ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011031	AATT	3	160	170	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_011031	ATT	4	193	204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_011031	ATA	4	735	745	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011031	ATA	4	831	841	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_011031	ATTT	3	1406	1416	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_011031	ATAAA	3	1683	1697	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011031	AT	6	2057	2067	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_011031	ATAA	3	2106	2116	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_011031	AAAT	3	2384	2395	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194033328
10	NC_011031	ATA	4	2629	2640	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033328
11	NC_011031	TGT	4	2788	2800	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	194033328
12	NC_011031	AATT	3	2874	2885	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033328
13	NC_011031	AATT	3	2901	2912	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033328
14	NC_011031	AATT	3	2941	2952	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033328
15	NC_011031	ATTT	3	3002	3013	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	194033328
16	NC_011031	TAAA	3	3316	3328	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	194033328
17	NC_011031	TAA	4	3760	3771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033328
18	NC_011031	GTTT	3	4041	4051	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	194033328
19	NC_011031	AAAC	3	4066	4076	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	194033328
20	NC_011031	TTG	4	4582	4592	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	194033328
21	NC_011031	T	17	4751	4767	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	194033328
22	NC_011031	AATT	3	4959	4970	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033328
23	NC_011031	ATG	4	5272	5283	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	194033328
24	NC_011031	TAA	4	5422	5433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033328
25	NC_011031	T	12	5578	5589	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	194033328
26	NC_011031	AATT	3	5634	5645	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033328
27	NC_011031	AAAT	3	5747	5758	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194033328
28	NC_011031	AT	8	5939	5953	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_011031	ATAA	3	5962	5973	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_011031	GTTT	3	6733	6743	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	194033276
31	NC_011031	TTAA	3	7351	7361	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033276
32	NC_011031	AAAT	3	7845	7857	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	194033276
33	NC_011031	ATAG	3	7930	7942	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	194033276
34	NC_011031	AGA	4	8109	8119	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	194033276
35	NC_011031	TGA	4	8185	8195	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	194033276
36	NC_011031	ATCTTC	3	8421	8438	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	194033276
37	NC_011031	ATT	4	9018	9029	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033276
38	NC_011031	GTTT	3	9405	9415	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	194033276
39	NC_011031	ATA	4	9794	9804	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033276
40	NC_011031	TTTATT	3	10239	10257	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	194033276
41	NC_011031	TTCGA	3	10350	10364	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	194033276
42	NC_011031	AATG	3	10690	10701	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	194033276
43	NC_011031	AAT	4	10993	11004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	194033276
44	NC_011031	ATTAT	4	11841	11860	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	194033276
45	NC_011031	TAA	4	11861	11871	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033276
46	NC_011031	TAT	4	12410	12424	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	194033276
47	NC_011031	ATT	4	12427	12437	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033276
48	NC_011031	ATTT	3	12494	12504	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033276
49	NC_011031	ATTA	3	12600	12612	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	194033276
50	NC_011031	TGT	4	12887	12898	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	194033276
51	NC_011031	T	15	13039	13053	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	194033276
52	NC_011031	TAT	4	13155	13165	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033276
53	NC_011031	T	14	13647	13660	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	194033276
54	NC_011031	AATT	3	13904	13916	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	194033276
55	NC_011031	ATT	4	14144	14156	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	194033276
56	NC_011031	ATTT	3	14425	14436	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	194033276
57	NC_011031	TTCA	3	14745	14755	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	194033276
58	NC_011031	TAA	4	14892	14903	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033276
59	NC_011031	TAA	4	17512	17525	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_011031	TTTA	3	17689	17700	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_011031	AT	6	17786	17796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_011031	TTA	4	18035	18047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_011031	TAAA	3	18074	18084	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_011031	TAT	4	19047	19058	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033288
65	NC_011031	TAA	5	19643	19656	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033288
66	NC_011031	ACTTT	3	19683	19697	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	194033288
67	NC_011031	TAAA	3	20480	20490	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194033288
68	NC_011031	TAAA	3	20547	20558	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194033288
69	NC_011031	AAGAAA	3	20744	20760	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	194033288
70	NC_011031	TTAAA	3	21436	21449	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	194033288
71	NC_011031	TTC	4	21610	21621	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	194033288
72	NC_011031	TGC	4	21654	21665	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033288
73	NC_011031	ATTT	4	21875	21890	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_011031	AT	7	22064	22076	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_011031	TTAAA	3	22278	22291	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_011031	AAAATA	3	22516	22533	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_011031	AAAT	3	22836	22847	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_011031	TAA	7	23050	23068	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
79	NC_011031	ATT	4	23726	23737	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033274
80	NC_011031	CGA	4	23913	23924	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033274
81	NC_011031	AATT	3	25792	25803	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033272
82	NC_011031	TG	6	26335	26345	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	194033272
83	NC_011031	TGTA	3	27016	27027	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_011031	TAA	4	28131	28141	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_011031	AT	6	28313	28323	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_011031	TA	6	29221	29232	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033265
