ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Eriocheir hepuensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011598	TAAATT	3	556	573	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	215260037
2	NC_011598	TA	6	681	694	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	215260037
3	NC_011598	AT	6	1281	1291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	215260037
4	NC_011598	ATT	4	1636	1648	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	215260037
5	NC_011598	CTCG	3	1653	1664	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	215260037
6	NC_011598	TA	9	1749	1765	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	215260037
7	NC_011598	TTAT	3	2351	2363	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	215260039
8	NC_011598	TTTA	3	2460	2471	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	215260039
9	NC_011598	ATT	4	2551	2562	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	215260039
10	NC_011598	CAT	4	2612	2623	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	215260039
11	NC_011598	TTG	4	2726	2737	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	215260039
12	NC_011598	AATT	3	2739	2749	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	215260039
13	NC_011598	TAG	4	3124	3135	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	215260044
14	NC_011598	TTA	4	3821	3831	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	215260044
15	NC_011598	TAT	4	3881	3892	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	215260044
16	NC_011598	TTTC	3	4232	4242	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	215260040
17	NC_011598	TC	6	5618	5629	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	215260041
18	NC_011598	AATC	3	7081	7092	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	215260042
19	NC_011598	ATT	4	7655	7666	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_011598	CATT	3	8376	8388	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	215260046
21	NC_011598	CTT	4	9179	9189	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	215260043
22	NC_011598	TTG	4	9232	9243	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	215260043
23	NC_011598	TA	7	9968	9981	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_011598	TTTA	3	11223	11234	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_011598	TTTC	3	12383	12394	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
26	NC_011598	TAAT	3	12527	12537	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_011598	ATA	4	12708	12719	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_011598	ATA	4	13070	13082	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_011598	TTA	4	13205	13216	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_011598	AACT	3	13402	13412	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_011598	TTA	4	13531	13542	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_011598	TTA	4	13827	13838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	215260049
33	NC_011598	TA	7	14111	14123	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	215260049
34	NC_011598	GAAA	3	14401	14412	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	215260049
35	NC_011598	AAT	4	14543	14555	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	215260049
36	NC_011598	TTTA	3	15567	15579	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_011598	TAAA	3	15629	15641	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_011598	ACT	4	15947	15957	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
39	NC_011598	TAAATA	3	15990	16006	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_011598	TA	6	16091	16101	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Eriocheir hepuensis mitochondrion