ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Trifolium subterraneum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011828	TA	8	4623	4637	15	50 %	50 %	0 %	6 %	219673995
2	NC_011828	AT	6	8484	8494	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
3	NC_011828	TA	6	10614	10624	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
4	NC_011828	TA	6	10858	10869	12	50 %	50 %	0 %	8 %	219673995
5	NC_011828	AT	6	12859	12874	16	50 %	50 %	0 %	6 %	219673995
6	NC_011828	TA	6	13217	13227	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
7	NC_011828	TA	7	13704	13716	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
8	NC_011828	TA	7	15387	15400	14	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
9	NC_011828	AT	11	23144	23165	22	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
10	NC_011828	AT	6	25525	25536	12	50 %	50 %	0 %	8 %	219673995
11	NC_011828	TA	12	39089	39110	22	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
12	NC_011828	TA	12	42441	42463	23	50 %	50 %	0 %	8 %	219673995
13	NC_011828	TA	7	43069	43082	14	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
14	NC_011828	TA	7	44153	44166	14	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
15	NC_011828	TA	7	45272	45284	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
16	NC_011828	AT	7	45292	45304	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
17	NC_011828	TA	6	45319	45329	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
18	NC_011828	AT	7	45536	45548	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
19	NC_011828	TA	8	45746	45761	16	50 %	50 %	0 %	6 %	219673995
20	NC_011828	TA	6	46567	46577	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
21	NC_011828	TA	6	48506	48516	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
22	NC_011828	AT	11	50354	50376	23	50 %	50 %	0 %	8 %	219673995
23	NC_011828	TG	6	54864	54874	11	0 %	50 %	50 %	9 %	219673995
24	NC_011828	TA	7	63807	63820	14	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
25	NC_011828	AT	6	66800	66811	12	50 %	50 %	0 %	8 %	219673995
26	NC_011828	TA	6	77166	77176	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
27	NC_011828	AT	7	82948	82960	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
28	NC_011828	TA	12	84375	84396	22	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
29	NC_011828	TA	7	89866	89878	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
30	NC_011828	TA	7	90392	90404	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
31	NC_011828	TA	7	90615	90627	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
32	NC_011828	TA	6	99709	99719	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673995
33	NC_011828	AT	7	99746	99758	13	50 %	50 %	0 %	7 %	219673995
34	NC_011828	AT	13	104222	104247	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_011828	TA	6	107515	107525	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673999
36	NC_011828	TA	6	107543	107553	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219673999
37	NC_011828	TA	7	109649	109662	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_011828	AT	7	114488	114502	15	50 %	50 %	0 %	6 %	219674005
39	NC_011828	TA	6	116082	116092	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219674006
40	NC_011828	AT	6	128022	128032	11	50 %	50 %	0 %	9 %	219674015
41	NC_011828	TA	6	129695	129705	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Trifolium subterraneum chloroplast