87	NC_011031	TAAA	3	31531	31543	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_011031	AT	6	31773	31784	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_011031	AGA	4	32259	32270	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033270
90	NC_011031	ATTA	3	32352	32364	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	194033270
91	NC_011031	TTTA	3	32874	32885	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_011031	AATT	3	33294	33305	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_011031	TTAT	3	33306	33316	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_011031	TTAA	3	33619	33630	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_011031	TAT	5	33951	33965	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_011031	TAAT	4	34506	34520	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_011031	ATT	4	34629	34640	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_011031	ATT	4	35711	35721	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_011031	TTTGA	4	35887	35905	19	20 %	60 %	20 %	0 %	10 %	270267293
100	NC_011031	AT	6	36345	36357	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_011031	ATT	4	36968	36978	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_011031	AAAT	3	37627	37637	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_011031	T	12	37673	37684	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_011031	ATAA	3	38331	38342	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_011031	TAA	4	38512	38522	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_011031	ATTT	3	38725	38736	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_011031	TAAA	3	38751	38761	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_011031	AAAT	4	38828	38842	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_011031	AGAGT	7	40071	40104	34	40 %	20 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_011031	TTA	4	40621	40632	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	194033289
111	NC_011031	ACTT	3	40711	40721	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	194033289
112	NC_011031	TGTTTT	3	40971	40988	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	194033289
113	NC_011031	TTTC	3	42692	42702	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	194033330
114	NC_011031	AAAT	3	43048	43059	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194033330
115	NC_011031	TTTGT	3	43180	43193	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	194033330
116	NC_011031	TTTG	3	43656	43667	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	194033330
117	NC_011031	TTA	4	44447	44458	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_011031	TTTA	3	44589	44600	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_011031	TG	6	45074	45084	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	194033323
120	NC_011031	CAG	4	45682	45693	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033323
121	NC_011031	T	16	46037	46052	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_011031	TATT	3	46335	46345	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_011031	TGATTT	3	46539	46555	17	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
124	NC_011031	ATTT	3	46874	46884	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033324
125	NC_011031	TCTT	3	46919	46929	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	194033324
126	NC_011031	ATA	4	47600	47611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033324
127	NC_011031	ATT	4	47891	47902	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033324
128	NC_011031	TTG	4	48410	48421	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	194033324
129	NC_011031	CTT	4	48441	48452	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	194033324
130	NC_011031	ATTT	3	50613	50624	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	194033324
131	NC_011031	AATT	3	50900	50911	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033324
132	NC_011031	AGTT	3	51361	51371	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	194033324
133	NC_011031	ATT	4	51566	51577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033324
134	NC_011031	TTTATT	3	52344	52360	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	194033324
135	NC_011031	GTTT	3	52541	52552	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	194033324
136	NC_011031	TAT	4	52820	52833	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	194033324
137	NC_011031	ATTG	3	54100	54110	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	194033324
138	NC_011031	AAAT	3	56093	56103	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194033324
139	NC_011031	TAA	4	57317	57327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_011031	ATTT	3	57453	57464	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_011031	AATT	3	57579	57589	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_011031	TTTA	3	58264	58274	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_011031	AATC	3	58297	58307	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
144	NC_011031	T	12	58669	58680	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_011031	TAA	5	58695	58708	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_011031	ATTT	3	59457	59472	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	194033295
147	NC_011031	CA	6	60047	60057	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
148	NC_011031	ATAC	4	60096	60111	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
149	NC_011031	TATT	3	60226	60237	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_011031	ATT	4	60274	60284	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_011031	ATTT	3	60579	60589	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033331
152	NC_011031	AAT	4	60859	60870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033331
153	NC_011031	ATTT	3	60909	60919	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033331
154	NC_011031	AAAT	3	62027	62037	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194033331
155	NC_011031	TGTA	3	63085	63096	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_011031	TG	6	64460	64471	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
157	NC_011031	AAT	5	64855	64870	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	194033296
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160	NC_011031	TGAC	3	65760	65771	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	194033317
161	NC_011031	TGTT	3	66791	66802	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	194033317
162	NC_011031	TACA	3	67205	67216	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
163	NC_011031	TTTG	3	67374	67384	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
164	NC_011031	AAACT	3	68520	68534	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
165	NC_011031	AATA	3	68945	68955	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
166	NC_011031	ATT	7	69266	69286	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_011031	AAAT	3	69552	69563	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
168	NC_011031	AAATA	3	70689	70703	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
169	NC_011031	TAAT	3	71324	71335	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011031	ATGT	3	71577	71587	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
171	NC_011031	TTTTA	4	71627	71646	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
172	NC_011031	T	15	71665	71679	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
173	NC_011031	TAA	4	72966	72977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033309
