ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chorthippus chinensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011095	ATA	4	359	369	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194871824
2	NC_011095	AAT	4	1515	1526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194871825
3	NC_011095	TAT	4	3114	3125	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194871826
4	NC_011095	CAA	5	4556	4570	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	194871828
5	NC_011095	TTCA	3	4806	4817	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	194871829
6	NC_011095	AAT	4	5600	5611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194871830
7	NC_011095	TAA	4	6078	6088	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_011095	AAAT	3	6413	6424	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	194871831
9	NC_011095	AATT	4	6907	6922	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	194871831
10	NC_011095	TAA	4	7294	7305	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194871831
11	NC_011095	AAG	4	7434	7445	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194871831
12	NC_011095	ATA	4	7528	7538	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194871831
13	NC_011095	TAAA	3	7960	7970	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194871831
14	NC_011095	AAAT	3	8707	8718	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194871832
15	NC_011095	TAA	4	8906	8916	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194871832
16	NC_011095	AAAGAA	3	9450	9467	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	194871833
17	NC_011095	A	12	9541	9552	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	194871833
18	NC_011095	ATA	4	9692	9702	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194871833
19	NC_011095	AAT	4	9940	9951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194871834
20	NC_011095	TAT	4	9948	9960	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	194871834
21	NC_011095	TTA	4	10136	10148	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	194871834
22	NC_011095	ATA	5	10298	10312	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	194871834
23	NC_011095	TAG	4	10329	10340	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	194871834
24	NC_011095	AAT	4	10378	10388	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194871834
25	NC_011095	TA	7	10722	10735	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	194871835
26	NC_011095	ATT	4	10753	10763	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194871835
27	NC_011095	CAAT	3	11357	11368	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	194871835
28	NC_011095	AAT	4	11379	11390	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194871835
29	NC_011095	AAAT	3	11522	11533	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194871835
30	NC_011095	AAAT	3	11679	11690	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194871836
31	NC_011095	ATA	4	12035	12045	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194871836
32	NC_011095	TAA	4	12175	12187	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194871836
33	NC_011095	TAAAA	3	12247	12260	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	194871836
34	NC_011095	TAA	4	13452	13463	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_011095	TTA	5	13500	13513	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_011095	TAAA	3	13557	13567	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011095	TAA	5	13686	13700	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_011095	TA	7	13747	13759	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_011095	TTTA	3	13808	13819	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_011095	AAT	4	13949	13959	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_011095	AATTA	5	14174	14197	24	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
42	NC_011095	AAAT	3	14799	14810	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_011095	ACA	4	14962	14972	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_011095	ATT	4	15173	15185	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_011095	TAT	4	15211	15222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_011095	ATAATT	4	15244	15266	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_011095	AT	7	15303	15316	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_011095	TAA	4	15449	15461	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chorthippus chinensis mitochondrion