ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Syntrichia ruralis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012052	TA	13	7046	7071	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012052	AT	6	7947	7958	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931045
3	NC_012052	AT	7	9287	9301	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	223931046
4	NC_012052	TA	6	10651	10663	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_012052	TA	7	12371	12385	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_012052	AT	6	13669	13680	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931051
7	NC_012052	AT	19	15222	15257	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
8	NC_012052	AT	24	16734	16780	47	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
9	NC_012052	AT	9	16802	16819	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	223931113
10	NC_012052	AT	6	18166	18177	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
11	NC_012052	TA	6	22470	22481	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
12	NC_012052	AT	9	23519	23536	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	223931113
13	NC_012052	AT	12	23549	23572	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
14	NC_012052	AT	6	23704	23715	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
15	NC_012052	TA	6	29426	29437	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
16	NC_012052	TA	7	32758	32771	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	223931113
17	NC_012052	TA	6	33961	33972	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
18	NC_012052	AT	8	41875	41890	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	223931113
19	NC_012052	CT	6	42599	42609	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	223931113
20	NC_012052	AT	8	45578	45593	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	223931113
21	NC_012052	AT	6	50950	50961	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
22	NC_012052	TA	6	54636	54646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	223931113
23	NC_012052	AT	7	57154	57166	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	223931113
24	NC_012052	AT	11	59760	59780	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	223931113
25	NC_012052	AG	6	60266	60276	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	223931113
26	NC_012052	TA	6	65085	65096	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
27	NC_012052	TA	6	73721	73732	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
28	NC_012052	AT	6	73893	73904	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
29	NC_012052	TA	6	78318	78329	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
30	NC_012052	AT	6	78898	78908	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	223931113
31	NC_012052	AT	6	83171	83182	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	223931113
32	NC_012052	TA	7	104994	105007	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_012052	AT	6	105805	105815	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	223931106
34	NC_012052	TA	8	106679	106693	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_012052	TA	6	110255	110265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Syntrichia ruralis chloroplast