174	NC_011031	ATTT	3	72980	72992	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	194033309
175	NC_011031	AATT	3	73037	73047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033309
176	NC_011031	TTA	4	73548	73558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033309
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178	NC_011031	ATTT	3	74220	74230	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033309
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181	NC_011031	TAT	4	75148	75159	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033309
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184	NC_011031	TAAA	3	76820	76830	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194033309
185	NC_011031	A	12	78457	78468	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	194033333
186	NC_011031	A	14	78905	78918	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	194033333
187	NC_011031	ATTT	3	79075	79085	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033333
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190	NC_011031	TTGAT	3	80882	80895	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
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192	NC_011031	TG	6	81019	81030	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
193	NC_011031	TG	7	81127	81139	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
194	NC_011031	GTAT	3	81240	81251	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
195	NC_011031	TAA	4	83399	83409	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033286
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202	NC_011031	CATA	4	88711	88726	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	194033286
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211	NC_011031	ATA	4	95153	95165	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
212	NC_011031	TAA	4	95203	95213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
213	NC_011031	TATT	3	95393	95404	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_011031	AT	6	96212	96225	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
215	NC_011031	AT	6	96227	96237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
216	NC_011031	ATT	4	96596	96606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
217	NC_011031	TA	6	96832	96845	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
218	NC_011031	TTTTA	3	97417	97431	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
219	NC_011031	ATGA	3	99266	99277	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	194033322
220	NC_011031	TTTC	3	99357	99368	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	194033322
221	NC_011031	TAC	4	99405	99416	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	194033322
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227	NC_011031	AAT	4	100534	100544	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
228	NC_011031	CAAA	3	102461	102471	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
229	NC_011031	ATG	4	102495	102505	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
230	NC_011031	A	20	102507	102526	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
231	NC_011031	TAAA	3	102961	102972	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_011031	AGC	4	103347	103358	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033348
233	NC_011031	TG	6	104807	104818	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
234	NC_011031	AATA	3	105010	105021	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	194033349
235	NC_011031	TACA	3	105808	105819	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
236	NC_011031	GGTT	3	105968	105980	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
237	NC_011031	CAAATC	3	106115	106132	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
238	NC_011031	AAAGA	3	106530	106544	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_011031	CA	6	109255	109265	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
240	NC_011031	TACC	3	109631	109642	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
241	NC_011031	TACA	3	111364	111374	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
242	NC_011031	AC	6	111399	111409	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
243	NC_011031	AC	8	111476	111491	16	50 %	0 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
244	NC_011031	AC	6	111508	111518	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
245	NC_011031	TACA	3	111801	111812	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
246	NC_011031	TGTA	3	112009	112020	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
247	NC_011031	TACA	3	112041	112052	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
248	NC_011031	TCCTC	3	112543	112556	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
249	NC_011031	CATT	3	114374	114385	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
250	NC_011031	GT	6	114393	114404	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_011031	TG	6	114529	114539	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
252	NC_011031	TACA	3	114825	114836	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
253	NC_011031	AC	6	115459	115470	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
254	NC_011031	TG	7	115615	115628	14	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
255	NC_011031	AAT	4	116167	116178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
256	NC_011031	TTTG	3	116737	116747	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	194033281
257	NC_011031	AATT	3	116890	116901	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033281
258	NC_011031	TAGT	3	119089	119103	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
259	NC_011031	ATA	4	119844	119856	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033266
260	NC_011031	ATTT	3	121133	121143	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
261	NC_011031	TAAC	3	121193	121203	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
262	NC_011031	AAAT	3	121495	121506	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
263	NC_011031	AGA	4	121902	121913	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033305
264	NC_011031	AATA	3	122872	122882	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
265	NC_011031	ATCTTT	24	122928	123072	145	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	2 %	Non-Coding
266	NC_011031	CAAAA	3	123709	123722	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	194033311
267	NC_011031	AATT	3	124326	124336	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
268	NC_011031	CGA	4	124393	124404	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033306
269	NC_011031	ATA	4	124492	124503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
270	NC_011031	ATAAAA	3	124647	124665	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
271	NC_011031	ATAA	4	124830	124845	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
272	NC_011031	TA	6	125793	125803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033363
273	NC_011031	GAAA	3	125863	125874	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	194033363
274	NC_011031	AT	8	125915	125929	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	194033363
275	NC_011031	ACAAT	3	126150	126165	16	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
276	NC_011031	TTAA	5	126592	126611	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
277	NC_011031	TA	6	127650	127660	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033283
278	NC_011031	ATTTGT	3	127956	127973	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	194033283
279	NC_011031	T	14	127998	128011	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	194033283
