ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011031	ATT	4	193	204	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_011031	ATA	4	735	745	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_011031	ATA	4	831	841	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011031	ATA	4	2629	2640	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033328
5	NC_011031	TGT	4	2788	2800	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	194033328
6	NC_011031	TAA	4	3760	3771	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033328
7	NC_011031	TTG	4	4582	4592	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	194033328
8	NC_011031	ATG	4	5272	5283	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	194033328
9	NC_011031	TAA	4	5422	5433	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033328
10	NC_011031	AGA	4	8109	8119	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	194033276
11	NC_011031	TGA	4	8185	8195	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	194033276
12	NC_011031	ATT	4	9018	9029	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033276
13	NC_011031	ATA	4	9794	9804	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033276
14	NC_011031	AAT	4	10993	11004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	194033276
15	NC_011031	TAA	4	11861	11871	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033276
16	NC_011031	TAT	4	12410	12424	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	194033276
17	NC_011031	ATT	4	12427	12437	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033276
18	NC_011031	TGT	4	12887	12898	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	194033276
19	NC_011031	TAT	4	13155	13165	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033276
20	NC_011031	ATT	4	14144	14156	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	194033276
21	NC_011031	TAA	4	14892	14903	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033276
22	NC_011031	TAA	4	17512	17525	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_011031	TTA	4	18035	18047	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_011031	TAT	4	19047	19058	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033288
25	NC_011031	TAA	5	19643	19656	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033288
26	NC_011031	TTC	4	21610	21621	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	194033288
27	NC_011031	TGC	4	21654	21665	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033288
28	NC_011031	TAA	7	23050	23068	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_011031	ATT	4	23726	23737	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033274
30	NC_011031	CGA	4	23913	23924	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033274
31	NC_011031	TAA	4	28131	28141	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_011031	AGA	4	32259	32270	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033270
33	NC_011031	TAT	5	33951	33965	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_011031	ATT	4	34629	34640	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_011031	ATT	4	35711	35721	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_011031	ATT	4	36968	36978	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_011031	TAA	4	38512	38522	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_011031	TTA	4	40621	40632	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	194033289
39	NC_011031	TTA	4	44447	44458	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_011031	CAG	4	45682	45693	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033323
41	NC_011031	ATA	4	47600	47611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033324
42	NC_011031	ATT	4	47891	47902	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033324
43	NC_011031	TTG	4	48410	48421	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	194033324
44	NC_011031	CTT	4	48441	48452	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	194033324
45	NC_011031	ATT	4	51566	51577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033324
46	NC_011031	TAT	4	52820	52833	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	194033324
47	NC_011031	TAA	4	57317	57327	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_011031	TAA	5	58695	58708	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_011031	ATT	4	60274	60284	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_011031	AAT	4	60859	60870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033331
51	NC_011031	AAT	5	64855	64870	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	194033296
52	NC_011031	TAA	4	65325	65335	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033317
53	NC_011031	ATT	7	69266	69286	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_011031	TAA	4	72966	72977	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033309
55	NC_011031	TTA	4	73548	73558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033309
56	NC_011031	TAA	5	73605	73619	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	194033309
57	NC_011031	TAT	4	75148	75159	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033309
58	NC_011031	ATA	4	75602	75612	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033309
59	NC_011031	ACA	4	80964	80976	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
60	NC_011031	TAA	4	83399	83409	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033286
61	NC_011031	AGG	4	85539	85550	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	194033286
62	NC_011031	AGA	5	86992	87007	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	194033286
63	NC_011031	TAT	4	87179	87189	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033286
64	NC_011031	AAG	4	90224	90235	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033286
65	NC_011031	ATT	4	94271	94282	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033341
66	NC_011031	ATA	4	95153	95165	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_011031	TAA	4	95203	95213	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_011031	ATT	4	96596	96606	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_011031	TAC	4	99405	99416	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	194033322
70	NC_011031	AAC	4	100121	100132	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
71	NC_011031	AAC	4	100231	100242	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
72	NC_011031	AAC	4	100246	100257	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_011031	AAT	4	100534	100544	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_011031	ATG	4	102495	102505	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_011031	AGC	4	103347	103358	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033348
76	NC_011031	AAT	4	116167	116178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_011031	ATA	4	119844	119856	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033266
78	NC_011031	AGA	4	121902	121913	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033305
79	NC_011031	CGA	4	124393	124404	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	194033306
80	NC_011031	ATA	4	124492	124503	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_011031	ATT	4	129380	129390	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_011031	AAT	4	132274	132286	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_011031	TAA	4	134900	134912	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033318
84	NC_011031	AAT	4	136098	136108	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033318
85	NC_011031	TTG	4	136971	136982	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	194033318
86	NC_011031	AAT	4	138973	138983	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033318
87	NC_011031	TGT	5	139714	139728	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	194033318
88	NC_011031	ATT	4	140004	140015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033318
89	NC_011031	TAT	4	140408	140419	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033318
90	NC_011031	ATT	7	141097	141118	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_011031	ATA	4	141968	141979	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_011031	TAA	4	144491	144502	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_011031	GTA	4	145124	145136	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	194033282
94	NC_011031	ATT	6	145198	145215	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	194033282
95	NC_011031	ATA	4	145281	145291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033282
96	NC_011031	TAT	4	147175	147185	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_011031	ATT	4	150466	150476	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033310
98	NC_011031	TAT	4	151446	151456	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033310
99	NC_011031	ATT	4	151489	151500	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033310
100	NC_011031	TAA	5	151935	151948	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	194033310
101	NC_011031	ATT	4	152347	152358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033310
102	NC_011031	GAA	4	152987	152998	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033310
103	NC_011031	TAA	4	155491	155502	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_011031	CAT	4	156268	156279	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	194033275
105	NC_011031	CTT	4	156823	156834	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	194033275
106	NC_011031	ATA	4	157220	157231	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033275
107	NC_011031	TTA	4	158848	158859	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_011031	AAT	4	159067	159077	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033316
109	NC_011031	GAA	4	159093	159104	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	194033316
110	NC_011031	TAT	4	159898	159909	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033308
111	NC_011031	ATT	4	161837	161847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	194033345
112	NC_011031	CCG	4	172044	172054	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
113	NC_011031	ATT	4	174781	174792	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	194033352
114	NC_011031	ATT	4	176367	176377	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_011031	TTG	4	176655	176666	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_011031	TTG	4	176670	176681	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_011031	TGT	4	176781	176792	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_011031	TAG	4	177496	177507	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	194033353
119	NC_011031	ATA	4	177646	177656	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033353
120	NC_011031	TAA	4	177770	177781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033353
121	NC_011031	TGT	4	179172	179184	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_011031	TAA	4	181500	181511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_011031	TAT	4	181746	181758	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_011031	AAT	4	182629	182640	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	194033354
125	NC_011031	TCT	4	186676	186686	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	194033355
126	NC_011031	ATA	4	189722	189732	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	194033355
127	NC_011031	TTC	4	189910	189920	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	194033355
128	NC_011031	CCT	4	191361	191372	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	194033355
129	NC_011031	TGT	4	195935	195947	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Oedogonium cardiacum chloroplast