ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Trifolium subterraneum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011828	ATT	4	1821	1832	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011828	AATA	3	2333	2344	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011828	T	12	4118	4129	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
4	NC_011828	TA	6	4623	4634	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
5	NC_011828	T	13	5775	5787	13	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
6	NC_011828	A	12	6105	6116	12	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
7	NC_011828	AT	6	12863	12874	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
8	NC_011828	T	12	14424	14435	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
9	NC_011828	ATT	4	15020	15031	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
10	NC_011828	TA	6	15387	15398	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
11	NC_011828	A	13	15877	15889	13	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
12	NC_011828	A	13	20835	20847	13	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
13	NC_011828	A	12	20939	20950	12	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
14	NC_011828	AT	8	23147	23162	16	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
15	NC_011828	T	12	23218	23229	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
16	NC_011828	A	12	23231	23242	12	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
17	NC_011828	TAT	4	24968	24979	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
18	NC_011828	ATA	5	25645	25659	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219673995
19	NC_011828	T	12	28653	28664	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
20	NC_011828	A	13	28953	28965	13	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
21	NC_011828	T	15	29007	29021	15	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
22	NC_011828	T	12	32366	32377	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
23	NC_011828	T	13	34267	34279	13	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
24	NC_011828	A	13	37758	37770	13	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
25	NC_011828	ATT	4	37852	37863	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
26	NC_011828	TA	9	39090	39107	18	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
27	NC_011828	T	12	39689	39700	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
28	NC_011828	T	12	39801	39812	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
29	NC_011828	ATTT	3	41954	41965	12	25 %	75 %	0 %	0 %	219673995
30	NC_011828	TA	10	42442	42461	20	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
31	NC_011828	TA	6	43069	43080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
32	NC_011828	GATA	3	43240	43251	12	50 %	25 %	25 %	0 %	219673995
33	NC_011828	ATA	4	45251	45262	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219673995
34	NC_011828	AT	6	45292	45303	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
35	NC_011828	AT	6	45536	45547	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
36	NC_011828	TA	7	45746	45759	14	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
37	NC_011828	T	16	46532	46547	16	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
38	NC_011828	T	12	49908	49919	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
39	NC_011828	AT	6	50358	50369	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
40	NC_011828	ACTA	3	50533	50544	12	50 %	25 %	0 %	25 %	219673995
41	NC_011828	T	12	63584	63595	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
42	NC_011828	TAT	4	63680	63691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
43	NC_011828	ATA	5	63692	63706	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219673995
44	NC_011828	A	13	66428	66440	13	100 %	0 %	0 %	0 %	219673995
45	NC_011828	TTTA	3	84353	84364	12	25 %	75 %	0 %	0 %	219673995
46	NC_011828	TA	8	84378	84393	16	50 %	50 %	0 %	0 %	219673995
47	NC_011828	T	12	86236	86247	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219673995
48	NC_011828	TCT	4	89015	89026	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219673995
49	NC_011828	TAT	4	89992	90003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
50	NC_011828	TAT	4	90468	90479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
51	NC_011828	TAT	4	90691	90702	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219673995
52	NC_011828	CTAC	3	93276	93287	12	25 %	25 %	0 %	50 %	219673995
53	NC_011828	AT	6	104236	104247	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011828	A	13	104265	104277	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011828	A	13	104290	104302	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011828	A	12	109632	109643	12	100 %	0 %	0 %	0 %	219674000
57	NC_011828	TAGA	3	109657	109668	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011828	TATT	3	113059	113070	12	25 %	75 %	0 %	0 %	219674004
59	NC_011828	AT	6	114488	114499	12	50 %	50 %	0 %	0 %	219674005
60	NC_011828	TATT	3	114773	114784	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011828	T	12	117409	117420	12	0 %	100 %	0 %	0 %	219674006
62	NC_011828	A	12	117478	117489	12	100 %	0 %	0 %	0 %	219674006
63	NC_011828	A	13	117786	117798	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011828	T	12	120011	120022	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011828	CTTT	3	120039	120050	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011828	A	13	121315	121327	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011828	A	13	121849	121861	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011828	T	12	124227	124238	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011828	T	13	125845	125857	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011828	T	12	130832	130843	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011828	T	18	132793	132810	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011828	A	15	132812	132826	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011828	TAT	5	142164	142178	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011828	T	13	142178	142190	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011828	T	14	142393	142406	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Trifolium subterraneum chloroplast