ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chaetosoma scaritides mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011324	AT	6	340	350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	208433947
2	NC_011324	TAT	4	404	414	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433947
3	NC_011324	TAA	4	451	462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433947
4	NC_011324	TAATTT	3	620	637	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	208433947
5	NC_011324	ATT	4	869	880	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433947
6	NC_011324	ATA	5	886	900	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433947
7	NC_011324	TTAA	3	1083	1093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	208433947
8	NC_011324	CTTAA	3	1266	1280	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
9	NC_011324	CT	6	1783	1793	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	208433948
10	NC_011324	GGA	4	2061	2071	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	208433948
11	NC_011324	TTTG	3	2244	2254	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	208433948
12	NC_011324	ATTT	4	2420	2435	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	208433948
13	NC_011324	TA	7	3812	3825	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_011324	TAT	4	4626	4637	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433951
15	NC_011324	TAA	5	5610	5624	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433953
16	NC_011324	TTTATA	3	6156	6173	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_011324	TTA	4	6389	6400	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433954
18	NC_011324	ATT	4	6638	6649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433954
19	NC_011324	TAAA	3	6658	6669	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433954
20	NC_011324	TAT	4	6694	6705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433954
21	NC_011324	AATA	3	6853	6864	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433954
22	NC_011324	ATTA	3	7004	7016	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	208433954
23	NC_011324	AAG	4	7401	7412	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	208433954
24	NC_011324	AATT	3	7699	7711	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	208433954
25	NC_011324	AATA	3	7942	7952	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	208433954
26	NC_011324	TAA	4	8093	8105	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	208433955
27	NC_011324	ATT	4	8491	8502	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433955
28	NC_011324	ATAA	3	8609	8620	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433955
29	NC_011324	AATA	3	8805	8815	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	208433955
30	NC_011324	ATT	7	9144	9165	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433955
31	NC_011324	TAA	4	9207	9218	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433955
32	NC_011324	CAAT	3	9228	9239	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	208433955
33	NC_011324	TAA	5	9587	9601	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433956
34	NC_011324	ATTT	3	9980	9992	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	208433957
35	NC_011324	AATT	3	10170	10181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	208433957
36	NC_011324	AAT	4	10863	10874	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433958
37	NC_011324	TAT	4	10984	10994	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433958
38	NC_011324	TA	6	11522	11533	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	208433959
39	NC_011324	AAAT	3	11555	11565	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	208433959
40	NC_011324	AAAAG	3	11657	11670	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	208433959
41	NC_011324	A	15	11679	11693	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	208433959
42	NC_011324	AAATAT	3	11903	11920	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	208433959
43	NC_011324	ATAAAA	3	12184	12201	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	208433959
44	NC_011324	AAT	4	12518	12529	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_011324	TAAA	3	12993	13004	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011324	ATTC	4	13025	13040	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
47	NC_011324	TAA	4	13258	13269	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_011324	ATT	5	13269	13283	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_011324	TAA	4	13439	13450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_011324	ATA	4	13677	13687	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_011324	TAA	4	13785	13795	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_011324	TAA	4	13817	13828	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_011324	TAA	4	14018	14030	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_011324	TAA	5	14513	14528	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_011324	AATA	4	14547	14562	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_011324	ATA	4	14971	14982	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_011324	AAAT	3	14993	15003	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_011324	ATA	5	15167	15181	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_011324	AAAT	3	15192	15202	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_011324	TAAA	3	15460	15471	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chaetosoma scaritides mitochondrion