ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pinus krempfii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011155	GATG	3	1450	1462	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_011155	N	21	1494	1514	21	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011155	ATC	4	1984	1994	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237688645
4	NC_011155	AGA	4	2196	2207	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	237688645
5	NC_011155	ATGA	3	4202	4213	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011155	N	33	5026	5058	33	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688646
7	NC_011155	ATC	4	5229	5239	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237688646
8	NC_011155	CTA	4	6115	6125	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237688646
9	NC_011155	AGAAAA	3	6415	6432	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_011155	GAAA	3	6455	6465	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_011155	TTCGA	3	6866	6879	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
12	NC_011155	GATAC	3	7342	7355	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
13	NC_011155	TCT	4	7450	7460	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
14	NC_011155	GA	6	7806	7817	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_011155	N	13	8019	8031	13	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011155	N	39	9512	9550	39	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011155	N	20	11064	11083	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688649
18	NC_011155	AATT	3	12255	12266	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	237688650
19	NC_011155	ATTT	3	12744	12756	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	237688650
20	NC_011155	AAGGA	3	12811	12825	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	237688650
21	NC_011155	T	21	13153	13173	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
22	NC_011155	CAG	4	13397	13408	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	237688651
23	NC_011155	N	20	14595	14614	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688652
24	NC_011155	TTTTTC	3	15034	15052	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
25	NC_011155	N	20	18172	18191	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688654
26	NC_011155	TA	6	18772	18783	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237688654
27	NC_011155	CAT	4	19997	20007	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237688655
28	NC_011155	N	24	21617	21640	24	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688655
29	NC_011155	TGCTT	3	21645	21658	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	237688655
30	NC_011155	GTT	4	22428	22439	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	237688655
31	NC_011155	N	25	24565	24589	25	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688656
32	NC_011155	TA	6	25264	25274	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237688656
33	NC_011155	ATGA	3	25907	25918	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_011155	ATCC	3	26145	26155	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
35	NC_011155	TTA	4	26743	26754	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_011155	TTAA	3	28354	28365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_011155	N	20	28409	28428	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011155	T	12	29004	29015	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011155	A	14	29236	29249	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_011155	AAAGG	4	30192	30211	20	60 %	0 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_011155	N	21	31296	31316	21	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
42	NC_011155	AATTC	3	31573	31587	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	237688660
43	NC_011155	GTT	4	31778	31788	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	237688660
44	NC_011155	GTA	4	32072	32083	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	237688660
45	NC_011155	N	22	35183	35204	22	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
46	NC_011155	AAGG	3	36678	36689	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	237688660
47	NC_011155	TAA	4	36991	37002	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237688660
48	NC_011155	N	42	38793	38834	42	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
49	NC_011155	TCT	4	39052	39063	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	237688660
50	NC_011155	CT	6	39231	39242	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	237688660
51	NC_011155	GAAA	3	40397	40407	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	237688660
52	NC_011155	N	23	40645	40667	23	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
53	NC_011155	ATTT	4	40967	40982	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	237688660
54	NC_011155	AAT	4	41172	41182	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237688660
55	NC_011155	AT	6	42389	42400	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	237688660
56	NC_011155	GATA	3	42418	42429	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	237688660
57	NC_011155	N	27	42529	42555	27	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
58	NC_011155	T	26	44570	44595	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	237688660
59	NC_011155	GGA	4	45252	45263	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	237688660
60	NC_011155	N	79	46340	46418	79	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
61	NC_011155	T	12	47750	47761	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	237688660
62	NC_011155	ATA	4	48742	48752	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237688660
63	NC_011155	N	259	49188	49446	259	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
64	NC_011155	N	50	49676	49725	50	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
65	NC_011155	N	130	49785	49914	130	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
66	NC_011155	N	21	49973	49993	21	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
67	NC_011155	GAAG	3	50299	50310	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	237688660
68	NC_011155	N	12	50390	50401	12	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
