ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011031	AT	6	2057	2067	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011031	AT	8	5939	5953	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_011031	AT	6	17786	17796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011031	AT	7	22064	22076	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_011031	TG	6	26335	26345	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	194033272
6	NC_011031	AT	6	28313	28323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_011031	TA	6	29221	29232	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033265
8	NC_011031	AT	6	31773	31784	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_011031	AT	6	36345	36357	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_011031	TG	6	45074	45084	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	194033323
11	NC_011031	CA	6	60047	60057	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011031	TG	6	64460	64471	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_011031	TG	6	80839	80850	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_011031	TG	6	81019	81030	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_011031	TG	7	81127	81139	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_011031	CA	6	90563	90573	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	194033286
17	NC_011031	AT	6	96212	96225	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_011031	AT	6	96227	96237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_011031	TA	6	96832	96845	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_011031	TG	6	104807	104818	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_011031	CA	6	109255	109265	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
22	NC_011031	AC	6	111399	111409	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
23	NC_011031	AC	8	111476	111491	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
24	NC_011031	AC	6	111508	111518	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
25	NC_011031	GT	6	114393	114404	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011031	TG	6	114529	114539	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_011031	AC	6	115459	115470	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
28	NC_011031	TG	7	115615	115628	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_011031	TA	6	125793	125803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033363
30	NC_011031	AT	8	125915	125929	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	194033363
31	NC_011031	TA	6	127650	127660	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033283
32	NC_011031	AC	6	161286	161297	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
33	NC_011031	GT	6	161441	161452	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_011031	CA	7	162373	162385	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
35	NC_011031	AC	6	162507	162518	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011031	TG	6	165392	165402	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011031	GT	8	165420	165435	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_011031	GT	6	165503	165514	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_011031	TG	6	167646	167656	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_011031	CA	6	172093	172104	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
41	NC_011031	AT	6	180069	180080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_011031	AT	6	180093	180104	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_011031	TA	6	180673	180683	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_011031	TA	6	180687	180700	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_011031	TA	6	185399	185409	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033355
46	NC_011031	TG	6	186338	186348	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	194033355
47	NC_011031	AC	7	195771	195783	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_011031	CA	6	196061	196072	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast