ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Vaucheria litorea chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_011600AATA330411275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
2NC_011600GAA48038141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %215400696
3NC_011600AATT3126412751250 %50 %0 %0 %0 %215400696
4NC_011600CATA3146714791350 %25 %0 %25 %7 %215400695
5NC_011600TAAA3148714981275 %25 %0 %0 %8 %215400695
6NC_011600AAAG3178817981175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
7NC_011600ATT4181418261333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_011600ATATT3205320671540 %60 %0 %0 %6 %215400693
9NC_011600TTTA3327232821125 %75 %0 %0 %9 %215400698
10NC_011600TAAA3426342731175 %25 %0 %0 %9 %215400699
11NC_011600TATTT3451845311420 %80 %0 %0 %7 %215400700
12NC_011600T1346924704130 %100 %0 %0 %7 %215400700
13NC_011600TTTA3519852101325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_011600TAA4591859291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %215400701
15NC_011600TAT4625862711433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
16NC_011600ATT4663066411233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400702
17NC_011600GAAA3700370141275 %0 %25 %0 %8 %215400702
18NC_011600GAAA3704770571175 %0 %25 %0 %9 %215400702
19NC_011600TTA4717671871233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400702
20NC_011600TA6737573861250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_011600TAT4739474051233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
22NC_011600AT11740874282150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_011600TGTT375567566110 %75 %25 %0 %9 %215400703
24NC_011600ATT4765876701333.33 %66.67 %0 %0 %7 %215400703
25NC_011600TAT4924792571133.33 %66.67 %0 %0 %9 %215400704
26NC_011600TAA4993099411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %215400704
27NC_011600ATT410677106891333.33 %66.67 %0 %0 %7 %215400704
28NC_011600TTAA310909109191150 %50 %0 %0 %9 %215400705
29NC_011600TTG41103411045120 %66.67 %33.33 %0 %8 %215400705
30NC_011600TAA511464114781566.67 %33.33 %0 %0 %6 %215400706
31NC_011600ATTA311598116091250 %50 %0 %0 %8 %215400706
32NC_011600ATTT311633116431125 %75 %0 %0 %9 %215400706
33NC_011600TAAA311843118531175 %25 %0 %0 %9 %215400706
34NC_011600AAT411870118811266.67 %33.33 %0 %0 %8 %215400706
35NC_011600AATT414360143751650 %50 %0 %0 %6 %215400711
36NC_011600TTG41470814719120 %66.67 %33.33 %0 %0 %215400711
37NC_011600TTAT315151151621225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_011600TAAA315199152091175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
39NC_011600TGTTT31559315606140 %80 %20 %0 %7 %215400712
40NC_011600TTTA317659176691125 %75 %0 %0 %9 %215400712
41NC_011600AT617743177541250 %50 %0 %0 %8 %215400712
42NC_011600AATT318591186011150 %50 %0 %0 %9 %215400712
43NC_011600TGAA319308193181150 %25 %25 %0 %9 %215400713
44NC_011600TTAA320606206171250 %50 %0 %0 %8 %215400713
45NC_011600TTTTA320950209631420 %80 %0 %0 %7 %215400714
46NC_011600TTA421491215031333.33 %66.67 %0 %0 %7 %215400714
47NC_011600ATAA324297243081275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
48NC_011600TTAA324334243451250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_011600T122441224423120 %100 %0 %0 %0 %215400715
50NC_011600ATTA324468244801350 %50 %0 %0 %7 %215400715
51NC_011600TA624709247191150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
52NC_011600AT624926249371250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
53NC_011600TAAA326058260681175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
54NC_011600GGT42769527706120 %33.33 %66.67 %0 %8 %215400719
55NC_011600TGC52846828482150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %215400719
56NC_011600A13285422855413100 %0 %0 %0 %7 %215400719
57NC_011600TAA428755287671366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
58NC_011600TAT528768287811433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_011600ATT429570295801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
60NC_011600AATA330945309551175 %25 %0 %0 %9 %215400724
61NC_011600AT1331137311602450 %50 %0 %0 %8 %215400724
62NC_011600AT931163311791750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
63NC_011600TTAA332227322381250 %50 %0 %0 %8 %215400726
64NC_011600TATT432485325001625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
65NC_011600ATTT432651326661625 %75 %0 %0 %6 %215400727
66NC_011600ATT432722327331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400727
67NC_011600AAAT332755327651175 %25 %0 %0 %9 %215400728
68NC_011600TAT433049330601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400728
69NC_011600ATT433462334731233.33 %66.67 %0 %0 %0 %215400728
70NC_011600A12346303464112100 %0 %0 %0 %0 %215400729
71NC_011600TAAA334819348291175 %25 %0 %0 %9 %215400729
72NC_011600TAAA335477354881275 %25 %0 %0 %8 %215400730
73NC_011600TAT435675356851133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
74NC_011600TAT435727357371133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
75NC_011600AAAT338142381531275 %25 %0 %0 %0 %215400733
76NC_011600TTAA338197382081250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
77NC_011600ATA438891389021266.67 %33.33 %0 %0 %8 %215400735
