ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Mono-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus nelsonii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011159	N	15	1457	1471	15	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011159	N	21	1505	1525	21	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011159	N	59	5038	5096	59	0 %	0 %	0 %	0 %	324986487
4	NC_011159	N	32	5193	5224	32	0 %	0 %	0 %	0 %	324986487
5	NC_011159	N	43	6957	6999	43	0 %	0 %	0 %	0 %	324986488
6	NC_011159	N	16	7398	7413	16	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011159	N	19	7506	7524	19	0 %	0 %	0 %	0 %	324986489
8	NC_011159	N	12	7535	7546	12	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011159	N	81	8368	8448	81	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011159	N	12	8473	8484	12	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011159	N	12	8758	8769	12	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011159	N	32	9069	9100	32	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011159	N	112	9138	9249	112	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011159	N	43	10763	10805	43	0 %	0 %	0 %	2 %	324986491
15	NC_011159	N	77	11894	11970	77	0 %	0 %	0 %	0 %	324986492
16	NC_011159	T	21	12858	12878	21	0 %	100 %	0 %	4 %	Non-Coding
17	NC_011159	N	35	14346	14380	35	0 %	0 %	0 %	0 %	324986494
18	NC_011159	N	38	14397	14434	38	0 %	0 %	0 %	0 %	324986494
19	NC_011159	N	20	17985	18004	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986496
20	NC_011159	C	12	21198	21209	12	0 %	0 %	100 %	8 %	324986497
21	NC_011159	N	39	21444	21482	39	0 %	0 %	0 %	2 %	324986497
22	NC_011159	N	21	24387	24407	21	0 %	0 %	0 %	0 %	324986498
23	NC_011159	N	20	28218	28237	20	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011159	N	16	28241	28256	16	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011159	T	14	28800	28813	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011159	A	14	29014	29027	14	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_011159	A	12	29977	29988	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011159	N	21	31091	31111	21	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
29	NC_011159	N	24	35010	35033	24	0 %	0 %	0 %	4 %	324986502
30	NC_011159	N	12	35051	35062	12	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
31	NC_011159	T	14	36197	36210	14	0 %	100 %	0 %	0 %	324986502
32	NC_011159	N	41	38602	38642	41	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
33	NC_011159	N	23	40423	40445	23	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
34	NC_011159	N	27	40493	40519	27	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
35	NC_011159	T	12	40747	40758	12	0 %	100 %	0 %	0 %	324986502
36	NC_011159	T	17	41088	41104	17	0 %	100 %	0 %	5 %	324986502
37	NC_011159	N	20	42636	42655	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
38	NC_011159	N	27	42668	42694	27	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
39	NC_011159	N	42	46518	46559	42	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
40	NC_011159	N	730	48081	48810	730	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
41	NC_011159	N	228	49632	49859	228	0 %	0 %	0 %	8 %	324986502
42	NC_011159	N	51	50237	50287	51	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
43	NC_011159	N	44	50376	50419	44	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
44	NC_011159	N	75	50430	50504	75	0 %	0 %	0 %	1 %	324986502
45	NC_011159	N	12	50655	50666	12	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
46	NC_011159	N	23	50725	50747	23	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
47	NC_011159	N	95	50755	50849	95	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
48	NC_011159	N	23	50867	50889	23	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
49	NC_011159	T	12	51462	51473	12	0 %	100 %	0 %	8 %	324986502
50	NC_011159	N	21	53054	53074	21	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
51	NC_011159	A	27	53978	54004	27	100 %	0 %	0 %	7 %	324986502
52	NC_011159	N	24	56276	56299	24	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
53	NC_011159	N	20	56645	56664	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
54	NC_011159	T	13	56984	56996	13	0 %	100 %	0 %	0 %	324986502
55	NC_011159	N	57	60616	60672	57	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
56	NC_011159	N	24	60688	60711	24	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
57	NC_011159	N	20	64413	64432	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
58	NC_011159	T	17	64920	64936	17	0 %	100 %	0 %	5 %	324986502
59	NC_011159	A	14	67387	67400	14	100 %	0 %	0 %	7 %	324986502
60	NC_011159	N	22	67488	67509	22	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
61	NC_011159	T	12	68800	68811	12	0 %	100 %	0 %	8 %	324986502
62	NC_011159	T	14	71250	71263	14	0 %	100 %	0 %	0 %	324986502
63	NC_011159	N	24	71331	71354	24	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
64	NC_011159	N	28	74798	74825	28	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
65	NC_011159	N	43	74843	74885	43	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
66	NC_011159	N	21	78343	78363	21	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
67	NC_011159	N	20	78381	78400	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
68	NC_011159	A	15	79308	79322	15	100 %	0 %	0 %	6 %	324986502
69	NC_011159	N	38	81865	81902	38	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
70	NC_011159	N	25	85591	85615	25	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
71	NC_011159	N	21	89067	89087	21	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
72	NC_011159	N	20	91974	91993	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
73	NC_011159	N	52	91997	92048	52	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
74	NC_011159	N	47	101888	101934	47	0 %	0 %	0 %	4 %	324986502
75	NC_011159	N	20	104977	104996	20	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
76	NC_011159	N	129	105013	105141	129	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
77	NC_011159	N	12	105668	105679	12	0 %	0 %	0 %	0 %	324986502
78	NC_011159	N	74	106547	106620	74	0 %	0 %	0 %	4 %	324986502
79	NC_011159	N	38	107054	107091	38	0 %	0 %	0 %	2 %	Non-Coding
80	NC_011159	N	111	107122	107232	111	0 %	0 %	0 %	0 %	324986553
81	NC_011159	T	12	109676	109687	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011159	N	21	110972	110992	21	0 %	0 %	0 %	0 %	324986554
83	NC_011159	N	28	114267	114294	28	0 %	0 %	0 %	0 %	324986554
84	NC_011159	N	36	114309	114344	36	0 %	0 %	0 %	0 %	324986554

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Mono-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus nelsonii chloroplast