280	NC_011031	TTAA	3	128169	128180	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033283
281	NC_011031	TTAA	3	128314	128325	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	194033283
282	NC_011031	TTAATT	4	128390	128413	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033283
283	NC_011031	T	12	128974	128985	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
284	NC_011031	AAAAT	3	129042	129055	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
285	NC_011031	ATT	4	129380	129390	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
286	NC_011031	ACCTA	3	130109	130122	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	194033287
287	NC_011031	AAAT	3	132167	132177	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
288	NC_011031	AAAAT	3	132245	132258	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
289	NC_011031	AAT	4	132274	132286	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
290	NC_011031	TATTT	4	132454	132474	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
291	NC_011031	ATTT	3	133076	133086	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033318
292	NC_011031	TTGA	3	133511	133521	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	194033318
293	NC_011031	GTTT	3	133687	133698	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	194033318
294	NC_011031	TTTAAA	3	133920	133938	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	194033318
295	NC_011031	TTAA	3	134120	134132	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	194033318
296	NC_011031	TTAA	3	134222	134233	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	194033318
297	NC_011031	TATT	3	134706	134717	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	194033318
298	NC_011031	TAA	4	134900	134912	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033318
299	NC_011031	ATTT	3	135237	135247	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033318
300	NC_011031	AAT	4	136098	136108	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033318
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302	NC_011031	TTTA	4	136407	136422	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	194033318
303	NC_011031	ATTT	3	136452	136463	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	194033318
304	NC_011031	TTGAT	4	136674	136693	20	20 %	60 %	20 %	0 %	10 %	194033318
305	NC_011031	TTTTA	3	136715	136728	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	194033318
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308	NC_011031	TGTT	5	137814	137833	20	0 %	75 %	25 %	0 %	10 %	194033318
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310	NC_011031	TTTA	3	138243	138253	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033318
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313	NC_011031	AATT	3	138738	138748	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	194033318
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321	NC_011031	T	13	141114	141126	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
322	NC_011031	CTTTT	3	141141	141155	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
323	NC_011031	ATA	4	141968	141979	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
324	NC_011031	TACA	3	142644	142655	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
325	NC_011031	TAAT	3	143158	143169	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
326	NC_011031	AATA	3	143774	143784	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194033278
327	NC_011031	TAA	4	144491	144502	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
328	NC_011031	GTA	4	145124	145136	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	194033282
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331	NC_011031	ATGCTA	3	145698	145715	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	194033282
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333	NC_011031	TAT	4	147175	147185	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
334	NC_011031	ATAA	3	147348	147358	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
335	NC_011031	TTTA	3	148438	148448	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	194033310
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339	NC_011031	ATAAA	3	150360	150373	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	194033310
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352	NC_011031	TATT	4	152918	152933	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	194033310
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357	NC_011031	ATAA	3	155456	155466	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	194033310
358	NC_011031	TAA	4	155491	155502	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
359	NC_011031	AAATT	3	155709	155723	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	194033303
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365	NC_011031	T	13	158359	158371	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
366	NC_011031	TTA	4	158848	158859	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
367	NC_011031	T	13	158948	158960	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	194033316
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370	NC_011031	GTTT	3	159521	159532	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	194033316
371	NC_011031	TAT	4	159898	159909	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033308
372	NC_011031	TTTTA	3	159976	159990	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	194033308
373	NC_011031	AC	6	161286	161297	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
374	NC_011031	GT	6	161441	161452	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
375	NC_011031	ATT	4	161837	161847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033345
376	NC_011031	ATGT	3	161970	161981	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
377	NC_011031	TGTA	3	162075	162086	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
378	NC_011031	CA	7	162373	162385	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
379	NC_011031	AC	6	162507	162518	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
380	NC_011031	AATG	3	162526	162537	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
381	NC_011031	TGTA	3	164859	164870	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
382	NC_011031	TGTA	3	165099	165110	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
383	NC_011031	TG	6	165392	165402	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
384	NC_011031	GT	8	165420	165435	16	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
385	NC_011031	GT	6	165503	165514	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
386	NC_011031	TGTA	3	165537	165547	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
387	NC_011031	TG	6	167646	167656	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
388	NC_011031	TTCTT	3	170366	170380	15	0 %	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
389	NC_011031	ATTTGG	3	170780	170797	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
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391	NC_011031	TGTA	3	171092	171103	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
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395	NC_011031	TTTA	3	173939	173950	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_011031	CATA	3	195659	195670	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
435	NC_011031	AC	7	195771	195783	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
436	NC_011031	TGT	4	195935	195947	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
437	NC_011031	CA	6	196061	196072	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast