Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trifolium subterraneum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_011828ATT5182118341433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
2NC_011828GTT442114221110 %66.67 %33.33 %0 %9 %219673995
3NC_011828AAT4463846501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %219673995
4NC_011828ATT4591259221133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
5NC_011828ACA4748574961266.67 %0 %0 %33.33 %8 %219673995
6NC_011828ATT410083100941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %219673995
7NC_011828ATA411636116471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %219673995
8NC_011828AAT413722137331266.67 %33.33 %0 %0 %8 %219673995
9NC_011828TAA413760137701166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
10NC_011828ATT413770137801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
11NC_011828TAT414061140711133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
12NC_011828TAA414473144841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %219673995
13NC_011828ATT415020150311233.33 %66.67 %0 %0 %0 %219673995
14NC_011828ATT422348223591233.33 %66.67 %0 %0 %8 %219673995
15NC_011828TAT424968249821533.33 %66.67 %0 %0 %6 %219673995
16NC_011828ATA625643256591766.67 %33.33 %0 %0 %5 %219673995
17NC_011828CAG429255292661233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %219673995
18NC_011828TAA429327293371166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
19NC_011828TAG429634296441133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %219673995
20NC_011828TAT432208322191233.33 %66.67 %0 %0 %8 %219673995
21NC_011828ATT433488334991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %219673995
22NC_011828TCT43653236543120 %66.67 %0 %33.33 %8 %219673995
23NC_011828ATT437852378631233.33 %66.67 %0 %0 %0 %219673995
24NC_011828ATA439126391361166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
25NC_011828AAT542516425291466.67 %33.33 %0 %0 %7 %219673995
26NC_011828ATA545251452661666.67 %33.33 %0 %0 %6 %219673995
27NC_011828TAA445577455871166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
28NC_011828AGA446429464411366.67 %0 %33.33 %0 %7 %219673995
29NC_011828ATT450299503101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %219673995
30NC_011828ATG452929529391133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %219673995
31NC_011828GCA454827548381233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %219673995
32NC_011828ATG455153551631133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %219673995
33NC_011828AGT455906559161133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %219673995
34NC_011828GTT45698356993110 %66.67 %33.33 %0 %9 %219673995
35NC_011828TCA458581585921233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %219673995
36NC_011828ACC459276592861133.33 %0 %0 %66.67 %9 %219673995
37NC_011828AAG559537595511566.67 %0 %33.33 %0 %6 %219673995
38NC_011828AAT463441634521266.67 %33.33 %0 %0 %8 %219673995
39NC_011828TAT563680636931433.33 %66.67 %0 %0 %7 %219673995
40NC_011828AAT563694637081566.67 %33.33 %0 %0 %6 %219673995
41NC_011828GAT463727637381233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %219673995
42NC_011828TAT467153671651333.33 %66.67 %0 %0 %7 %219673995
43NC_011828AAC468026680371266.67 %0 %0 %33.33 %8 %219673995
44NC_011828TAT468784687941133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
45NC_011828ATA468810688211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %219673995
46NC_011828ATA468843688531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
47NC_011828TAT470096701061133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
48NC_011828TAT471385713951133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
49NC_011828TCT47350473515120 %66.67 %0 %33.33 %8 %219673995
50NC_011828AAT480955809661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %219673995
51NC_011828TAT483462834721133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219673995
52NC_011828ATT584210842241533.33 %66.67 %0 %0 %6 %219673995
53NC_011828TTC48838988400120 %66.67 %0 %33.33 %8 %219673995
54NC_011828ATC488566885771233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %219673995
55NC_011828TCT58901589028140 %66.67 %0 %33.33 %7 %219673995
56NC_011828TAT489992900031233.33 %66.67 %0 %0 %0 %219673995
57NC_011828TAA490084900941166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
58NC_011828TAA490329903391166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
59NC_011828TAT490468904791233.33 %66.67 %0 %0 %0 %219673995
60NC_011828TAA490552905621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
61NC_011828TAT490691907021233.33 %66.67 %0 %0 %0 %219673995
62NC_011828TAA490783907931166.67 %33.33 %0 %0 %9 %219673995
63NC_011828CAA41043041043151266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
64NC_011828ATT41049131049241233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_011828TTA41051231051341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_011828GAA41052301052401166.67 %0 %33.33 %0 %9 %219673997
67NC_011828TGT4105666105678130 %66.67 %33.33 %0 %7 %219673998
68NC_011828AGA51086811086951566.67 %0 %33.33 %0 %6 %219673999
69NC_011828ACT41098571098671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
70NC_011828TCT4111249111259110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
71NC_011828TAT41150701150811233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
72NC_011828AAG41159061159161166.67 %0 %33.33 %0 %9 %219674006
73NC_011828TCT4118520118531120 %66.67 %0 %33.33 %8 %219674007
74NC_011828ATT41199561199671233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_011828ATA41211421211521166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
76NC_011828CAT41215411215521233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %219674011
77NC_011828TAT41215551215651133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219674011
78NC_011828CAA41216641216751266.67 %0 %0 %33.33 %8 %219674011
79NC_011828TAT41240451240551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %219674013
80NC_011828TCT4124442124453120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
81NC_011828GAT41293341293441133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
82NC_011828GAA41294451294551166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
83NC_011828TAC41296321296431233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
84NC_011828TTG4133539133550120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
85NC_011828ATA41393351393451166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_011828ATT41405901406001133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
87NC_011828TAT41406191406301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
88NC_011828ATA41406461406561166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
89NC_011828TAT71421641421842133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_011828AAT41439021439141366.67 %33.33 %0 %0 %7 %219674021