78NC_011600TTAAT440266402841940 %60 %0 %0 %10 %Non-Coding
79NC_011600AATATA340337403541866.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
80NC_011600TAAA340385403961275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
81NC_011600TAA540507405201466.67 %33.33 %0 %0 %7 %215400737
82NC_011600TAA440546405561166.67 %33.33 %0 %0 %9 %215400737
83NC_011600ATA440820408311266.67 %33.33 %0 %0 %0 %215400737
84NC_011600TTTA343989439991125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_011600ATTA344563445741250 %50 %0 %0 %0 %215400742
86NC_011600AGATC344857448701440 %20 %20 %20 %7 %215400743
87NC_011600CTT44565345663110 %66.67 %0 %33.33 %9 %215400745
88NC_011600AATT347583475931150 %50 %0 %0 %9 %215400748
89NC_011600TAA447812478221166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
90NC_011600ATA448520485311266.67 %33.33 %0 %0 %8 %215400750
91NC_011600CATT348619486291125 %50 %0 %25 %9 %215400750
92NC_011600TATT348760487701125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
93NC_011600TTAAT349660496731440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
94NC_011600T185003550052180 %100 %0 %0 %5 %215400752
95NC_011600ATTT350604506151225 %75 %0 %0 %8 %215400754
96NC_011600TA651285512961250 %50 %0 %0 %8 %215400755
97NC_011600AATT351347513571150 %50 %0 %0 %9 %215400755
98NC_011600AAT451705517171366.67 %33.33 %0 %0 %7 %215400755
99NC_011600TTTA351973519841225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_011600GTTT35198551995110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
101NC_011600TTGTTT35230752324180 %83.33 %16.67 %0 %5 %215400756
102NC_011600TTTA352634526451225 %75 %0 %0 %0 %215400757
103NC_011600T245294352966240 %100 %0 %0 %8 %215400757
104NC_011600ATT453369533811333.33 %66.67 %0 %0 %7 %215400758
105NC_011600CTT45380053810110 %66.67 %0 %33.33 %9 %215400759
106NC_011600TAC454933549451333.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %215400762
107NC_011600TATT355404554151225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
108NC_011600TTTAA356764567771440 %60 %0 %0 %7 %215400767
109NC_011600TTTA357143571531125 %75 %0 %0 %9 %215400768
110NC_011600GTAAT357755577701640 %40 %20 %0 %6 %215400769
111NC_011600ATT458524585361333.33 %66.67 %0 %0 %7 %215400770
112NC_011600TAA458892589031266.67 %33.33 %0 %0 %0 %215400771
113NC_011600TTA459214592251233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400771
114NC_011600GTT55979159805150 %66.67 %33.33 %0 %6 %215400772
115NC_011600AT1159955599752150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_011600ATT460054600641133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
117NC_011600TAAAA460069600892180 %20 %0 %0 %9 %Non-Coding
118NC_011600T146010760120140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
119NC_011600AGTT360297603071125 %50 %25 %0 %9 %215400773
120NC_011600ACAA361897619071175 %0 %0 %25 %9 %215400773
121NC_011600TAAA364212642221175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
122NC_011600ATA464286642971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
123NC_011600TGCC36449364504120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
124NC_011600TAGC365361653731325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
125NC_011600TAAG366690667011250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
126NC_011600ATA467107671171166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
127NC_011600TA667226672361150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
128NC_011600AATT467395674101650 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
129NC_011600TAAA367570675811275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
130NC_011600ATT668840688561733.33 %66.67 %0 %0 %5 %215400776
131NC_011600ATAA369352693631275 %25 %0 %0 %8 %215400777
132NC_011600CAA470519705301266.67 %0 %0 %33.33 %8 %215400778
133NC_011600ATTT371914719241125 %75 %0 %0 %9 %215400779
134NC_011600TTAA372647726581250 %50 %0 %0 %8 %215400780
135NC_011600ATA473178731881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %215400781
136NC_011600ATTT373529735401225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
137NC_011600TTAT373813738241225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
138NC_011600ATA473871738811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
139NC_011600ATT474045740571333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
140NC_011600TTTG37441774427110 %75 %25 %0 %9 %215400782
141NC_011600TTTA374522745331225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
142NC_011600TAAA374825748351175 %25 %0 %0 %9 %215400783
143NC_011600GCT57583775851150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %215400783
144NC_011600AAT476042760531266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
145NC_011600ATTT476103761181625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
146NC_011600TCT47678376793110 %66.67 %0 %33.33 %9 %215400784
147NC_011600TAAA377585775951175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
148NC_011600TAAT379884798951250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
149NC_011600TAT480053800641233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
150NC_011600ATT480361803721233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400787
151NC_011600TTTA380382803921125 %75 %0 %0 %9 %215400787
