ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ochrogaster lunifer mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011128	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_011128	T	17	301	317	17	0 %	100 %	0 %	5 %	195954011
3	NC_011128	ATTTTA	4	701	724	24	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	195954011
4	NC_011128	TAA	4	1064	1076	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	195954011
5	NC_011128	TTTA	3	1122	1133	12	25 %	75 %	0 %	8 %	195954011
6	NC_011128	TTTA	3	1155	1165	11	25 %	75 %	0 %	9 %	195954011
7	NC_011128	ATTAAA	3	1185	1203	19	66.67 %	33.33 %	0 %	10 %	195954011
8	NC_011128	AATTAT	3	1412	1429	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_011128	TCT	5	2074	2089	16	0 %	66.67 %	33.33 %	6 %	195972426
10	NC_011128	TCA	4	3785	3796	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	195954013
11	NC_011128	ATT	4	4026	4036	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	195954014
12	NC_011128	TAAA	3	4077	4087	11	75 %	25 %	0 %	9 %	195954014
13	NC_011128	ATCA	3	4308	4318	11	50 %	25 %	25 %	9 %	195954015
14	NC_011128	AAT	4	4878	4888	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	195954016
15	NC_011128	TTA	4	5279	5290	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	195954016
16	NC_011128	TTAATT	4	5658	5681	24	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	195954017
17	NC_011128	ATTT	3	5896	5907	12	25 %	75 %	0 %	8 %	195954017
18	NC_011128	ATT	4	5931	5944	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	195954017
19	NC_011128	CA	12	6024	6047	24	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
20	NC_011128	TA	16	6040	6071	32	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_011128	TAAA	4	6140	6155	16	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_011128	ATTA	6	6210	6233	24	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_011128	TAA	4	6407	6417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_011128	AT	30	6434	6494	61	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011128	TTTA	3	6508	6518	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_011128	TA	6	6562	6572	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_011128	TAAA	3	6638	6649	12	75 %	25 %	0 %	0 %	195954018
28	NC_011128	ATA	4	7170	7180	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	195954018
29	NC_011128	AATA	3	7181	7192	12	75 %	25 %	0 %	8 %	195954018
30	NC_011128	TTA	4	7463	7474	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	195954018
31	NC_011128	TAA	4	7572	7582	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	195954018
32	NC_011128	AATT	3	7602	7613	12	50 %	50 %	0 %	8 %	195954018
33	NC_011128	AAAT	3	8219	8230	12	75 %	25 %	0 %	8 %	195954018
34	NC_011128	ATAAAA	4	8276	8300	25	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	195954018
35	NC_011128	TAAT	5	8614	8633	20	50 %	50 %	0 %	10 %	195954019
36	NC_011128	ATAA	4	9224	9239	16	75 %	25 %	0 %	6 %	195954019
37	NC_011128	TTA	4	9241	9251	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	195954019
38	NC_011128	TAA	4	9355	9367	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	195954019
39	NC_011128	AAAAT	3	9391	9404	14	80 %	20 %	0 %	7 %	195954019
40	NC_011128	AT	6	9580	9590	11	50 %	50 %	0 %	9 %	195954019
41	NC_011128	ATATTA	3	9643	9660	18	50 %	50 %	0 %	0 %	195954019
42	NC_011128	ATT	4	9711	9722	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	195954019
43	NC_011128	A	13	9914	9926	13	100 %	0 %	0 %	0 %	195954020
44	NC_011128	ATT	5	10166	10180	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_011128	ATT	4	10243	10253	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	195954021
46	NC_011128	TTA	4	10384	10395	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	195954021
47	NC_011128	TATC	3	10398	10409	12	25 %	50 %	25 %	8 %	195954021
48	NC_011128	TA	6	10568	10578	11	50 %	50 %	0 %	9 %	195954021
49	NC_011128	TAA	4	10581	10591	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	195954021
50	NC_011128	ATA	5	10642	10656	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	195954021
51	NC_011128	TTTC	3	11019	11030	12	0 %	75 %	25 %	8 %	195954022
52	NC_011128	ATTT	3	11445	11455	11	25 %	75 %	0 %	9 %	195954022
53	NC_011128	AATTTT	3	11643	11660	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	195954022
54	NC_011128	TA	6	12183	12193	11	50 %	50 %	0 %	9 %	195954023
55	NC_011128	AAATC	3	12242	12256	15	60 %	20 %	20 %	6 %	195954023
56	NC_011128	AAATT	3	12418	12431	14	60 %	40 %	0 %	7 %	195954023
57	NC_011128	CAAAA	3	12594	12607	14	80 %	0 %	20 %	7 %	195954023
58	NC_011128	TA	6	12941	12952	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_011128	TA	23	13009	13052	44	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_011128	AAT	4	13345	13357	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_011128	ATTTAT	3	13443	13461	19	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_011128	AAAAT	3	13860	13874	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_011128	AATT	3	14024	14034	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_011128	TA	8	15018	15034	17	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_011128	T	25	15297	15321	25	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_011128	TAA	5	15330	15345	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_011128	TTTCT	3	15357	15371	15	0 %	80 %	20 %	6 %	Non-Coding
68	NC_011128	TTTATA	3	15430	15446	17	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_011128	TTAA	3	15463	15474	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_011128	TAA	5	15483	15497	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_011128	AT	11	15510	15530	21	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ochrogaster lunifer mitochondrion