ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Acyrthosiphon pisum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011594	AATT	3	229	240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	213948226
2	NC_011594	TAA	4	317	328	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	213948226
3	NC_011594	AGG	4	660	671	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	213948226
4	NC_011594	ATTC	3	1171	1182	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	213948226
5	NC_011594	TTAA	3	1519	1529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	213948226
6	NC_011594	TAT	6	1686	1703	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	213948227
7	NC_011594	ATTA	3	2431	2442	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	213948228
8	NC_011594	ATTTT	3	2443	2458	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	213948228
9	NC_011594	TTTTA	3	2782	2797	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	213948229
10	NC_011594	CTA	4	2859	2869	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	213948229
11	NC_011594	ATT	7	3095	3115	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	213948229
12	NC_011594	TAATA	4	3321	3339	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	213948230
13	NC_011594	A	14	3669	3682	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	213948230
14	NC_011594	TTCA	3	3885	3896	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	213948230
15	NC_011594	TAA	4	4078	4089	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	213948231
16	NC_011594	TAA	4	4145	4156	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	213948231
17	NC_011594	TAA	4	4567	4578	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_011594	A	12	4775	4786	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_011594	A	12	4980	4991	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_011594	A	12	5185	5196	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_011594	A	12	5388	5399	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_011594	A	12	5590	5601	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_011594	A	13	5794	5806	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_011594	A	12	6000	6011	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_011594	A	13	6519	6531	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	213948232
26	NC_011594	TAAA	3	6599	6609	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	213948232
27	NC_011594	ATTA	3	6763	6774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	213948232
28	NC_011594	A	29	6845	6873	29	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	213948232
29	NC_011594	AAG	4	7391	7402	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	213948232
30	NC_011594	ATA	4	7534	7546	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	213948232
31	NC_011594	ATTT	3	7595	7605	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	213948232
32	NC_011594	ATAA	3	7608	7618	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	213948232
33	NC_011594	TAA	4	7722	7733	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	213948232
34	NC_011594	TAA	4	7836	7846	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	213948232
35	NC_011594	A	14	7869	7882	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	213948232
36	NC_011594	A	38	7954	7991	38	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_011594	TTTA	3	7992	8003	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_011594	ATA	4	8115	8127	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	213948233
39	NC_011594	ATAAA	4	9040	9058	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	213948233
40	NC_011594	ATA	4	9092	9106	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	213948233
41	NC_011594	A	27	9278	9304	27	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	213948233
42	NC_011594	TAA	4	9492	9502	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	213948234
43	NC_011594	TAAA	3	9651	9663	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	213948234
44	NC_011594	ATT	4	9810	9820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	213948235
45	NC_011594	TAA	4	9847	9858	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	213948235
46	NC_011594	TAT	4	10471	10482	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	213948236
47	NC_011594	TAT	6	10626	10643	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	213948236
48	NC_011594	TAT	4	10834	10845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	213948236
49	NC_011594	AATT	4	11415	11430	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_011594	AAAT	3	11452	11462	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_011594	AAATAA	4	11530	11553	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	213948237
52	NC_011594	ATAAAA	3	11744	11761	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	213948237
53	NC_011594	TAA	4	11860	11873	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	213948237
54	NC_011594	A	12	11887	11898	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	213948237
55	NC_011594	ATA	4	11966	11977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	213948237
56	NC_011594	ATT	4	11972	11983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	213948237
57	NC_011594	AAAT	3	12100	12111	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	213948237
58	NC_011594	AATT	3	12402	12412	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	213948237
59	NC_011594	AAAAT	3	13240	13253	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_011594	AAAT	3	13275	13285	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_011594	AAAT	3	13330	13341	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011594	TTAAAT	3	13431	13449	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_011594	TAAA	3	13691	13703	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_011594	TAAA	4	13929	13944	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_011594	ATA	4	14056	14068	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_011594	TAAAT	3	14230	14244	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_011594	ATA	4	14303	14314	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_011594	ATA	7	14585	14605	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_011594	TTAA	3	14610	14622	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_011594	TTAA	5	14634	14653	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_011594	ATA	4	14655	14666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_011594	TAA	4	14717	14728	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_011594	AAAAT	3	14846	14860	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_011594	AAAAT	3	14970	14984	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_011594	AAAAT	3	15094	15108	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_011594	TA	8	15198	15213	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_011594	AT	14	15246	15272	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_011594	TA	18	15303	15337	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_011594	TA	12	15349	15373	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_011594	TA	6	15375	15386	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_011594	TA	6	15392	15403	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_011594	TA	7	15723	15735	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_011594	TAA	4	16158	16169	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	213948238
84	NC_011594	TTA	4	16490	16501	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	213948238
85	NC_011594	ATA	4	16575	16587	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	213948238
86	NC_011594	TAT	4	16588	16599	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	213948238
87	NC_011594	TTTAA	3	16670	16683	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	213948238
88	NC_011594	ATA	4	16727	16737	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	213948238
89	NC_011594	TTAT	3	16763	16774	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	213948238
90	NC_011594	TTAA	4	16837	16852	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Acyrthosiphon pisum mitochondrion