ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cicer arietinum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011163	CAG	4	1013	1024	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	197294094
2	NC_011163	AAGT	3	1119	1129	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	197294094
3	NC_011163	A	12	3860	3871	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_011163	AAAT	3	4048	4058	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011163	GATG	3	4271	4283	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_011163	TTA	4	4840	4851	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_011163	T	16	6677	6692	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_011163	A	18	9180	9197	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_011163	TACCTA	3	9293	9309	17	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
10	NC_011163	A	16	9394	9409	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_011163	AAATA	3	10445	10458	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_011163	ATAA	4	12407	12422	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_011163	TAAA	5	13084	13103	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_011163	AT	7	13477	13492	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_011163	TTTGT	3	13915	13928	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_011163	TCTA	3	13987	13997	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_011163	ATACAT	3	14569	14586	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
18	NC_011163	TAA	5	14709	14722	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_011163	AATT	3	15635	15646	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	197294102
20	NC_011163	AAT	4	15690	15701	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_011163	T	12	16389	16400	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	197294103
22	NC_011163	TA	6	17792	17802	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	197294103
23	NC_011163	T	12	18507	18518	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_011163	A	17	18732	18748	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_011163	ACTT	3	19838	19849	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	197294104
26	NC_011163	CAT	4	19901	19911	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	197294104
27	NC_011163	TGC	4	20226	20237	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	197294104
28	NC_011163	TATT	3	22479	22489	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	197294105
29	NC_011163	ATCT	3	24445	24456	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_011163	TA	6	24459	24471	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_011163	AT	12	24567	24589	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_011163	AT	7	24726	24739	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_011163	ATA	5	24790	24804	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_011163	AG	6	24920	24930	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	197294107
35	NC_011163	TTGTT	3	25567	25580	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_011163	AAGC	3	26312	26322	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	197294108
37	NC_011163	TA	6	26616	26626	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	197294108
38	NC_011163	TATT	3	28920	28931	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_011163	AT	8	28976	28991	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_011163	AT	10	29365	29385	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_011163	TTCT	3	29847	29858	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
42	NC_011163	T	19	30943	30961	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_011163	TTTA	3	31302	31312	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_011163	TTTC	3	31633	31644	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_011163	ATA	4	31687	31698	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_011163	A	14	31695	31708	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_011163	TAAA	3	31763	31773	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_011163	AAAT	3	32104	32115	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_011163	T	13	32362	32374	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011163	GAA	4	32579	32590	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_011163	T	17	33074	33090	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_011163	ATT	4	33739	33749	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_011163	GGAA	3	34175	34186	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	197294112
54	NC_011163	AT	6	34398	34408	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	197294112
55	NC_011163	ATT	4	34453	34464	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	197294112
56	NC_011163	TATC	3	34554	34564	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	197294112
57	NC_011163	TTTTC	3	34769	34783	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	197294112
58	NC_011163	TGA	4	35070	35080	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	197294112
59	NC_011163	GTAG	3	36496	36506	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	197294112
60	NC_011163	ATTC	3	38074	38084	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	197294113
61	NC_011163	AAAT	3	38118	38129	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	197294113
62	NC_011163	TA	6	38225	38235	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	197294113
63	NC_011163	TTCG	3	38301	38311	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	197294113
64	NC_011163	ATTTCT	3	38341	38357	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	197294113
65	NC_011163	ATTT	3	38456	38466	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	197294113
66	NC_011163	GAA	4	38901	38913	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	197294113
67	NC_011163	AT	6	41172	41182	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	197294114
68	NC_011163	A	12	41933	41944	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	197294114
69	NC_011163	ACAG	3	42273	42283	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	197294114
70	NC_011163	A	15	42545	42559	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	197294114
71	NC_011163	A	14	42652	42665	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	197294114
72	NC_011163	TAA	4	43327	43338	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	197294114
73	NC_011163	ATT	4	43377	43389	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	197294114
74	NC_011163	TAA	4	43593	43604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	197294114
75	NC_011163	A	15	44450	44464	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	197294114
76	NC_011163	ATA	8	44619	44643	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
77	NC_011163	T	12	44760	44771	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_011163	GTT	5	46346	46360	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	197294116
79	NC_011163	A	12	46710	46721	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_011163	T	18	46812	46829	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_011163	ATTA	3	46878	46889	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011163	AAAG	3	47133	47144	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011163	CAAA	3	47419	47429	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_011163	TGAA	3	47571	47581	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_011163	A	12	47914	47925	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_011163	TTA	4	48224	48234	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_011163	TAT	5	48281	48295	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_011163	AATT	3	49449	49461	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	197294118
89	NC_011163	T	14	49716	49729	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_011163	TGT	4	49970	49981	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	197294119
91	NC_011163	AT	7	51432	51444	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_011163	AT	7	51462	51477	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011163	TTTC	4	51566	51581	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
94	NC_011163	AT	7	51668	51680	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_011163	TAAA	4	52199	52214	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011163	TTTTG	3	52692	52706	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_011163	TTA	4	53778	53789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_011163	AAT	4	53850	53861	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_011163	ATG	4	53879	53889	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_011163	TAT	5	54310	54325	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_011163	AT	6	54324	54336	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_011163	ATT	4	55226	55236	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_011163	AATA	3	55708	55718	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_011163	ATA	4	55884	55894	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_011163	ATTT	3	56014	56025	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_011163	ATG	4	56761	56772	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	197294122
107	NC_011163	AAT	4	57771	57782	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_011163	ATA	4	58147	58158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_011163	AT	6	58354	58365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_011163	AT	6	60424	60434	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	197294125
111	NC_011163	TA	6	61456	61466	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_011163	AT	7	61973	61985	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_011163	TTCC	3	62074	62085	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
114	NC_011163	AT	6	62592	62605	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_011163	TAA	4	63520	63532	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_011163	TTTG	4	64554	64569	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
117	NC_011163	AT	6	65021	65031	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_011163	T	15	65054	65068	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
119	NC_011163	GAAA	3	65099	65109	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_011163	ATA	5	65173	65186	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_011163	AAAAT	3	65369	65383	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_011163	ATAA	3	66279	66290	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	197294133
123	NC_011163	AGAT	3	66346	66356	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_011163	TA	6	66410	66422	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_011163	A	13	66495	66507	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_011163	A	12	66833	66844	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	197294134
127	NC_011163	A	14	66885	66898	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	197294134
128	NC_011163	GAA	4	67030	67041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_011163	TTATT	3	67042	67055	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_011163	ATTT	3	67678	67689	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_011163	TCTT	3	68966	68976	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	197294156
132	NC_011163	T	14	69189	69202	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	197294156
133	NC_011163	GATA	3	69285	69297	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	197294156
134	NC_011163	AATAA	3	69898	69911	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	197294156
135	NC_011163	ACC	4	70021	70033	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	197294156
136	NC_011163	TCTTT	3	71885	71898	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	197294156
137	NC_011163	A	12	72362	72373	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	197294156
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222	NC_011163	TA	7	121921	121933	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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230	NC_011163	TTCA	3	124274	124286	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	197294168
231	NC_011163	AAT	4	124355	124367	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	197294168
232	NC_011163	TTTC	3	125045	125055	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	197294168
233	NC_011163	TTGTTT	3	125228	125246	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
234	NC_011163	T	16	125276	125291	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cicer arietinum chloroplast