ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Keteleeria davidiana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011930	T	17	530	546	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011930	CT	6	784	794	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
3	NC_011930	T	12	796	807	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011930	CTG	4	1053	1064	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222084060
5	NC_011930	AG	6	1569	1580	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	222084060
6	NC_011930	TTTC	3	1949	1960	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	222084060
7	NC_011930	TAC	4	3846	3857	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011930	A	13	6814	6826	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_011930	ATCC	3	7298	7309	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
10	NC_011930	GAGG	3	10560	10571	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_011930	AGGT	3	10772	10783	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011930	ATCG	3	12146	12158	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_011930	AACC	3	12402	12414	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
14	NC_011930	CTAAT	3	13129	13144	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	222084062
15	NC_011930	TAT	5	13689	13703	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_011930	AGA	4	15031	15042	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222084064
17	NC_011930	TTTC	3	17116	17126	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	222084065
18	NC_011930	AGA	4	17593	17603	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	222084065
19	NC_011930	TAT	4	19118	19128	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	222084065
20	NC_011930	TAGA	3	19572	19583	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	222084065
21	NC_011930	AATA	3	21000	21010	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	222084065
22	NC_011930	ATGG	3	21756	21767	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	222084065
23	NC_011930	TTCT	3	22410	22420	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_011930	CT	6	23225	23235	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011930	GAAA	3	24243	24253	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_011930	TTC	4	24453	24464	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_011930	TA	6	24882	24892	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_011930	CATT	3	26146	26157	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_011930	ACC	4	27565	27576	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
30	NC_011930	TTCA	3	27931	27942	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_011930	TAC	4	28327	28337	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084070
32	NC_011930	GTA	4	30558	30569	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	222084108
33	NC_011930	AAAG	3	31044	31055	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	222084108
34	NC_011930	CTAT	4	31778	31793	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	222084108
35	NC_011930	AT	7	32710	32722	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	222084108
36	NC_011930	TAAG	3	33097	33107	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	222084108
37	NC_011930	TCT	4	33878	33889	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	222084108
38	NC_011930	CGAT	3	34140	34152	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	222084108
39	NC_011930	ATCCAT	3	34223	34240	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	222084108
40	NC_011930	TTCATC	3	35877	35894	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	222084108
41	NC_011930	TTA	4	37833	37844	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	222084108
42	NC_011930	TAC	4	39587	39597	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084108
43	NC_011930	AACG	3	40159	40170	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	222084108
44	NC_011930	ATATT	3	41857	41870	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	222084108
45	NC_011930	GATG	3	42250	42262	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	222084108
46	NC_011930	ATC	4	42796	42806	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084108
47	NC_011930	AT	6	44087	44098	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
48	NC_011930	ATGA	3	45030	45041	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	222084108
49	NC_011930	AAT	4	45338	45349	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084108
50	NC_011930	ATTCT	3	45734	45748	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	222084108
51	NC_011930	CCTT	3	46907	46917	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	222084108
52	NC_011930	CTA	4	46980	46990	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084108
53	NC_011930	GAAA	3	47314	47324	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084108
54	NC_011930	GGAT	3	47371	47382	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	222084108
55	NC_011930	TTCGA	3	47729	47742	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	222084108
56	NC_011930	TTTA	3	47834	47845	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	222084108
57	NC_011930	CTTT	3	47988	47999	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	222084108
58	NC_011930	GA	6	48697	48708	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	222084108
59	NC_011930	GGAT	3	48914	48925	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	222084108
60	NC_011930	A	26	50319	50344	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	222084108
61	NC_011930	TTGG	3	53538	53549	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	222084108
62	NC_011930	ATTT	3	53757	53769	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	222084108
63	NC_011930	AAGGA	3	53824	53838	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	222084108
