ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Corydalus cornutus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011276	TAATT	3	208	222	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	205351319
2	NC_011276	TAT	4	418	429	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	205351319
3	NC_011276	ATT	4	432	442	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	205351319
4	NC_011276	ATT	4	624	635	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	205351319
5	NC_011276	GGA	4	2084	2094	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	205351320
6	NC_011276	AATT	3	3231	3243	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	205351321
7	NC_011276	CTCTT	3	3251	3264	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	205351321
8	NC_011276	TTTTA	3	3872	3885	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	205351322
9	NC_011276	ATT	4	4073	4085	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	205351323
10	NC_011276	CA	6	4353	4363	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	205351323
11	NC_011276	ATT	4	4810	4822	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	205351324
12	NC_011276	CTTT	3	6103	6113	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_011276	TTTA	3	6189	6199	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_011276	TAA	4	6284	6294	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	205351326
15	NC_011276	TTA	4	7135	7146	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	205351326
16	NC_011276	AAG	4	7384	7395	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	205351326
17	NC_011276	CCAA	3	7423	7435	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	205351326
18	NC_011276	AAAT	3	7479	7489	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	205351326
19	NC_011276	TAA	4	7678	7690	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	205351326
20	NC_011276	CATAA	3	8062	8075	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	205351327
21	NC_011276	ATA	4	8120	8132	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	205351327
22	NC_011276	AAAT	3	8961	8971	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	205351327
23	NC_011276	CTAAAA	3	9011	9028	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	205351327
24	NC_011276	CAAA	3	9047	9057	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	205351327
25	NC_011276	AAT	4	9094	9104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	205351327
26	NC_011276	TA	6	9123	9133	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	205351327
27	NC_011276	AAAT	3	9557	9568	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	205351328
28	NC_011276	TTTA	3	10005	10016	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	205351329
29	NC_011276	TTA	5	10085	10098	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	205351329
30	NC_011276	ATTA	3	10170	10180	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	205351329
31	NC_011276	TTA	4	10268	10279	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	205351329
32	NC_011276	TAAA	3	11933	11944	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	205351331
33	NC_011276	AACT	3	11967	11979	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	205351331
34	NC_011276	ACAAA	3	12151	12164	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	205351331
35	NC_011276	ATT	4	13294	13305	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_011276	TAAA	3	13713	13724	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011276	AATAT	3	14162	14176	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_011276	AAATT	3	14229	14243	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_011276	ACT	4	14334	14345	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_011276	ATA	4	14502	14513	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_011276	TTAA	3	14595	14605	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_011276	TA	7	14766	14779	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_011276	AATT	3	15209	15220	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_011276	TA	6	15246	15256	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_011276	TAA	4	15363	15373	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_011276	TA	7	15540	15552	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_011276	AAAAT	3	15670	15684	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Corydalus cornutus mitochondrion