ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gnetum parvifolium chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011942	AAAAG	3	173	187	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	222084135
2	NC_011942	TAG	4	896	907	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011942	T	13	1370	1382	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011942	CT	6	1537	1547	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011942	CTG	4	1645	1656	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222084137
6	NC_011942	AAGC	3	2139	2149	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	222084137
7	NC_011942	AG	6	2161	2172	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	222084137
8	NC_011942	T	18	4293	4310	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_011942	T	12	4375	4386	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011942	T	13	4389	4401	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011942	TA	21	4525	4566	42	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011942	TA	16	5078	5109	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_011942	T	12	5275	5286	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_011942	T	12	5331	5342	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011942	T	19	5450	5468	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_011942	GTTT	3	5472	5482	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_011942	T	18	5687	5704	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011942	AAG	4	8820	8831	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222084140
19	NC_011942	TTTG	3	9803	9814	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011942	A	15	10197	10211	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	222084141
21	NC_011942	TA	6	10532	10542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	222084141
22	NC_011942	CGAAA	3	10786	10799	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	222084141
23	NC_011942	ATGA	3	10861	10872	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	222084141
24	NC_011942	AT	6	11251	11261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	222084141
25	NC_011942	GATT	3	11520	11531	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	222084141
26	NC_011942	TCGAAT	3	13938	13955	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	222084141
27	NC_011942	TAA	5	14006	14020	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	222084141
28	NC_011942	AGA	4	14029	14041	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	222084141
29	NC_011942	AGA	7	16136	16156	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	4 %	222084141
30	NC_011942	AGA	5	16160	16174	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	222084141
31	NC_011942	AAAAAG	4	16181	16204	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	222084141
32	NC_011942	GTT	4	16684	16694	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_011942	CTTT	3	16895	16906	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011942	TGTT	3	17936	17946	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	222084142
35	NC_011942	TTTTG	3	18071	18084	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	222084142
36	NC_011942	TAC	4	18776	18787	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	222084200
37	NC_011942	TCT	4	19163	19175	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	222084200
38	NC_011942	GGTAG	3	22927	22940	14	20 %	20 %	60 %	0 %	7 %	222084200
39	NC_011942	GAGG	3	25136	25147	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	222084200
40	NC_011942	AGGT	3	25354	25365	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	222084200
41	NC_011942	CTGAT	3	26718	26731	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	222084200
42	NC_011942	CTTT	3	26900	26910	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	222084200
43	NC_011942	AACC	3	26946	26958	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	222084200
44	NC_011942	TA	7	29480	29493	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	222084200
45	NC_011942	CTTTTT	4	29722	29745	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	4 %	222084200
46	NC_011942	AAAG	3	29981	29991	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084200
47	NC_011942	CTGA	3	30973	30983	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	222084200
48	NC_011942	A	12	31134	31145	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	222084200
49	NC_011942	A	12	31549	31560	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	222084200
50	NC_011942	AAAAT	3	32192	32206	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	222084200
51	NC_011942	AAAT	3	32672	32683	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	222084200
52	NC_011942	T	12	32714	32725	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	222084200
53	NC_011942	GAAAAA	3	32913	32931	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	222084200
54	NC_011942	AAAG	3	33211	33221	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084200
55	NC_011942	AAC	4	33516	33526	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	222084200
56	NC_011942	ACA	4	33598	33610	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	222084200
57	NC_011942	A	13	33726	33738	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	222084200
58	NC_011942	ATA	4	33957	33968	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084200
59	NC_011942	ATA	4	34014	34025	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084200
60	NC_011942	AGAA	3	34313	34323	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084200
61	NC_011942	GAA	4	36032	36043	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222084200
62	NC_011942	A	15	36257	36271	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	222084200
63	NC_011942	TCTT	3	37032	37043	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	222084200
64	NC_011942	TGTT	3	37608	37618	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	222084200
65	NC_011942	TA	6	38810	38820	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	222084200
66	NC_011942	GGTT	3	39622	39634	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	222084200
67	NC_011942	CCT	4	41115	41125	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	222084200
68	NC_011942	CTAC	3	41213	41224	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	222084200
69	NC_011942	AAAG	3	47403	47413	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084200
