Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus contorta chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_011153CTA4630863181133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %324986330
2NC_011153CAT420331203411133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %237688518
3NC_011153TCT42134021350110 %66.67 %0 %33.33 %9 %237688518
4NC_011153CTT42190721917110 %66.67 %0 %33.33 %9 %237688518
5NC_011153GTT42275722768120 %66.67 %33.33 %0 %8 %237688518
6NC_011153ATT428701287111133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
7NC_011153GTT43214132151110 %66.67 %33.33 %0 %9 %237688523
8NC_011153GTA432481324921233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %237688523
9NC_011153AGA436440364501166.67 %0 %33.33 %0 %9 %237688523
10NC_011153TAA437376373871266.67 %33.33 %0 %0 %8 %237688523
11NC_011153TCT43941639427120 %66.67 %0 %33.33 %8 %237688523
12NC_011153AAT441859418691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %237688523
13NC_011153GGA445905459161233.33 %0 %66.67 %0 %8 %237688523
14NC_011153ATA449373493831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %237688523
15NC_011153CTT45159651606110 %66.67 %0 %33.33 %9 %237688523
16NC_011153AAT457075570851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %237688523
17NC_011153ATA462522625331266.67 %33.33 %0 %0 %8 %237688523
18NC_011153CTT56375463767140 %66.67 %0 %33.33 %7 %237688523
19NC_011153TAT464793648031133.33 %66.67 %0 %0 %9 %237688523
20NC_011153TAT465732657421133.33 %66.67 %0 %0 %9 %237688523
21NC_011153AAT466371663811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %237688523
22NC_011153TTC46815168161110 %66.67 %0 %33.33 %9 %237688523
23NC_011153TTC47836678377120 %66.67 %0 %33.33 %8 %237688523
24NC_011153AGA478541785511166.67 %0 %33.33 %0 %9 %237688523
25NC_011153CTG48026780278120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %237688523
26NC_011153TTC48315483165120 %66.67 %0 %33.33 %8 %237688523
27NC_011153TCA492392924021133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %237688523
28NC_011153TGG49374893759120 %33.33 %66.67 %0 %8 %237688523
29NC_011153AGA494176941871266.67 %0 %33.33 %0 %8 %237688523
30NC_011153CAA496222962331266.67 %0 %0 %33.33 %8 %237688523
31NC_011153GAA499627996381266.67 %0 %33.33 %0 %8 %237688523
32NC_011153AGA41076701076821366.67 %0 %33.33 %0 %7 %237688523
33NC_011153TAA41085221085321166.67 %33.33 %0 %0 %9 %237688523
34NC_011153TAC41089761089861133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %237688523
35NC_011153TCA41097961098061133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %237688523
36NC_011153GTA41105961106071233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %237688523
37NC_011153TAC41193931194031133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %237688574
38NC_011153TCT4119591119602120 %66.67 %0 %33.33 %8 %237688574