ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Oryza sativa Japonica Group mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_011033TTTCTT31543115449190 %83.33 %0 %16.67 %10 %19403321
2NC_011033GGGAGA345222452401933.33 %0 %66.67 %0 %10 %19403321
3NC_011033TTTCTT3109958109976190 %83.33 %0 %16.67 %10 %19403321
4NC_011033GGGAGA31397491397671933.33 %0 %66.67 %0 %10 %19403321
5NC_011033CTTTTT3168854168870170 %83.33 %0 %16.67 %5 %19403321
6NC_011033TGGTGA31775501775671816.67 %33.33 %50 %0 %5 %19403321
7NC_011033AAATAA31818311818481883.33 %16.67 %0 %0 %0 %19403321
8NC_011033CTAGCC32022712022871716.67 %16.67 %16.67 %50 %5 %19403321
9NC_011033TATTGG32235322235491816.67 %50 %33.33 %0 %5 %19403321
10NC_011033TCAAAG32526182526341750 %16.67 %16.67 %16.67 %5 %19403321
11NC_011033GCTATG32732662732821716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %5 %19403321
12NC_011033CCATTG32830982831151816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %5 %19403321
13NC_011033AAATTG53021423021713050 %33.33 %16.67 %0 %6 %19403321
14NC_011033CCATTG34140174140341816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %5 %Non-Coding