152NC_011600TAT480619806291133.33 %66.67 %0 %0 %9 %215400787
153NC_011600TAAAAA380696807141983.33 %16.67 %0 %0 %5 %215400787
154NC_011600ATA482664826741166.67 %33.33 %0 %0 %9 %215400790
155NC_011600AT682874828851250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
156NC_011600ATAA382944829551275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
157NC_011600ATATAA383197832131766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
158NC_011600TAT484140841511233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400791
159NC_011600CAT484399844101233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %215400791
160NC_011600ATTA384530845411250 %50 %0 %0 %8 %215400791
161NC_011600AGA484743847541266.67 %0 %33.33 %0 %0 %215400791
162NC_011600TAA484794848041166.67 %33.33 %0 %0 %9 %215400791
163NC_011600ATT485287852981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400791
164NC_011600AATT386161861731350 %50 %0 %0 %7 %215400792
165NC_011600ATT486186861961133.33 %66.67 %0 %0 %9 %215400792
166NC_011600TTA486840868521333.33 %66.67 %0 %0 %7 %215400793
167NC_011600AACC387225872361250 %0 %0 %50 %8 %215400793
168NC_011600AATT387480874911250 %50 %0 %0 %8 %215400793
169NC_011600ATT487719877301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400793
170NC_011600TAAA387899879091175 %25 %0 %0 %9 %215400793
171NC_011600ATT488163881741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
172NC_011600AT688541885521250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
173NC_011600TTTTA388568885821520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
174NC_011600CCA488606886161133.33 %0 %0 %66.67 %9 %215400795
175NC_011600ATA489133891451366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
176NC_011600TAAA389278892881175 %25 %0 %0 %9 %215400796
177NC_011600TATT389630896411225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
178NC_011600ATA490291903011166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
179NC_011600TTTA391109911191125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
180NC_011600AAT491249912601266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
181NC_011600TTTA392174921841125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
182NC_011600CAA492540925501166.67 %0 %0 %33.33 %9 %215400806
183NC_011600TA693380933911250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
184NC_011600TTTA393683936941225 %75 %0 %0 %8 %215400810
185NC_011600ATTT393896939071225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
186NC_011600TAAT395090951011250 %50 %0 %0 %8 %215400812
187NC_011600AATTT395133951461440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
188NC_011600GCA495495955061233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %215400813
189NC_011600ATAA395844958551275 %25 %0 %0 %8 %215400813
190NC_011600TAA497870978801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %215400815
191NC_011600TATAA398163981761460 %40 %0 %0 %7 %215400816
192NC_011600AATA398181981921275 %25 %0 %0 %8 %215400816
193NC_011600TTAT398372983831225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
194NC_011600AATTTA399209992261850 %50 %0 %0 %5 %215400819
195NC_011600TAATT399697997121640 %60 %0 %0 %6 %215400819
196NC_011600AAAT399759997691175 %25 %0 %0 %9 %215400819
197NC_011600ATT499799998101233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400819
198NC_011600TTAT41002401002541525 %75 %0 %0 %6 %215400821
199NC_011600TTATT41004391004592120 %80 %0 %0 %9 %Non-Coding
200NC_011600AAATAA31008341008521983.33 %16.67 %0 %0 %5 %215400822
201NC_011600ATT51008731008871533.33 %66.67 %0 %0 %0 %215400822
202NC_011600TAG41017691017801233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %215400822
203NC_011600AT181038731039083650 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
204NC_011600AAAT31040901041011275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
205NC_011600AT61041651041751150 %50 %0 %0 %9 %215400826
206NC_011600TAA41047371047481266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
207NC_011600ATATTT31048161048331833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
208NC_011600TCT5105048105062150 %66.67 %0 %33.33 %6 %215400828
209NC_011600ATTAAT31051561051731850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
210NC_011600CAAA31055041055141175 %0 %0 %25 %9 %215400829
211NC_011600AAC41069881069991266.67 %0 %0 %33.33 %8 %215400829
212NC_011600TTA41081851081951133.33 %66.67 %0 %0 %9 %215400830
213NC_011600ATT41082011082121233.33 %66.67 %0 %0 %8 %215400830
214NC_011600CAC41084011084121233.33 %0 %0 %66.67 %8 %215400830
215NC_011600TTATA31086051086181440 %60 %0 %0 %7 %215400830
216NC_011600TAA41089661089771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %215400830
217NC_011600TATT31103301103411225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
218NC_011600CTTA31106431106541225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
219NC_011600GCTA31119711119831325 %25 %25 %25 %7 %Non-Coding
220NC_011600CAGG31128381128491225 %0 %50 %25 %8 %Non-Coding
221NC_011600TAT41130471130581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
222NC_011600TTTA31131221131321125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
223NC_011600TAAA31134641134751275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding