ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_011031AATT31601701150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_011031ATTT3140614161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_011031ATAA3210621161175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_011031AAAT3238423951275 %25 %0 %0 %8 %194033328
5NC_011031AATT3287428851250 %50 %0 %0 %8 %194033328
6NC_011031AATT3290129121250 %50 %0 %0 %8 %194033328
7NC_011031AATT3294129521250 %50 %0 %0 %8 %194033328
8NC_011031ATTT3300230131225 %75 %0 %0 %8 %194033328
9NC_011031TAAA3331633281375 %25 %0 %0 %7 %194033328
10NC_011031GTTT340414051110 %75 %25 %0 %9 %194033328
11NC_011031AAAC3406640761175 %0 %0 %25 %9 %194033328
12NC_011031AATT3495949701250 %50 %0 %0 %8 %194033328
13NC_011031AATT3563456451250 %50 %0 %0 %8 %194033328
14NC_011031AAAT3574757581275 %25 %0 %0 %8 %194033328
15NC_011031ATAA3596259731275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_011031GTTT367336743110 %75 %25 %0 %9 %194033276
17NC_011031TTAA3735173611150 %50 %0 %0 %9 %194033276
18NC_011031AAAT3784578571375 %25 %0 %0 %7 %194033276
19NC_011031ATAG3793079421350 %25 %25 %0 %7 %194033276
20NC_011031GTTT394059415110 %75 %25 %0 %9 %194033276
21NC_011031AATG310690107011250 %25 %25 %0 %8 %194033276
22NC_011031ATTT312494125041125 %75 %0 %0 %9 %194033276
23NC_011031ATTA312600126121350 %50 %0 %0 %7 %194033276
24NC_011031AATT313904139161350 %50 %0 %0 %7 %194033276
25NC_011031ATTT314425144361225 %75 %0 %0 %8 %194033276
26NC_011031TTCA314745147551125 %50 %0 %25 %9 %194033276
27NC_011031TTTA317689177001225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
28NC_011031TAAA318074180841175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_011031TAAA320480204901175 %25 %0 %0 %9 %194033288
30NC_011031TAAA320547205581275 %25 %0 %0 %8 %194033288
31NC_011031ATTT421875218901625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
32NC_011031AAAT322836228471275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_011031AATT325792258031250 %50 %0 %0 %8 %194033272
34NC_011031TGTA327016270271225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
35NC_011031TAAA331531315431375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_011031ATTA332352323641350 %50 %0 %0 %7 %194033270
37NC_011031TTTA332874328851225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_011031AATT333294333051250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
39NC_011031TTAT333306333161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
40NC_011031TTAA333619336301250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
41NC_011031TAAT434506345201550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
42NC_011031AAAT337627376371175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_011031ATAA338331383421275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_011031ATTT338725387361225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_011031TAAA338751387611175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
46NC_011031AAAT438828388421575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
47NC_011031ACTT340711407211125 %50 %0 %25 %9 %194033289
48NC_011031TTTC34269242702110 %75 %0 %25 %9 %194033330
49NC_011031AAAT343048430591275 %25 %0 %0 %8 %194033330
50NC_011031TTTG34365643667120 %75 %25 %0 %8 %194033330
51NC_011031TTTA344589446001225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_011031TATT346335463451125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_011031ATTT346874468841125 %75 %0 %0 %9 %194033324
54NC_011031TCTT34691946929110 %75 %0 %25 %9 %194033324
55NC_011031ATTT350613506241225 %75 %0 %0 %8 %194033324
56NC_011031AATT350900509111250 %50 %0 %0 %8 %194033324
57NC_011031AGTT351361513711125 %50 %25 %0 %9 %194033324
58NC_011031GTTT35254152552120 %75 %25 %0 %8 %194033324
59NC_011031ATTG354100541101125 %50 %25 %0 %9 %194033324
60NC_011031AAAT356093561031175 %25 %0 %0 %9 %194033324
61NC_011031ATTT357453574641225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
