ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Polystoechotes punctatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011278	TTTAT	3	159	173	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011278	TAT	5	578	591	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	205351291
3	NC_011278	ATTT	4	946	961	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	205351291
4	NC_011278	TTTAAA	3	1395	1413	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_011278	TACT	3	2192	2202	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	205351292
6	NC_011278	TTTG	3	2422	2432	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	205351292
7	NC_011278	TATT	4	4033	4049	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	205351294
8	NC_011278	TATTT	3	5960	5973	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	205351297
9	NC_011278	TATT	3	6078	6089	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_011278	GAA	4	6239	6250	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_011278	CTTT	3	6262	6272	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011278	ATAAA	4	7004	7022	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	205351298
13	NC_011278	TTA	4	7301	7312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	205351298
14	NC_011278	ATTA	3	7441	7452	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	205351298
15	NC_011278	TGAA	3	7494	7504	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	205351298
16	NC_011278	ATA	4	7694	7704	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	205351298
17	NC_011278	TAA	4	8072	8082	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	205351298
18	NC_011278	TAA	5	8115	8130	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	205351298
19	NC_011278	AATT	3	8257	8268	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	205351299
20	NC_011278	TAA	4	8284	8295	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	205351299
21	NC_011278	TAAA	3	9043	9053	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	205351299
22	NC_011278	AAAAT	4	9216	9235	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	205351299
23	NC_011278	TAA	5	9271	9284	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	205351299
24	NC_011278	GATT	3	9321	9332	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	205351299
25	NC_011278	TAAA	3	9418	9429	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	205351299
26	NC_011278	AATATA	3	9446	9463	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	205351299
27	NC_011278	ATT	5	9956	9970	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_011278	TTTA	3	10173	10184	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	205351301
29	NC_011278	TAT	4	10253	10265	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	205351301
30	NC_011278	TTA	5	10445	10459	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	205351301
31	NC_011278	ATT	4	10857	10867	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	205351302
32	NC_011278	TTA	4	11094	11105	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	205351302
33	NC_011278	CAAT	3	11461	11472	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	205351302
34	NC_011278	ATT	4	11545	11555	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	205351302
35	NC_011278	ATA	4	11724	11734	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	205351303
36	NC_011278	A	14	11891	11904	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	205351303
37	NC_011278	AGA	4	12083	12093	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	205351303
38	NC_011278	ATA	5	12198	12211	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	205351303
39	NC_011278	TAAAT	3	12352	12367	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	205351303
40	NC_011278	TAA	4	12621	12633	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	205351303
41	NC_011278	TCAT	3	13026	13037	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_011278	ATT	4	13139	13150	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_011278	ATTT	3	13436	13446	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_011278	AAAAT	3	13526	13539	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_011278	ATT	4	14002	14013	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_011278	TTA	4	14030	14041	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_011278	TAAA	3	14675	14685	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_011278	ATTT	3	14703	14714	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011278	TAA	4	14992	15002	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_011278	ATA	4	15253	15264	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_011278	TAAA	4	15293	15308	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_011278	TA	6	15327	15337	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_011278	ACT	5	15408	15422	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
54	NC_011278	T	19	15421	15439	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_011278	TAA	4	15470	15481	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011278	TAT	4	15485	15496	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_011278	TTA	5	15576	15589	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_011278	TA	7	15679	15692	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_011278	TA	10	15793	15813	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_011278	TTA	4	15808	15819	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_011278	TAA	4	16024	16034	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Polystoechotes punctatus mitochondrion