70	NC_011942	GTA	4	47793	47804	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	222084200
71	NC_011942	CAAAA	3	48496	48509	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	222084200
72	NC_011942	AAAG	3	49674	49685	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	222084200
73	NC_011942	CTTTTT	4	50376	50399	24	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	222084200
74	NC_011942	TCT	5	50406	50420	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	222084200
75	NC_011942	TCT	7	50424	50444	21	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	4 %	222084200
76	NC_011942	ATTC	3	51055	51065	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	222084200
77	NC_011942	TCT	4	52539	52551	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	222084200
78	NC_011942	ATTATA	4	52553	52576	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084200
79	NC_011942	GAATTC	3	52629	52646	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	222084200
80	NC_011942	ATC	4	52997	53007	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084200
81	NC_011942	TCAT	3	55708	55719	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	222084200
82	NC_011942	TCTTT	3	55778	55792	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	222084200
83	NC_011942	TA	6	56038	56048	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	222084200
84	NC_011942	GTAA	3	56122	56134	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	222084200
85	NC_011942	T	12	56372	56383	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	222084200
86	NC_011942	CAAA	3	56766	56777	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	222084200
87	NC_011942	CAT	4	57292	57302	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084200
88	NC_011942	CAAA	3	58806	58816	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	222084200
89	NC_011942	AAAC	3	59172	59182	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	222084200
90	NC_011942	ATA	4	59185	59196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084200
91	NC_011942	AAT	4	60468	60479	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084200
92	NC_011942	T	12	60726	60737	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	222084200
93	NC_011942	TGAA	3	60782	60793	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	222084200
94	NC_011942	TA	7	61199	61212	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	222084200
95	NC_011942	TAT	4	62118	62130	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	222084200
96	NC_011942	AT	6	63278	63289	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084200
97	NC_011942	AGATTA	3	64748	64764	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	222084200
98	NC_011942	AGT	4	65528	65538	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	222084200
99	NC_011942	AAGA	3	66136	66147	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	222084200
100	NC_011942	AATA	3	66798	66808	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	222084200
101	NC_011942	C	13	66911	66923	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	222084200
102	NC_011942	CAAA	3	67348	67358	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	222084200
103	NC_011942	A	12	67383	67394	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	222084200
104	NC_011942	AAAAG	3	70416	70430	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	222084200
105	NC_011942	AG	6	70441	70451	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	222084200
106	NC_011942	AAGATA	3	71135	71152	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	222084200
107	NC_011942	A	25	71182	71206	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	222084200
108	NC_011942	CAAA	3	71218	71229	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	222084200
109	NC_011942	AGAA	3	71559	71569	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084200
110	NC_011942	T	12	72083	72094	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	222084200
111	NC_011942	AGA	5	72590	72604	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	222084200
112	NC_011942	A	14	72813	72826	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	222084200
113	NC_011942	AT	6	73559	73572	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_011942	TTTA	3	74449	74460	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	222084168
115	NC_011942	AAAAAG	3	74917	74934	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	222084169
116	NC_011942	AGAA	3	75993	76004	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_011942	TTTG	3	76139	76149	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	222084171
118	NC_011942	A	14	76310	76323	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_011942	ACCT	3	77361	77373	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
120	NC_011942	TTGT	3	78135	78147	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	222084176
121	NC_011942	CTTT	3	78444	78455	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
122	NC_011942	TTTG	3	78496	78506	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_011942	CAAA	3	79029	79039	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	222084177
124	NC_011942	ATT	4	79766	79776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	222084178
125	NC_011942	TTC	4	80171	80181	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
126	NC_011942	TTTCT	3	80401	80414	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
127	NC_011942	A	14	80464	80477	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011942	CAAA	3	81614	81624	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	222084180
129	NC_011942	GCT	4	82109	82120	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222084180
130	NC_011942	TTGA	3	82600	82610	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_011942	AAAC	3	82713	82723	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	222084181
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133	NC_011942	TA	6	86111	86123	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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157	NC_011942	A	12	108394	108405	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	222084197
158	NC_011942	TTTG	3	109470	109480	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	222084197
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162	NC_011942	TAA	4	114212	114223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084199

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gnetum parvifolium chloroplast