62NC_011031AATT357579575891150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_011031TTTA358264582741125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
64NC_011031AATC358297583071150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
65NC_011031ATTT359457594721625 %75 %0 %0 %6 %194033295
66NC_011031ATAC460096601111650 %25 %0 %25 %6 %Non-Coding
67NC_011031TATT360226602371225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_011031ATTT360579605891125 %75 %0 %0 %9 %194033331
69NC_011031ATTT360909609191125 %75 %0 %0 %9 %194033331
70NC_011031AAAT362027620371175 %25 %0 %0 %9 %194033331
71NC_011031TGTA363085630961225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
72NC_011031GAAT365662656721150 %25 %25 %0 %9 %194033317
73NC_011031TGAC365760657711225 %25 %25 %25 %8 %194033317
74NC_011031TGTT36679166802120 %75 %25 %0 %8 %194033317
75NC_011031TACA367205672161250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
76NC_011031TTTG36737467384110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
77NC_011031AATA368945689551175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
78NC_011031AAAT369552695631275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_011031TAAT371324713351250 %50 %0 %0 %0 %Non-Coding
80NC_011031ATGT371577715871125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
81NC_011031ATTT372980729921325 %75 %0 %0 %7 %194033309
82NC_011031AATT373037730471150 %50 %0 %0 %9 %194033309
83NC_011031ATTT374220742301125 %75 %0 %0 %9 %194033309
84NC_011031TTTC37679276803120 %75 %0 %25 %8 %194033309
85NC_011031TAAA376820768301175 %25 %0 %0 %9 %194033309
86NC_011031ATTT379075790851125 %75 %0 %0 %9 %194033333
87NC_011031GTAT381240812511225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
88NC_011031CAAT387634876451250 %25 %0 %25 %8 %194033286
89NC_011031CATA488711887261650 %25 %0 %25 %6 %194033286
90NC_011031AACT489039890531550 %25 %0 %25 %6 %194033286
91NC_011031TACA389702897131250 %25 %0 %25 %8 %194033286
92NC_011031AATA394584945951275 %25 %0 %0 %8 %194033341
93NC_011031TATT395393954041225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
94NC_011031ATGA399266992771250 %25 %25 %0 %8 %194033322
95NC_011031TTTC39935799368120 %75 %0 %25 %8 %194033322
96NC_011031CGGA399537995471125 %0 %50 %25 %9 %194033322
97NC_011031AAAT41000801000951675 %25 %0 %0 %6 %194033322
98NC_011031CAAA31024611024711175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
99NC_011031TAAA31029611029721275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
100NC_011031AATA31050101050211275 %25 %0 %0 %8 %194033349
101NC_011031TACA31058081058191250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
102NC_011031GGTT3105968105980130 %50 %50 %0 %7 %Non-Coding
103NC_011031TACC31096311096421225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
104NC_011031TACA31113641113741150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
105NC_011031TACA31118011118121250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
106NC_011031TGTA31120091120201225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
107NC_011031TACA31120411120521250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
108NC_011031CATT31143741143851225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
109NC_011031TACA31148251148361250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
110NC_011031TTTG3116737116747110 %75 %25 %0 %9 %194033281
111NC_011031AATT31168901169011250 %50 %0 %0 %8 %194033281
112NC_011031TAGT31190891191031525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
113NC_011031ATTT31211331211431125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
114NC_011031TAAC31211931212031150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
115NC_011031AAAT31214951215061275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_011031AATA31228721228821175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
117NC_011031AATT31243261243361150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
118NC_011031ATAA41248301248451675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
119NC_011031GAAA31258631258741275 %0 %25 %0 %8 %194033363
120NC_011031TTAA51265921266112050 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
121NC_011031TTAA31281691281801250 %50 %0 %0 %8 %194033283
122NC_011031TTAA31283141283251250 %50 %0 %0 %0 %194033283
123NC_011031AAAT31321671321771175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
124NC_011031ATTT31330761330861125 %75 %0 %0 %9 %194033318
125NC_011031TTGA31335111335211125 %50 %25 %0 %9 %194033318
126NC_011031GTTT3133687133698120 %75 %25 %0 %8 %194033318
127NC_011031TTAA31341201341321350 %50 %0 %0 %7 %194033318
128NC_011031TTAA31342221342331250 %50 %0 %0 %8 %194033318
129NC_011031TATT31347061347171225 %75 %0 %0 %8 %194033318
130NC_011031ATTT31352371352471125 %75 %0 %0 %9 %194033318
131NC_011031TTTA41364071364221625 %75 %0 %0 %6 %194033318
132NC_011031ATTT31364521364631225 %75 %0 %0 %8 %194033318
133NC_011031GAAT31371631371731150 %25 %25 %0 %9 %194033318
134NC_011031TGTT5137814137833200 %75 %25 %0 %10 %194033318
135NC_011031ATTT31379641379741125 %75 %0 %0 %9 %194033318
136NC_011031TTTA31382431382531125 %75 %0 %0 %9 %194033318
137NC_011031TAAA31384881384991275 %25 %0 %0 %0 %194033318
138NC_011031AAAT31385471385581275 %25 %0 %0 %8 %194033318
139NC_011031AATT31387381387481150 %50 %0 %0 %9 %194033318
140NC_011031TTTC3140216140226110 %75 %0 %25 %9 %194033318
141NC_011031TACA31426441426551250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
142NC_011031TAAT31431581431691250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
143NC_011031AATA31437741437841175 %25 %0 %0 %9 %194033278
144NC_011031ATAA31465381465491275 %25 %0 %0 %8 %194033282
145NC_011031ATAA31473481473581175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
146NC_011031TTTA31484381484481125 %75 %0 %0 %9 %194033310
147NC_011031TTTA31488581488681125 %75 %0 %0 %9 %194033310
148NC_011031AAAC31498491498601275 %0 %0 %25 %8 %194033310
149NC_011031ATTT31498921499021125 %75 %0 %0 %9 %194033310
150NC_011031TGTT3151473151484120 %75 %25 %0 %8 %194033310
151NC_011031TAAA31517711517831375 %25 %0 %0 %7 %194033310
152NC_011031TATT31528161528261125 %75 %0 %0 %9 %194033310
153NC_011031TATT41529181529331625 %75 %0 %0 %6 %194033310
154NC_011031TATT31554391554491125 %75 %0 %0 %9 %194033310
155NC_011031ATAA31554561554661175 %25 %0 %0 %9 %194033310
156NC_011031GTTT3159521159532120 %75 %25 %0 %8 %194033316
157NC_011031ATGT31619701619811225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
158NC_011031TGTA31620751620861225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
159NC_011031AATG31625261625371250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
160NC_011031TGTA31648591648701225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
161NC_011031TGTA31650991651101225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
162NC_011031TGTA31655371655471125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
163NC_011031AACC31709311709431350 %0 %0 %50 %7 %Non-Coding
164NC_011031TGTA31710921711031225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
165NC_011031TTAT31718891719001225 %75 %0 %0 %8 %194033350
166NC_011031TTTA31739391739501225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
167NC_011031TTTG3174440174450110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
168NC_011031AGAA31775421775531275 %0 %25 %0 %8 %194033353
169NC_011031TCAT31776341776451225 %50 %0 %25 %8 %194033353
170NC_011031TAAA41804471804631775 %25 %0 %0 %5 %Non-Coding
171NC_011031TATT31823161823271225 %75 %0 %0 %8 %194033354
172NC_011031TTTA31837191837311325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
173NC_011031TGTA31871981872091225 %50 %25 %0 %8 %194033355
174NC_011031GTTA31878591878691125 %50 %25 %0 %9 %194033355
175NC_011031GTAT41881881882021525 %50 %25 %0 %6 %194033355
176NC_011031ATCC31950291950401225 %25 %0 %50 %8 %194033355
177NC_011031CATA31956591956701250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding