ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cicer arietinum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011163	CAG	4	1013	1024	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	197294094
2	NC_011163	TTA	4	4840	4851	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011163	TAA	5	14709	14722	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_011163	AAT	4	15690	15701	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_011163	CAT	4	19901	19911	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	197294104
6	NC_011163	TGC	4	20226	20237	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	197294104
7	NC_011163	ATA	5	24790	24804	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_011163	ATA	4	31687	31698	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_011163	GAA	4	32579	32590	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_011163	ATT	4	33739	33749	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_011163	ATT	4	34453	34464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	197294112
12	NC_011163	TGA	4	35070	35080	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	197294112
13	NC_011163	GAA	4	38901	38913	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	197294113
14	NC_011163	TAA	4	43327	43338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	197294114
15	NC_011163	ATT	4	43377	43389	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	197294114
16	NC_011163	TAA	4	43593	43604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	197294114
17	NC_011163	ATA	8	44619	44643	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
18	NC_011163	GTT	5	46346	46360	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	197294116
19	NC_011163	TTA	4	48224	48234	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_011163	TAT	5	48281	48295	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_011163	TGT	4	49970	49981	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	197294119
22	NC_011163	TTA	4	53778	53789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_011163	AAT	4	53850	53861	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_011163	ATG	4	53879	53889	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011163	TAT	5	54310	54325	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_011163	ATT	4	55226	55236	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_011163	ATA	4	55884	55894	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_011163	ATG	4	56761	56772	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	197294122
29	NC_011163	AAT	4	57771	57782	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_011163	ATA	4	58147	58158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_011163	TAA	4	63520	63532	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_011163	ATA	5	65173	65186	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_011163	GAA	4	67030	67041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_011163	ACC	4	70021	70033	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	197294156
35	NC_011163	AAT	7	73243	73263	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	197294156
36	NC_011163	TAT	5	78857	78871	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	197294156
37	NC_011163	TAC	4	78910	78924	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	197294156
38	NC_011163	TAT	4	79210	79220	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	197294156
39	NC_011163	TAA	4	80106	80117	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	197294156
40	NC_011163	TTA	4	82212	82224	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	197294156
41	NC_011163	TTA	4	82270	82281	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	197294156
42	NC_011163	GAT	4	83282	83292	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	197294156
43	NC_011163	ATT	4	83328	83338	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	197294156
44	NC_011163	GAT	4	84639	84649	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	197294156
45	NC_011163	ATT	4	84869	84879	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	197294156
46	NC_011163	ATT	4	84995	85005	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	197294156
47	NC_011163	AGA	4	86275	86286	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	197294156
48	NC_011163	ATA	4	92311	92323	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	197294156
49	NC_011163	ATA	4	105557	105567	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_011163	ATA	4	111632	111643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_011163	GAA	4	111828	111838	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	197294158
52	NC_011163	AGA	5	115281	115295	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	197294160
53	NC_011163	ATT	4	116252	116263	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_011163	TAT	4	122496	122508	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_011163	ATT	4	122529	122541	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_011163	TAA	5	122623	122638	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_011163	CTT	4	123699	123710	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	197294168
58	NC_011163	AAT	4	124355	124367	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	197294168

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cicer arietinum chloroplast