ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Paulinella chromatophora chromatophore

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011087	GAAT	3	73	84	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011087	AAAT	3	1367	1378	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	19447649
3	NC_011087	GAAT	3	2347	2357	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	19447649
4	NC_011087	AATG	3	4787	4797	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011087	TTAA	3	14155	14166	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_011087	CAAT	3	19363	19373	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_011087	ATTA	3	19420	19431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_011087	TCAA	3	20553	20564	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_011087	CAGT	3	22941	22952	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	19447651
10	NC_011087	ATTA	3	24499	24510	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_011087	AAGC	3	24643	24654	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_011087	CTAG	3	31667	31678	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	19447652
13	NC_011087	AACG	3	35087	35098	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	19447652
14	NC_011087	TTCA	3	36417	36428	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	19447652
15	NC_011087	TAGA	3	36992	37002	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	19447652
16	NC_011087	AATC	3	39588	39599	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_011087	TTTC	3	40096	40107	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_011087	TTTA	3	43712	43723	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_011087	TTAC	3	46141	46152	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	19447653
20	NC_011087	GCAA	3	49985	49996	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	19447653
21	NC_011087	GTCA	3	50835	50845	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	19447653
22	NC_011087	AATC	3	53309	53321	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	19447654
23	NC_011087	AAGC	3	53644	53654	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	19447654
24	NC_011087	GGAA	3	53739	53749	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	19447654
25	NC_011087	AAAT	3	53909	53920	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	19447654
26	NC_011087	TTTA	3	54074	54084	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	19447654
27	NC_011087	TTAA	3	56555	56566	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_011087	CCCG	3	56674	56684	11	0 %	0 %	25 %	75 %	9 %	Non-Coding
29	NC_011087	AATT	3	56999	57010	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_011087	TATT	3	57714	57724	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_011087	ATTA	3	57840	57851	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_011087	ATGT	3	61572	61583	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	19447654
33	NC_011087	ACCC	3	67896	67907	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	19447655
34	NC_011087	TAAT	3	68531	68542	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447655
35	NC_011087	ATTG	3	68850	68861	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	19447655
36	NC_011087	TTTC	3	69851	69861	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011087	TTAA	3	71532	71543	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_011087	ATTT	3	72841	72851	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	19447655
39	NC_011087	TGAA	3	74005	74016	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	19447655
40	NC_011087	TATT	3	74679	74690	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_011087	TAAT	3	74779	74789	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_011087	TTAA	3	77374	77384	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447656
43	NC_011087	AAAT	3	79816	79828	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	19447656
44	NC_011087	AATT	3	82731	82742	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_011087	TTGG	3	85458	85469	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_011087	CCAT	3	102856	102866	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	19447657
47	NC_011087	AATC	3	105408	105419	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	19447658
48	NC_011087	CAAT	3	112126	112141	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	19447658
49	NC_011087	CCAA	3	120092	120103	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	19447659
50	NC_011087	TTTA	3	120766	120776	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_011087	AATA	3	120849	120859	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_011087	TAGA	4	122123	122137	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_011087	TTTA	3	131632	131643	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_011087	AATT	3	132641	132652	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_011087	CCAC	3	137326	137336	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	19447660
56	NC_011087	ATAG	3	138245	138255	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	19447660
57	NC_011087	GCAA	3	141708	141719	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	19447660
58	NC_011087	AAAT	3	142075	142085	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	19447660
59	NC_011087	TAAA	3	142400	142411	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_011087	ACAA	3	143937	143948	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
61	NC_011087	TAAG	3	147934	147945	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	19447661
62	NC_011087	ATGC	3	149044	149055	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	19447661
63	NC_011087	ATTT	3	150970	150982	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_011087	GTTA	3	151068	151078	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_011087	AGGT	3	158485	158495	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	19447662
66	NC_011087	ATGG	3	159237	159248	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	19447662
67	NC_011087	TGCA	3	160382	160394	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
68	NC_011087	TTAC	3	162421	162431	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	19447662
69	NC_011087	TTGA	3	163683	163694	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	19447662
70	NC_011087	TTTA	3	164473	164485	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_011087	ATTG	3	164487	164498	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_011087	TCGC	3	166873	166885	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
73	NC_011087	TGAA	3	172558	172568	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_011087	ATAA	3	179743	179753	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	19447664
75	NC_011087	CTAC	3	182037	182047	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	19447664
76	NC_011087	TAAT	3	191364	191375	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447665
77	NC_011087	TCAC	3	192829	192839	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	19447665
78	NC_011087	ATTA	5	193270	193293	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_011087	AATT	3	197523	197534	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_011087	TTAA	3	200839	200850	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_011087	TTTA	3	201226	201236	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_011087	TGAA	3	201617	201627	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	19447665
83	NC_011087	CAAT	3	214311	214321	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	19447667
84	NC_011087	AAAC	3	215671	215682	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	19447667
85	NC_011087	TGAT	3	217436	217447	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	19447667
86	NC_011087	CATT	3	217591	217601	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	19447667
87	NC_011087	TTTC	3	226028	226038	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
88	NC_011087	AATT	3	226582	226592	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447668
89	NC_011087	ATTA	3	235433	235444	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447669
90	NC_011087	TAAA	3	242508	242518	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_011087	AATT	3	246438	246448	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	19447670
92	NC_011087	CGAG	3	254683	254694	12	25 %	0 %	50 %	25 %	0 %	19447671
93	NC_011087	GTTA	3	257370	257380	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	19447671
94	NC_011087	TAAA	3	266398	266408	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_011087	ATAA	3	270021	270031	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_011087	TTAA	3	276447	276459	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_011087	TTTA	3	279216	279226	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	19447673
98	NC_011087	TGAA	3	285080	285092	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	19447673
99	NC_011087	ATTA	7	290045	290073	29	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	19447674
100	NC_011087	ATTT	3	290894	290905	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	19447674
101	NC_011087	ATTA	3	292412	292423	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011087	TAAA	3	292431	292442	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_011087	ATCG	3	295766	295776	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	19447674
104	NC_011087	AAAG	3	299249	299259	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	19447674
105	NC_011087	ATTT	3	302286	302296	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	19447675
106	NC_011087	AGAA	3	302836	302846	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_011087	TAAT	3	303071	303082	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_011087	AAAG	3	306316	306327	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_011087	TAAG	3	315262	315272	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_011087	TTTA	3	317415	317426	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_011087	AATG	3	318550	318561	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	19447675
112	NC_011087	TAAA	3	320940	320951	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	19447676
113	NC_011087	ATCC	3	325248	325260	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	19447676
114	NC_011087	CAAA	3	332194	332205	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
115	NC_011087	TTTA	3	337818	337829	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	19447677
116	NC_011087	TTAA	3	344464	344475	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	19447678
117	NC_011087	TTTA	3	345293	345304	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_011087	ACCC	3	351612	351623	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	19447679
119	NC_011087	CTTG	3	352545	352556	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	19447679
120	NC_011087	TTTG	3	355277	355288	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	19447679
121	NC_011087	CTTT	3	355877	355888	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011087	GTTA	3	356880	356890	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	19447679
123	NC_011087	AGTG	3	358911	358921	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	19447679
124	NC_011087	ACTG	3	360549	360560	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	19447679
125	NC_011087	ACCA	4	362241	362256	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	19447679
126	NC_011087	TAAT	3	364881	364892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_011087	AATT	3	366370	366380	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_011087	TTGG	3	370868	370879	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	19447680
129	NC_011087	TAAA	3	371337	371348	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	19447680
130	NC_011087	ATAA	3	373765	373776	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	19447680
131	NC_011087	AATA	4	377888	377903	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_011087	TAAC	3	386052	386063	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
133	NC_011087	AATG	3	387693	387704	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	19447682
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135	NC_011087	GATG	3	391480	391491	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	19447682
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Paulinella chromatophora chromatophore