ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Abispa ephippium mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011520	AAATTT	3	646	664	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	211908571
2	NC_011520	TTA	4	1050	1061	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	211908571
3	NC_011520	TTATAA	3	1212	1229	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	211908571
4	NC_011520	TTTA	3	1528	1538	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011520	TTTA	3	1576	1586	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_011520	TTTA	3	1625	1635	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_011520	TATAA	3	2186	2199	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	211908572
8	NC_011520	CTTC	3	2211	2221	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	211908572
9	NC_011520	ATT	4	2223	2233	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	211908572
10	NC_011520	GAAA	3	2686	2697	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	211908572
11	NC_011520	ATTT	3	2931	2942	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	211908572
12	NC_011520	ATTAAA	3	3492	3509	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	211908572
13	NC_011520	AT	17	3509	3542	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	211908572
14	NC_011520	CAA	4	4593	4604	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	211908573
15	NC_011520	TAAT	3	5109	5121	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	211908575
16	NC_011520	ATA	4	5186	5197	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	211908575
17	NC_011520	TAATAT	3	5532	5549	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	211908575
18	NC_011520	TTTC	3	5930	5941	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	211908576
19	NC_011520	TAAT	3	6298	6308	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	211908576
20	NC_011520	AAATT	3	6479	6493	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_011520	ATT	4	6715	6725	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	211908577
22	NC_011520	ATT	4	7111	7122	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011520	A	25	7357	7381	25	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	211908578
24	NC_011520	ATT	4	7396	7407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211908578
25	NC_011520	ATA	4	7539	7549	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	211908578
26	NC_011520	TAC	4	7638	7649	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	211908578
27	NC_011520	TTA	4	7790	7800	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	211908578
28	NC_011520	A	12	8015	8026	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	211908578
29	NC_011520	TAA	4	8499	8511	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	211908578
30	NC_011520	ATT	4	8548	8559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211908578
31	NC_011520	TAAA	3	8757	8768	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	211908578
32	NC_011520	TAA	4	8811	8821	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	211908578
33	NC_011520	TTA	4	9327	9338	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211908579
34	NC_011520	ATC	4	9399	9410	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	211908579
35	NC_011520	TAT	4	9589	9599	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	211908579
36	NC_011520	ATA	4	9989	10000	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	211908579
37	NC_011520	AT	7	10008	10020	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	211908579
38	NC_011520	TTAAA	3	10049	10063	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	211908579
39	NC_011520	AAAC	3	10589	10599	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	211908580
40	NC_011520	TTTCTT	3	10627	10644	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	211908580
41	NC_011520	TTAA	3	10694	10706	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	211908580
42	NC_011520	AT	6	11073	11083	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	211908581
43	NC_011520	TAT	5	11193	11207	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	211908581
44	NC_011520	ATTT	3	11292	11302	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	211908581
45	NC_011520	TTA	5	11393	11407	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	211908581
46	NC_011520	ATT	4	11520	11530	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	211908582
47	NC_011520	TAT	4	12029	12040	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211908582
48	NC_011520	TTTTA	4	12161	12180	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	211908582
49	NC_011520	TTTA	3	12545	12555	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	211908582
50	NC_011520	ATAA	4	12594	12609	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	211908582
51	NC_011520	ATA	4	12809	12819	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_011520	TC	6	12913	12924	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
53	NC_011520	TA	14	13090	13117	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_011520	TTA	4	13574	13585	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211908583
55	NC_011520	TAA	4	13655	13666	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	211908583
56	NC_011520	TTA	4	13661	13672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	211908583
57	NC_011520	ATT	4	14442	14453	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_011520	TTATAA	3	14707	14724	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_011520	TAA	4	15250	15261	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_011520	ATT	6	15330	15347	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_011520	TTATAA	3	15387	15404	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_011520	AATT	3	15935	15946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011520	ATT	4	16058	16068	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_011520	TTAT	3	16375	16385	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_011520	ATT	4	16479	16490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_011520	ATT	4	16763	16774	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_011520	TA	29	16900	16954	55	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Abispa ephippium mitochondrion