ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cordyceps brongniartii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011194	AAT	4	2490	2501	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_011194	ATT	4	3422	3433	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011194	TAT	4	4077	4089	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_011194	ATA	4	4369	4380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	19793575
5	NC_011194	AAT	4	4602	4612	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	19793575
6	NC_011194	ATT	4	4718	4729	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793575
7	NC_011194	ATT	4	4814	4824	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	19793575
8	NC_011194	TAA	4	5239	5250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	19793575
9	NC_011194	ATA	4	7527	7537	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_011194	TAA	4	7541	7552	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_011194	ATA	4	9907	9918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	19793575
12	NC_011194	TAT	4	10006	10020	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	19793575
13	NC_011194	TAT	4	10356	10368	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	19793575
14	NC_011194	TTA	4	10686	10696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_011194	TAT	5	10767	10781	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_011194	ATT	5	10991	11005	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	19793575
17	NC_011194	ATT	4	11417	11427	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	19793575
18	NC_011194	TAA	4	12619	12630	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	19793575
19	NC_011194	TAT	4	13171	13182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793575
20	NC_011194	ATT	4	13364	13375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793575
21	NC_011194	AGT	4	13569	13580	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	19793575
22	NC_011194	ATA	7	15004	15024	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	19793575
23	NC_011194	TAT	4	16878	16889	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793575
24	NC_011194	TAT	5	17768	17782	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	19793575
25	NC_011194	ATT	4	18882	18894	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	19793575
26	NC_011194	TAT	7	19218	19238	21	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	19793575
27	NC_011194	AAT	4	19928	19939	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	19793575
28	NC_011194	ATT	4	21162	21174	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	19793575
29	NC_011194	ATT	4	22868	22878	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_011194	TAG	4	23446	23457	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	19793576
31	NC_011194	ATT	8	25262	25286	25	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793576
32	NC_011194	TTA	4	26768	26779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793576
33	NC_011194	GTA	4	26961	26971	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	19793576
34	NC_011194	TAA	4	27909	27921	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	19793576
35	NC_011194	TAA	4	28217	28228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	19793576
36	NC_011194	TAA	4	29116	29127	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_011194	TAT	4	30832	30844	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_011194	TTA	4	31846	31856	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	19793576
39	NC_011194	ATT	4	32255	32266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_011194	ATA	4	32810	32820	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	19793576
41	NC_011194	TAT	4	32972	32983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19793576
42	NC_011194	ATA	5	32998	33012	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	19793576
43	NC_011194	TAA	4	33354	33365	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cordyceps brongniartii mitochondrion