ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Festuca arundinacea chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011713	CAG	4	682	693	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	218176225
2	NC_011713	TAA	4	1610	1621	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011713	AAT	4	3550	3562	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_011713	TCT	4	4510	4521	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_011713	GAA	4	8305	8316	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011713	TTG	4	10618	10628	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	218176231
7	NC_011713	TCC	4	14293	14305	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
8	NC_011713	TAT	4	14632	14642	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_011713	TAT	4	16876	16886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_011713	ATC	4	18629	18639	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_011713	AGA	4	26818	26829	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	218176237
12	NC_011713	AGA	4	26974	26985	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	218176237
13	NC_011713	AGA	4	27127	27138	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	218176237
14	NC_011713	GAA	4	27848	27859	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	218176237
15	NC_011713	GTT	4	31361	31372	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218176239
16	NC_011713	TGC	4	32086	32097	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	218176240
17	NC_011713	CTC	4	36675	36687	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
18	NC_011713	AAG	4	42327	42338	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	218176245
19	NC_011713	AGT	4	42732	42742	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	218176245
20	NC_011713	ATT	4	47298	47308	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_011713	TAA	4	47992	48002	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_011713	GAA	4	58489	58499	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_011713	AAG	4	58770	58780	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_011713	TTC	4	60705	60716	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	218176255
25	NC_011713	TTC	5	65317	65331	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
26	NC_011713	AGA	4	74450	74461	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	218176264
27	NC_011713	TAT	4	75529	75539	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	218176264
28	NC_011713	ATT	4	76119	76129	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	218176264
29	NC_011713	TTC	4	81678	81688	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	218176264
30	NC_011713	TAC	4	90095	90106	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	218176264
31	NC_011713	TCC	4	102367	102378	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	218176300
32	NC_011713	CAA	4	108682	108692	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	218176300
33	NC_011713	GTA	4	126591	126602	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	218176300

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Festuca arundinacea chloroplast