ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Paulinella chromatophora chromatophore

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011087	AT	6	10601	10611	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011087	AT	7	12762	12774	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19447650
3	NC_011087	AT	6	22274	22284	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011087	TA	6	38570	38580	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447652
5	NC_011087	GA	6	42693	42704	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	19447653
6	NC_011087	TA	6	57680	57690	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_011087	AT	6	81221	81232	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447656
8	NC_011087	AT	6	100393	100403	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447657
9	NC_011087	TA	6	122984	122995	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447659
10	NC_011087	AG	6	129540	129550	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	19447659
11	NC_011087	AG	6	146999	147009	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011087	AT	6	160727	160737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_011087	TA	7	187044	187056	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_011087	CT	6	217150	217160	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	19447667
15	NC_011087	AG	6	224626	224637	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	19447668
16	NC_011087	TA	6	265481	265491	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447671
17	NC_011087	GA	6	273166	273176	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	19447672
18	NC_011087	CT	6	295940	295950	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	19447674
19	NC_011087	AT	6	333258	333268	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_011087	AT	6	351344	351354	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447679
21	NC_011087	CT	6	354630	354641	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	19447679
22	NC_011087	TA	7	388268	388280	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_011087	TA	6	406714	406724	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_011087	TA	6	432275	432285	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447685
25	NC_011087	TC	6	480491	480501	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	19447689
26	NC_011087	TA	7	485159	485171	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	19447689
27	NC_011087	TA	6	488780	488791	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_011087	AG	6	515414	515424	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	19447691
29	NC_011087	AT	6	544182	544192	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_011087	CT	6	567379	567390	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	19447696
31	NC_011087	TA	6	595676	595687	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_011087	CT	6	602451	602462	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	19447699
33	NC_011087	AT	6	725090	725100	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_011087	CT	6	729822	729832	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	19447711
35	NC_011087	AT	6	731914	731925	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_011087	GA	6	751795	751805	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	19447713
37	NC_011087	AT	6	768779	768789	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_011087	GA	6	782085	782095	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	19447716
39	NC_011087	AT	6	782772	782783	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_011087	TC	6	815674	815684	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	19447719
41	NC_011087	AT	6	824298	824309	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_011087	AT	6	857591	857602	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447722
43	NC_011087	TA	6	898177	898188	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_011087	TA	6	942947	942957	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_011087	TA	6	1003370	1003380	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447734
46	NC_011087	TC	6	1012591	1012602	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	19447735

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Paulinella chromatophora chromatophore