381533.33 %66.67 %0 %0 %6 %223931113
57NC_012052TTA469449694601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
58NC_012052TAT469649696601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931113
59NC_012052TTA469837698471133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
60NC_012052TAA473548735581166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
61NC_012052ATA477952779621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
62NC_012052ATA779481795012166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
63NC_012052TAA479626796361166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
64NC_012052TAT479644796541133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
65NC_012052TTA479760797701133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931113
66NC_012052AAT480319803301266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
67NC_012052ATA480442804541366.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931113
68NC_012052ATA682191822071766.67 %33.33 %0 %0 %5 %223931113
69NC_012052TAA482275822851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
70NC_012052TAA483042830531266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931113
71NC_012052ATA483563835731166.67 %33.33 %0 %0 %9 %223931113
72NC_012052TCT48760487614110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
73NC_012052AGA495277952881266.67 %0 %33.33 %0 %8 %223931102
74NC_012052ATT496162961731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931102
75NC_012052TAT496668966781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
76NC_012052TAT497318973291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931100
77NC_012052TAA41005871005991366.67 %33.33 %0 %0 %7 %223931100
78NC_012052ATA41015621015761566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
79NC_012052ATT41032381032491233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_012052ATT61042551042721833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
81NC_012052ATT41056381056491233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
82NC_012052TAA41056801056901166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
83NC_012052TAT41065181065291233.33 %66.67 %0 %0 %8 %223931107
84NC_012052TAT51067561067691433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
85NC_012052ATT41075001075101133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931109
86NC_012052TAA41102771102881266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
87NC_012052TAA41106301106411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %223931112
88NC_012052TAT71125731125932133.33 %66.67 %0 %0 %9 %223931112