ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Protohermes concolorus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011524	ATT	4	60	70	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011524	AAT	4	771	782	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	211998788
3	NC_011524	TCTTAT	3	1202	1218	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	211998788
4	NC_011524	TGC	4	1816	1827	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	211998789
5	NC_011524	GGA	4	2072	2082	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	211998789
6	NC_011524	ATTT	3	2435	2446	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	211998789
7	NC_011524	ATT	4	4067	4079	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	211998792
8	NC_011524	AAT	4	4773	4783	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	211998793
9	NC_011524	ATT	4	4808	4818	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	211998793
10	NC_011524	CTTT	3	6104	6114	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_011524	TAA	4	6282	6292	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	211998795
12	NC_011524	CAAA	3	6295	6305	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	211998795
13	NC_011524	TAA	4	6699	6710	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	211998795
14	NC_011524	TTCA	3	6734	6744	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	211998795
15	NC_011524	AAATA	3	6836	6850	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	211998795
16	NC_011524	TAA	4	7242	7252	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	211998795
17	NC_011524	ATATTA	4	8236	8259	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	211998796
18	NC_011524	ATT	5	8685	8699	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	211998796
19	NC_011524	AAAT	3	8963	8973	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	211998796
20	NC_011524	AAAAT	3	9052	9065	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	211998796
21	NC_011524	TAT	4	9101	9112	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211998796
22	NC_011524	TAAAA	3	9125	9138	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	211998796
23	NC_011524	ATAA	4	9557	9572	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	211998797
24	NC_011524	TAA	5	9592	9606	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	211998797
25	NC_011524	AATA	3	9655	9666	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	211998797
26	NC_011524	TTTA	3	10007	10018	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	211998798
27	NC_011524	CTT	4	10925	10936	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	211998799
28	NC_011524	TTTA	3	11304	11315	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	211998799
29	NC_011524	AAAT	3	11593	11603	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	211998800
30	NC_011524	ATA	4	11754	11765	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	211998800
31	NC_011524	TAA	4	12013	12023	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	211998800
32	NC_011524	TAA	4	12950	12960	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_011524	TTA	4	13289	13300	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_011524	TCAA	3	13447	13458	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_011524	AT	6	13472	13483	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_011524	TAAT	3	13484	13494	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011524	AAAT	3	13503	13514	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_011524	TTTTTC	3	13741	13759	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
39	NC_011524	AAATT	3	14243	14257	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_011524	ACT	4	14348	14359	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_011524	TAA	4	14519	14529	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_011524	TTAA	3	14611	14621	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_011524	ATT	4	14664	14675	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_011524	AAAT	3	14704	14714	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_011524	TTTAAT	3	15023	15041	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
46	NC_011524	TA	7	15470	15483	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_011524	TA	6	15551	15562	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_011524	T	14	15563	15576	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011524	TAT	4	15712	15722	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Protohermes concolorus mitochondrion