ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Babesia bovis T2Bo apicoplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011395	TAT	4	92	102	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011395	TA	7	384	396	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_011395	CT	6	1142	1152	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011395	TA	11	2284	2304	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011395	TTAG	3	2792	2802	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	209892871
6	NC_011395	TTA	4	2960	2971	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	209892871
7	NC_011395	ATT	4	3085	3097	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	209892871
8	NC_011395	TAT	4	3661	3673	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	209892872
9	NC_011395	AT	6	3695	3705	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	209892872
10	NC_011395	AGTA	3	4345	4355	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	209892873
11	NC_011395	ATTT	3	4633	4643	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	209892873
12	NC_011395	TTATA	3	5053	5068	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	209892873
13	NC_011395	ATTTT	3	7809	7822	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	209892875
14	NC_011395	TCT	4	7835	7847	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	209892875
15	NC_011395	TTA	5	7897	7910	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	209892875
16	NC_011395	T	13	7915	7927	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	209892875
17	NC_011395	T	12	7952	7963	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	209892875
18	NC_011395	ATA	4	8198	8209	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	209892875
19	NC_011395	TAT	4	8247	8259	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	209892875
20	NC_011395	AT	6	8663	8673	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	209892875
21	NC_011395	TGA	4	8858	8869	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	209892875
22	NC_011395	TTAT	3	9136	9147	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	209892875
23	NC_011395	TA	6	9808	9818	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	209892875
24	NC_011395	ATA	4	9892	9902	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011395	TTTA	3	10020	10030	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_011395	T	14	10070	10083	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	209892876
27	NC_011395	TTTAT	3	10560	10573	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_011395	TAT	4	11654	11664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	209892877
29	NC_011395	TTTAA	3	11850	11864	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	209892877
30	NC_011395	TTTA	3	12009	12019	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	209892877
31	NC_011395	T	13	12123	12135	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	209892877
32	NC_011395	ATTAAA	3	13012	13029	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	209892878
33	NC_011395	TTAG	3	13049	13059	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	209892878
34	NC_011395	TAT	4	14263	14273	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	209892879
35	NC_011395	TTTA	3	15314	15324	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_011395	ATTT	3	15422	15433	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	209892881
37	NC_011395	TTTA	3	18174	18184	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	209892884
38	NC_011395	TTAAA	3	18329	18344	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_011395	AATT	3	18696	18706	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_011395	TTAT	3	18720	18732	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	209892885
41	NC_011395	AATT	3	20072	20083	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	209892888
42	NC_011395	AATT	3	20474	20485	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	209892889
43	NC_011395	TAT	4	20966	20977	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	209892890
44	NC_011395	AT	6	21222	21233	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	209892890
45	NC_011395	AT	6	21324	21334	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	209892890
46	NC_011395	ATTTT	3	21502	21515	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	209892890
47	NC_011395	TTTTA	3	21830	21843	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	209892891
48	NC_011395	TAAAAA	3	21976	21993	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	209892892
49	NC_011395	AAAT	3	22730	22741	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_011395	ATAAGA	3	23227	23244	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	209892893
51	NC_011395	TA	6	24010	24020	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	209892895
52	NC_011395	TTAA	3	24372	24384	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	209892896
53	NC_011395	TATT	3	25206	25217	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	209892897
54	NC_011395	ATT	4	25752	25763	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	209892898
55	NC_011395	TATT	3	25765	25775	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	209892898
56	NC_011395	TGTA	3	27122	27133	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	209892900
57	NC_011395	TATT	3	27470	27481	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	209892900
58	NC_011395	TAT	4	27681	27691	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	209892901
59	NC_011395	TATT	3	27851	27863	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	209892901
60	NC_011395	AGTT	3	28196	28206	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_011395	TAAA	3	28290	28301	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_011395	TA	11	29208	29230	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_011395	ATGT	3	29499	29509	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	209892902
64	NC_011395	TAC	4	29924	29935	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
65	NC_011395	TA	6	30000	30010	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_011395	ATTTAT	3	30193	30209	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_011395	TTTA	3	30397	30408	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_011395	ATTT	3	31458	31468	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_011395	TACT	3	31871	31882	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_011395	TTAAA	3	32488	32502	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_011395	ATTTT	3	32967	32981	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_011395	T	12	33125	33136	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011395	ATT	4	33159	33171	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_011395	TAT	4	33183	33193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_011395	TAT	4	33391	33401	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_011395	TA	7	33683	33695	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_011395	CT	6	34441	34451	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Babesia bovis T2Bo apicoplast