64	NC_011930	A	12	53979	53990	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	222084108
65	NC_011930	TAT	5	56087	56101	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	222084108
66	NC_011930	TAT	4	56984	56994	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	222084108
67	NC_011930	TTC	4	58917	58928	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	222084108
68	NC_011930	TA	6	59901	59912	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
69	NC_011930	CAT	4	61126	61136	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	222084108
70	NC_011930	AAAT	3	61893	61903	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	222084108
71	NC_011930	A	12	62551	62562	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	222084108
72	NC_011930	GTT	4	63545	63556	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	222084108
73	NC_011930	A	16	66978	66993	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	222084108
74	NC_011930	ATGA	3	67051	67062	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	222084108
75	NC_011930	ATCC	3	67280	67290	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	222084108
76	NC_011930	AAG	4	68174	68185	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	222084108
77	NC_011930	GATT	4	68608	68623	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	222084108
78	NC_011930	AATATA	3	69313	69331	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	222084108
79	NC_011930	TTTC	3	69354	69364	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	222084108
80	NC_011930	TTAA	3	69388	69399	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
81	NC_011930	AAC	4	70221	70231	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	222084108
82	NC_011930	TTAC	3	71339	71350	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	222084108
83	NC_011930	AT	9	71691	71708	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	222084108
84	NC_011930	TCGAA	3	72175	72189	15	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	222084108
85	NC_011930	ATA	4	73821	73833	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	222084108
86	NC_011930	AT	12	74657	74681	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
87	NC_011930	A	12	74709	74720	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	222084108
88	NC_011930	AGC	4	75566	75577	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	222084108
89	NC_011930	TATC	4	76937	76952	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	222084108
90	NC_011930	TA	6	76953	76964	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
91	NC_011930	ATAG	4	76976	76991	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	222084108
92	NC_011930	AAAT	3	77550	77561	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	222084108
93	NC_011930	AT	6	78658	78669	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
94	NC_011930	A	12	80005	80016	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	222084108
95	NC_011930	TA	13	80015	80039	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084108
96	NC_011930	TCCTA	3	80300	80314	15	20 %	40 %	0 %	40 %	0 %	222084108
97	NC_011930	T	16	80468	80483	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	222084108
98	NC_011930	GAAA	3	81156	81166	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	222084108
99	NC_011930	AGA	4	83402	83412	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	222084108
100	NC_011930	AAAG	3	89344	89355	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_011930	ATCC	3	90935	90946	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
102	NC_011930	TC	6	91152	91163	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
103	NC_011930	TAT	4	91569	91581	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_011930	TAT	4	91596	91608	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_011930	GATCC	3	91929	91942	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	222084112
106	NC_011930	ATTC	3	92214	92225	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	222084112
107	NC_011930	AATTC	3	98325	98338	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
108	NC_011930	TA	6	99059	99069	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	222084120
109	NC_011930	A	14	100370	100383	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_011930	TCGT	3	100700	100710	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	222084123
111	NC_011930	TAGT	4	100964	100978	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	222084123
112	NC_011930	TA	6	100979	100990	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	222084123
113	NC_011930	AATT	3	101152	101164	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	222084123
114	NC_011930	CTTTT	3	101477	101491	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	222084123
115	NC_011930	ATA	4	101879	101890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	222084124
116	NC_011930	CTT	4	103111	103121	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	222084126
117	NC_011930	TC	7	103985	103997	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	222084127
118	NC_011930	AGGG	5	105982	106000	19	25 %	0 %	75 %	0 %	10 %	Non-Coding
119	NC_011930	CCTT	4	107429	107444	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
120	NC_011930	TTC	4	108593	108603	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
121	NC_011930	TCCCC	3	108611	108624	14	0 %	20 %	0 %	80 %	7 %	Non-Coding
122	NC_011930	ATA	4	108845	108855	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_011930	AT	11	111989	112010	22	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
124	NC_011930	TA	7	112014	112027	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_011930	GGA	4	114036	114046	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	222084131
126	NC_011930	TTC	5	116790	116804	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
127	NC_011930	AT	14	117695	117721	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Keteleeria davidiana chloroplast