ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cordyceps brongniartii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011194	AT	6	126	136	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011194	AATA	3	1110	1120	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_011194	GAAA	3	2164	2175	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_011194	AAT	4	2490	2501	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_011194	ATT	4	3422	3433	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011194	TAT	4	4077	4089	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_011194	TGAA	3	4244	4254	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	19793575
8	NC_011194	AT	6	4258	4268	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793575
9	NC_011194	ATA	4	4369	4380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19793575
10	NC_011194	AAT	4	4602	4612	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19793575
11	NC_011194	TTAGC	3	4645	4658	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	19793575
12	NC_011194	ATT	4	4718	4729	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793575
13	NC_011194	ATT	4	4814	4824	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19793575
14	NC_011194	TA	7	5001	5013	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19793575
15	NC_011194	TAA	4	5239	5250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19793575
16	NC_011194	AT	7	5639	5654	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_011194	AAAG	3	5729	5740	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_011194	TA	6	6437	6448	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_011194	TA	8	6551	6565	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_011194	TGTA	3	6586	6597	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_011194	AT	9	7327	7343	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_011194	ATA	4	7527	7537	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_011194	TAA	4	7541	7552	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_011194	AAAC	3	7669	7681	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
25	NC_011194	TTAT	3	9602	9613	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	19793575
26	NC_011194	ATA	4	9907	9918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19793575
27	NC_011194	TAT	4	10006	10020	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19793575
28	NC_011194	AT	6	10183	10193	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793575
29	NC_011194	TAT	4	10356	10368	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19793575
30	NC_011194	ATAA	3	10653	10664	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_011194	TTA	4	10686	10696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_011194	TAT	5	10767	10781	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_011194	AGCAGG	3	10841	10858	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	5 %	19793575
34	NC_011194	ATT	5	10991	11005	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19793575
35	NC_011194	ATT	4	11417	11427	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19793575
36	NC_011194	TTAT	3	11907	11917	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011194	TTATT	3	11944	11957	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_011194	ATTA	4	12068	12083	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011194	TA	6	12252	12262	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793575
40	NC_011194	TAA	4	12619	12630	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19793575
41	NC_011194	TTTA	3	12693	12704	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	19793575
42	NC_011194	TAT	4	13171	13182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793575
43	NC_011194	ATT	4	13364	13375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793575
44	NC_011194	AGT	4	13569	13580	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	19793575
45	NC_011194	TAGGTT	3	13783	13800	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	19793575
46	NC_011194	AT	6	13985	13995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793575
47	NC_011194	AT	6	14204	14214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793575
48	NC_011194	TCTA	3	14227	14238	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	19793575
49	NC_011194	TAAAAA	3	14326	14344	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	19793575
50	NC_011194	CTTT	3	14839	14849	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	19793575
51	NC_011194	ATA	7	15004	15024	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19793575
52	NC_011194	ATAAA	3	15147	15160	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	19793575
53	NC_011194	AT	9	16080	16096	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	19793575
54	NC_011194	TAT	4	16878	16889	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793575
55	NC_011194	TAT	5	17768	17782	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19793575
56	NC_011194	GATT	4	18380	18395	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	19793575
57	NC_011194	ATT	4	18882	18894	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19793575
58	NC_011194	TAT	7	19218	19238	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19793575
59	NC_011194	AAT	4	19928	19939	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19793575
60	NC_011194	TTTA	3	20252	20264	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	19793575
61	NC_011194	ATT	4	21162	21174	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19793575
62	NC_011194	AGTATA	3	22776	22793	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_011194	ATT	4	22868	22878	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_011194	AG	6	23107	23117	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_011194	AT	6	23150	23160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_011194	TAG	4	23446	23457	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	19793576
67	NC_011194	TTTTA	3	23949	23963	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	19793576
68	NC_011194	AATT	3	24258	24268	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793576
69	NC_011194	ATT	8	25262	25286	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793576
70	NC_011194	ATTT	4	25567	25583	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	19793576
71	NC_011194	TA	6	25855	25865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793576
72	NC_011194	ATTT	3	26392	26404	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	19793576
73	NC_011194	TTA	4	26768	26779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793576
74	NC_011194	GTA	4	26961	26971	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	19793576
75	NC_011194	AT	7	27709	27723	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_011194	TA	6	27842	27852	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793576
77	NC_011194	TAA	4	27909	27921	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	19793576
78	NC_011194	AGTA	3	27960	27972	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_011194	AT	6	28003	28013	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_011194	TAA	4	28217	28228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19793576
81	NC_011194	ATTAGG	3	28589	28606	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	19793576
82	NC_011194	T	13	28953	28965	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_011194	TAA	4	29116	29127	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_011194	AATG	3	30202	30212	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_011194	TAT	4	30832	30844	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_011194	TTA	4	31846	31856	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19793576
87	NC_011194	ATT	4	32255	32266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_011194	TA	6	32606	32616	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19793576
89	NC_011194	TTTTAT	3	32630	32647	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	19793576
90	NC_011194	ATA	4	32810	32820	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19793576
91	NC_011194	TAT	4	32972	32983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19793576
92	NC_011194	ATA	5	32998	33012	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	19793576
93	NC_011194	TTTTA	3	33165	33179	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_011194	TAA	4	33354	33365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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