ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida neerlandica mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011133	TTCATA	3	195	211	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
2	NC_011133	TATTT	4	216	236	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_011133	TATT	4	233	247	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_011133	ATT	4	286	296	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011133	TA	6	410	421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011133	TAT	4	441	452	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_011133	TA	7	682	695	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_011133	AT	6	1035	1046	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_011133	TA	6	1781	1792	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_011133	TAT	4	1815	1827	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_011133	ATTT	3	1934	1945	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011133	TAT	4	2057	2067	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_011133	TTTA	3	2236	2246	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_011133	AT	8	2342	2357	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_011133	ACT	5	2937	2951	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
16	NC_011133	TAAATA	3	3011	3029	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
17	NC_011133	TTA	4	3124	3135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011133	AAT	4	3140	3151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_011133	TA	12	3234	3256	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_011133	TAT	4	3689	3699	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_011133	GATA	3	3788	3799	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_011133	AATTA	3	4156	4169	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_011133	ATA	4	4608	4618	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_011133	AGTA	3	4915	4926	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_011133	TA	8	5102	5116	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_011133	ATT	4	5152	5163	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_011133	TAAT	3	5333	5343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_011133	TCTA	3	5466	5476	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_011133	AT	6	5541	5551	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_011133	AT	7	5822	5835	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_011133	TTTA	3	5836	5847	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011133	CTATTA	3	6090	6106	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	19597575
33	NC_011133	TAA	4	6568	6579	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597575
34	NC_011133	TAT	4	6686	6696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_011133	TATT	4	6783	6798	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	19597575
36	NC_011133	ATT	4	6882	6893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597575
37	NC_011133	TAT	4	7607	7619	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19597575
38	NC_011133	TAG	4	7803	7814	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	19597575
39	NC_011133	AATT	3	7985	7996	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	19597575
40	NC_011133	ACAT	3	8146	8156	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_011133	ATT	4	8859	8871	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_011133	ATT	4	9407	9419	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19597575
43	NC_011133	TTTA	3	9788	9799	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	19597575
44	NC_011133	AT	8	10264	10279	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_011133	ATA	4	10554	10564	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_011133	TAC	4	10655	10665	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_011133	AAAT	3	10676	10687	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011133	ATAAAA	3	10894	10910	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
49	NC_011133	AT	6	11536	11546	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_011133	AT	6	11575	11586	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_011133	ATA	4	11797	11807	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_011133	TA	6	11926	11939	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_011133	TAA	4	12170	12181	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_011133	TAA	4	12373	12385	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_011133	TTA	4	12683	12694	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_011133	ATT	4	12859	12869	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_011133	TAT	5	12931	12945	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_011133	TA	6	12954	12964	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_011133	AAT	4	13003	13014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_011133	TA	6	13030	13041	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_011133	ATTAA	3	13088	13102	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011133	ATT	4	13128	13138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_011133	TAAAAA	3	13206	13223	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_011133	TAT	5	13683	13696	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	19597577
65	NC_011133	ATA	4	14014	14024	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19597577
66	NC_011133	AAAT	3	14243	14255	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	19597577
67	NC_011133	ATA	4	14257	14268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
68	NC_011133	AT	7	14366	14379	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19597577
69	NC_011133	TAA	4	14531	14542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
70	NC_011133	ATA	4	14608	14619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
71	NC_011133	TTTA	4	14652	14667	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	19597577
72	NC_011133	TAT	6	14958	14974	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	19597577
73	NC_011133	ATT	4	15003	15014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597577
74	NC_011133	GGT	4	15049	15060	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	19597577
75	NC_011133	ATAAA	3	15420	15435	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	19597577
76	NC_011133	AGAA	3	15468	15479	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	19597577
77	NC_011133	TAA	4	16008	16019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
78	NC_011133	CAAA	3	16477	16487	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	19597577
79	NC_011133	TTA	4	16864	16875	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597577
80	NC_011133	TTA	4	17283	17294	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_011133	TCT	4	17724	17735	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	19597577
82	NC_011133	TCTT	3	17875	17886	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	19597577
83	NC_011133	TGTA	3	18111	18122	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	19597577
84	NC_011133	TA	7	18207	18219	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19597577
85	NC_011133	TAA	4	18692	18702	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	19597577
86	NC_011133	TTA	5	19139	19154	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19597577
87	NC_011133	TAA	4	19155	19166	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597577
88	NC_011133	TTA	4	20287	20298	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597577
89	NC_011133	TAT	4	20377	20387	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597577
90	NC_011133	TAA	5	20439	20454	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	19597577
91	NC_011133	AT	6	20455	20465	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_011133	TTA	4	20633	20643	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_011133	AT	6	20644	20654	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_011133	CTA	4	20778	20789	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_011133	TATT	4	21965	21981	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_011133	ATTT	3	22384	22394	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_011133	TA	8	22672	22687	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_011133	AT	6	22961	22971	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_011133	TTA	4	23204	23214	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597576
100	NC_011133	TAT	4	23536	23546	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597576
101	NC_011133	TTA	4	23690	23700	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597576
102	NC_011133	TAT	4	23782	23793	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	19597576
103	NC_011133	TTAA	3	23830	23841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19597576
104	NC_011133	TA	8	24026	24041	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	19597576
105	NC_011133	TAT	5	24061	24075	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	19597576
106	NC_011133	TA	6	24211	24221	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19597576
107	NC_011133	TA	6	24596	24608	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19597576
108	NC_011133	ATA	5	25319	25332	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22417878
109	NC_011133	TA	7	25540	25553	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22417878
110	NC_011133	TA	6	25595	25605	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22417878
111	NC_011133	TAAT	4	25775	25790	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	22417878
112	NC_011133	ATTT	3	26247	26258	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22417878
113	NC_011133	CTT	4	26535	26546	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	22417878
114	NC_011133	TA	6	27127	27137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22417878
115	NC_011133	ATTA	3	28008	28020	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19597576
116	NC_011133	TAA	4	28088	28099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	19597576
117	NC_011133	AT	9	28256	28272	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
118	NC_011133	TA	6	29804	29814	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19597576
119	NC_011133	TAT	4	30146	30156	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_011133	ATTT	3	30158	30169	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011133	ATT	5	30329	30344	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_011133	ATTA	3	30434	30444	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19597577
123	NC_011133	TAT	4	30476	30486	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	19597577
124	NC_011133	TA	6	30580	30590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19597577
125	NC_011133	TTG	5	31014	31028	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	19597577
126	NC_011133	ATGTAT	3	31273	31290	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
127	NC_011133	ATTT	4	31602	31617	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
128	NC_011133	AT	8	31777	31792	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida neerlandica mitochondrion