ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Paulinella chromatophora chromatophore

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011087	GAAT	3	73	84	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011087	CTA	4	110522	110533	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19447658
3	NC_011087	CAAT	3	112126	112137	12	50 %	25 %	0 %	25 %	19447658
4	NC_011087	TAGA	3	122123	122134	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011087	CTG	4	154771	154782	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19447661
6	NC_011087	TGG	4	154928	154939	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19447661
7	NC_011087	ATTA	5	193270	193289	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011087	AGC	4	237356	237367	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19447669
9	NC_011087	CGAG	3	254683	254694	12	25 %	0 %	50 %	25 %	19447671
10	NC_011087	ATTA	6	290045	290068	24	50 %	50 %	0 %	0 %	19447674
11	NC_011087	ATTA	3	292412	292423	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011087	ATT	4	332756	332767	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19447677
13	NC_011087	CTTT	3	355877	355888	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011087	ACCA	3	362241	362252	12	50 %	0 %	0 %	50 %	19447679
15	NC_011087	CCA	4	370166	370177	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19447680
16	NC_011087	AATA	3	377888	377899	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011087	TA	6	388269	388280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011087	CCA	6	409458	409475	18	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19447683
19	NC_011087	ACA	4	423277	423288	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19447684
20	NC_011087	GGTT	3	490965	490976	12	0 %	50 %	50 %	0 %	19447689
21	NC_011087	TTAC	3	496964	496975	12	25 %	50 %	0 %	25 %	19447690
22	NC_011087	TTTA	3	517927	517938	12	25 %	75 %	0 %	0 %	19447692
23	NC_011087	TTC	4	528080	528091	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19447693
24	NC_011087	GCAA	3	537204	537215	12	50 %	0 %	25 %	25 %	19447693
25	NC_011087	CTA	4	539145	539156	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19447694
26	NC_011087	CGT	4	627069	627080	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19447701
27	NC_011087	ATGA	3	675310	675321	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011087	AAATAG	3	687931	687948	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011087	GCA	4	691758	691769	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19447708
30	NC_011087	CTTTA	3	694195	694209	15	20 %	60 %	0 %	20 %	19447708
31	NC_011087	TTTAA	3	695371	695385	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011087	AATTT	3	703159	703173	15	40 %	60 %	0 %	0 %	19447709
33	NC_011087	CGC	4	733997	734008	12	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	19447711
34	NC_011087	GTA	5	742487	742501	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011087	TTCT	3	765778	765789	12	0 %	75 %	0 %	25 %	19447714
36	NC_011087	AAAC	3	797133	797144	12	75 %	0 %	0 %	25 %	19447717
37	NC_011087	AGC	4	818187	818198	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19447719
38	NC_011087	ATTT	3	834611	834622	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011087	CTTA	3	852733	852744	12	25 %	50 %	0 %	25 %	19447722
40	NC_011087	TAAA	3	880681	880692	12	75 %	25 %	0 %	0 %	19447724
41	NC_011087	TAA	4	901262	901273	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011087	AATT	3	904555	904566	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011087	AAAG	3	913954	913965	12	75 %	0 %	25 %	0 %	19447727
44	NC_011087	ATT	4	919459	919470	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19447727
45	NC_011087	ATT	4	929709	929720	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011087	CAATC	3	932764	932778	15	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011087	TAA	5	971193	971207	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011087	ACG	4	972893	972904	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19447732
49	NC_011087	GCA	4	1003716	1003727	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19447734
50	NC_011087	GCT	4	1015377	1015388	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19447735

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Paulinella chromatophora chromatophore