ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ephedra equisetina chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011954	TGA	4	4680	4691	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	222139872
2	NC_011954	TCT	4	7166	7176	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	222139874
3	NC_011954	GGA	4	7307	7318	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	222139874
4	NC_011954	GCA	4	8000	8011	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222139874
5	NC_011954	TAA	4	8652	8663	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011954	ATG	4	10727	10737	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	222139877
7	NC_011954	TAC	4	17364	17375	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_011954	AAC	4	20875	20885	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	222139883
9	NC_011954	AGA	4	24176	24186	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	222139885
10	NC_011954	GAA	5	30803	30817	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	222139889
11	NC_011954	GAA	4	32541	32552	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222139890
12	NC_011954	AAT	4	33198	33208	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_011954	AAT	4	43911	43923	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_011954	TGC	4	46098	46109	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222139908
15	NC_011954	ATT	4	57901	57911	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	222139909
16	NC_011954	TAT	4	59694	59705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	222139909
17	NC_011954	CCT	4	60076	60086	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	222139909
18	NC_011954	GAA	4	60276	60287	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222139909
19	NC_011954	ATA	7	65203	65223	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	222139909
20	NC_011954	AGA	4	65227	65239	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	222139909
21	NC_011954	ATC	4	65779	65789	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222139909
22	NC_011954	CGA	4	74380	74391	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222139909
23	NC_011954	AGA	4	79476	79487	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222139909
24	NC_011954	TAA	4	86059	86069	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	222139909
25	NC_011954	TCT	4	87515	87526	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	222139909
26	NC_011954	TCG	4	95770	95781	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222139909
27	NC_011954	AGA	4	100046	100056	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	222139909
28	NC_011954	GTA	4	100691	100702	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	222139909
29	NC_011954	TGA	4	104371	104381	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	222139940
30	NC_011954	TCT	4	104926	104936	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	222139940
31	NC_011954	TAT	7	104938	104958	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	222139940
32	NC_011954	ATC	4	105305	105315	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222139940

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ephedra equisetina chloroplast