ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sphaerius sp. BT0074 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011322	ATTT	3	407	418	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	208433933
2	NC_011322	TAT	4	583	593	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433933
3	NC_011322	TAT	4	618	629	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433933
4	NC_011322	TAT	7	651	671	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433933
5	NC_011322	TAAAT	3	846	859	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	208433933
6	NC_011322	ATA	4	884	894	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	208433933
7	NC_011322	AT	6	1013	1023	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	208433933
8	NC_011322	TTTAAA	3	1321	1339	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
9	NC_011322	AGG	4	2093	2104	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	208433934
10	NC_011322	GAAA	3	2212	2223	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	208433934
11	NC_011322	ATATT	3	3750	3764	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_011322	TTTA	3	3923	3935	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	208433936
13	NC_011322	TATTT	4	4247	4266	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	208433937
14	NC_011322	TATT	3	4814	4825	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	208433938
15	NC_011322	TATTT	3	4969	4983	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	208433938
16	NC_011322	TAT	4	5550	5560	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433939
17	NC_011322	CTTT	3	6136	6146	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_011322	TTTATA	3	6162	6180	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_011322	ATA	4	6347	6358	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433940
20	NC_011322	ATT	4	6369	6379	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433940
21	NC_011322	AAAT	3	6414	6425	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433940
22	NC_011322	ATA	4	6561	6572	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	208433940
23	NC_011322	AAAT	4	6885	6899	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	208433940
24	NC_011322	TTA	4	7175	7186	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433940
25	NC_011322	TAA	4	7284	7295	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433940
26	NC_011322	AT	7	7949	7961	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	208433940
27	NC_011322	AT	7	8033	8046	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_011322	TAA	4	8154	8165	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433941
29	NC_011322	ATT	4	8515	8526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433941
30	NC_011322	ATA	4	8940	8951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433941
31	NC_011322	AAAT	4	8991	9005	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	208433941
32	NC_011322	AACTAA	3	9110	9128	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	208433941
33	NC_011322	ATA	8	9128	9153	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	208433941
34	NC_011322	TATAAA	3	9312	9329	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	208433941
35	NC_011322	TAAAA	3	9336	9349	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	208433941
36	NC_011322	TAA	6	9617	9634	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	208433942
37	NC_011322	AGAA	3	9782	9793	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_011322	TTAT	3	10039	10050	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	208433943
39	NC_011322	ATTAAT	4	10101	10124	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	208433943
40	NC_011322	AAT	12	10104	10139	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433943
41	NC_011322	ATT	4	10710	10720	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433944
42	NC_011322	AAT	4	10931	10942	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433944
43	NC_011322	ATTT	3	10945	10957	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	208433944
44	NC_011322	ATT	7	11237	11258	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433944
45	NC_011322	TTA	4	11396	11406	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433944
46	NC_011322	TTATA	3	11436	11450	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	208433944
47	NC_011322	TTAA	4	11481	11496	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	208433944
48	NC_011322	AATAA	4	11616	11634	19	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	208433945
49	NC_011322	AATT	3	11669	11680	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	208433945
50	NC_011322	TCC	4	11853	11864	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	208433945
51	NC_011322	AAAT	3	12016	12027	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433945
52	NC_011322	TAA	4	12120	12132	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	208433945
53	NC_011322	AAT	4	12290	12302	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	208433945
54	NC_011322	AAT	4	12477	12488	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433945
55	NC_011322	TAT	4	13509	13519	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_011322	AAAT	3	13558	13569	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_011322	ATT	5	13631	13645	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_011322	ATTTA	4	14081	14100	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_011322	TTAA	3	14636	14647	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_011322	TTAAT	3	14663	14676	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_011322	TAA	4	14767	14779	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_011322	T	15	15091	15105	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sphaerius sp. BT0074 mitochondrion