69	NC_011155	N	52	50879	50930	52	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
70	NC_011155	N	14	50971	50984	14	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
71	NC_011155	TC	6	51185	51196	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	237688660
72	NC_011155	T	15	51577	51591	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	237688660
73	NC_011155	GATCC	3	51970	51983	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	237688660
74	NC_011155	ATTC	3	52255	52266	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	237688660
75	NC_011155	N	21	53172	53192	21	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
76	NC_011155	ATTT	3	54893	54904	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	237688660
77	NC_011155	AAT	4	56374	56384	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	237688660
78	NC_011155	N	20	56734	56753	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
79	NC_011155	AATTC	3	58340	58353	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	237688660
80	NC_011155	TA	6	59049	59059	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237688660
81	NC_011155	TCGT	3	60668	60678	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	237688660
82	NC_011155	N	46	60757	60802	46	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
83	NC_011155	ATA	4	61827	61838	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	237688660
84	NC_011155	CT	6	62006	62016	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	237688660
85	NC_011155	CTT	4	63059	63069	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	237688660
86	NC_011155	T	16	63166	63181	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	237688660
87	NC_011155	TC	7	63925	63937	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	237688660
88	NC_011155	TCTT	3	63961	63972	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	237688660
89	NC_011155	AATT	3	64281	64291	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237688660
90	NC_011155	N	20	64511	64530	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
91	NC_011155	TTTTTC	4	65022	65046	25	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	8 %	237688660
92	NC_011155	TAT	4	65069	65079	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	237688660
93	NC_011155	AT	7	65108	65120	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237688660
94	NC_011155	N	27	65141	65167	27	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
95	NC_011155	GAAA	3	66460	66470	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	237688660
96	NC_011155	N	22	67363	67384	22	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
97	NC_011155	N	17	67396	67412	17	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
98	NC_011155	T	14	71150	71163	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	237688660
99	NC_011155	N	24	71231	71254	24	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
100	NC_011155	AT	7	72658	72671	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	237688660
101	NC_011155	AT	8	72688	72703	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	237688660
102	NC_011155	CAT	4	73854	73864	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237688660
103	NC_011155	GGA	4	74709	74719	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	237688660
104	NC_011155	N	23	74723	74745	23	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
105	NC_011155	AATT	3	76232	76242	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237688660
106	NC_011155	AGA	4	77642	77652	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	237688660
107	NC_011155	N	15	78232	78246	15	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
108	NC_011155	N	20	78249	78268	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
109	NC_011155	AT	12	78322	78343	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	237688660
110	NC_011155	CATT	3	78424	78435	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	237688660
111	NC_011155	G	14	78515	78528	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	237688660
112	NC_011155	GAT	4	78933	78944	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	237688660
113	NC_011155	CT	6	79116	79126	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	237688660
114	NC_011155	A	15	79166	79180	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	237688660
115	NC_011155	CTG	4	79384	79395	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	237688660
116	NC_011155	GAA	4	79430	79441	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	237688660
117	NC_011155	TTTC	3	80280	80291	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	237688660
118	NC_011155	N	38	81723	81760	38	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
119	NC_011155	GATC	3	81936	81947	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	237688660
120	NC_011155	A	13	85111	85123	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	237688660
121	NC_011155	N	13	85217	85229	13	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
122	NC_011155	N	25	85277	85301	25	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
123	NC_011155	ATCC	3	85593	85604	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	237688660
124	NC_011155	N	21	88775	88795	21	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
125	NC_011155	GAGG	3	88859	88870	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	237688660
126	NC_011155	AGGT	3	89066	89077	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	237688660
127	NC_011155	AACC	3	90699	90711	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	237688660
128	NC_011155	TCA	4	91437	91447	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	237688660
129	NC_011155	N	20	91683	91702	20	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	237688660
130	NC_011155	TGG	4	92818	92829	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	237688660
131	NC_011155	TAT	4	92926	92940	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	237688660
132	NC_011155	AGA	4	93204	93215	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	237688660
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181	NC_011155	T	13	116377	116389	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pinus krempfii chloroplast