ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cyphon sp. BT0012 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011320	AT	6	1006	1017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	208433919
2	NC_011320	ATTA	3	1088	1099	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	208433919
3	NC_011320	TTTAAA	3	1476	1494	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_011320	GAAA	3	2362	2372	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	208433920
5	NC_011320	TAA	4	3269	3280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433921
6	NC_011320	CAA	4	4188	4199	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	208433923
7	NC_011320	CA	6	4520	4530	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	208433923
8	NC_011320	TTAC	3	4667	4677	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	208433923
9	NC_011320	TAA	5	5694	5708	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433925
10	NC_011320	TAA	4	5730	5741	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433925
11	NC_011320	TTTA	3	6351	6361	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011320	TAAA	3	6428	6439	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	208433926
13	NC_011320	AAAGAA	3	8004	8021	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	208433926
14	NC_011320	AATT	3	8281	8291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	208433927
15	NC_011320	TAAA	3	8355	8366	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433927
16	NC_011320	ATAA	4	8999	9014	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	208433927
17	NC_011320	A	13	9009	9021	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	208433927
18	NC_011320	ATATA	3	9030	9043	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	208433927
19	NC_011320	AAAAT	3	9210	9223	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	208433927
20	NC_011320	ATA	4	9255	9266	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433927
21	NC_011320	AAAG	3	9278	9288	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	208433927
22	NC_011320	TAA	4	9334	9345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433927
23	NC_011320	TA	6	9705	9715	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	208433928
24	NC_011320	TAT	4	11188	11198	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433930
25	NC_011320	TAAA	3	11713	11725	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	208433931
26	NC_011320	AAAT	5	11749	11767	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	208433931
27	NC_011320	A	14	11881	11894	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	208433931
28	NC_011320	ATAAAA	3	12386	12403	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	208433931
29	NC_011320	ATAA	3	12404	12415	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433931
30	NC_011320	TAAA	3	13671	13682	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011320	AATT	3	14006	14016	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_011320	ATA	5	14326	14341	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_011320	CATTTA	3	14506	14524	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
34	NC_011320	ATT	4	14786	14797	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_011320	A	14	14833	14846	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_011320	AATA	5	15111	15129	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
37	NC_011320	TAAC	3	15156	15166	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_011320	AT	6	15173	15183	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_011320	TA	6	15185	15195	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_011320	T	13	15232	15244	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_011320	TA	6	15274	15284	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_011320	TAT	4	15302	15312	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_011320	TA	6	15323	15334	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_011320	TA	14	15466	15493	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_011320	ATA	4	15500	15512	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_011320	TA	12	15504	15525	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_011320	TA	7	15538	15552	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_011320	AT	7	15564	15578	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_011320	ATCA	3	15869	15880	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cyphon sp. BT0012 mitochondrion