ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida neerlandica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011133	ATT	4	286	296	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011133	TAT	4	441	452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011133	TAT	4	1815	1827	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_011133	TAT	4	2057	2067	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011133	ACT	5	2937	2951	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
6	NC_011133	TTA	4	3124	3135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011133	AAT	4	3140	3151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_011133	TAT	4	3689	3699	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_011133	ATA	4	4608	4618	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_011133	ATT	4	5152	5163	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_011133	TAA	4	6568	6579	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597575
12	NC_011133	TAT	4	6686	6696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_011133	ATT	4	6882	6893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597575
14	NC_011133	TAT	4	7607	7619	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19597575
15	NC_011133	TAG	4	7803	7814	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	19597575
16	NC_011133	ATT	4	8859	8871	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_011133	ATT	4	9407	9419	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19597575
18	NC_011133	ATA	4	10554	10564	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_011133	TAC	4	10655	10665	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_011133	ATA	4	11797	11807	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_011133	TAA	4	12170	12181	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_011133	TAA	4	12373	12385	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_011133	TTA	4	12683	12694	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_011133	ATT	4	12859	12869	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011133	TAT	5	12931	12945	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_011133	AAT	4	13003	13014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_011133	ATT	4	13128	13138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_011133	TAT	5	13683	13696	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19597577
29	NC_011133	ATA	4	14014	14024	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19597577
30	NC_011133	ATA	4	14257	14268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
31	NC_011133	TAA	4	14531	14542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
32	NC_011133	ATA	4	14608	14619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
33	NC_011133	TAT	6	14958	14974	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	19597577
34	NC_011133	ATT	4	15003	15014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597577
35	NC_011133	GGT	4	15049	15060	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19597577
36	NC_011133	TAA	4	16008	16019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
37	NC_011133	TTA	4	16864	16875	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597577
38	NC_011133	TTA	4	17283	17294	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_011133	TCT	4	17724	17735	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	19597577
40	NC_011133	TAA	4	18692	18702	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19597577
41	NC_011133	TTA	5	19139	19154	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19597577
42	NC_011133	TAA	4	19155	19166	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
43	NC_011133	TTA	4	20287	20298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597577
44	NC_011133	TAT	4	20377	20387	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597577
45	NC_011133	TAA	5	20439	20454	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	19597577
46	NC_011133	TTA	4	20633	20643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_011133	CTA	4	20778	20789	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
48	NC_011133	TTA	4	23204	23214	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597576
49	NC_011133	TAT	4	23536	23546	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597576
50	NC_011133	TTA	4	23690	23700	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597576
51	NC_011133	TAT	4	23782	23793	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597576
52	NC_011133	TAT	5	24061	24075	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19597576
53	NC_011133	ATA	5	25319	25332	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22417878
54	NC_011133	CTT	4	26535	26546	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	22417878
55	NC_011133	TAA	4	28088	28099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597576
56	NC_011133	TAT	4	30146	30156	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_011133	ATT	5	30329	30344	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_011133	TAT	4	30476	30486	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597577
59	NC_011133	TTG	5	31014	31028	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	19597577

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida neerlandica mitochondrion