ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Shinkaia crosnieri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011013	TAAT	3	228	239	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	192293794
2	NC_011013	GGA	4	661	671	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	192293794
3	NC_011013	ATT	4	1396	1407	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	192293794
4	NC_011013	TAT	4	2603	2614	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	192293796
5	NC_011013	AAT	4	2997	3008	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	192293796
6	NC_011013	TCT	4	3173	3183	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	192293796
7	NC_011013	TTA	5	4353	4369	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	192293798
8	NC_011013	TCA	4	4474	4484	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	192293799
9	NC_011013	ATA	4	5413	5424	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_011013	AATT	3	5575	5586	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	192293800
11	NC_011013	TCC	4	5803	5813	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	192293800
12	NC_011013	AAACT	3	6012	6027	16	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	192293800
13	NC_011013	AACT	3	6486	6496	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_011013	TAA	4	8373	8384	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_011013	ATTTAA	4	8460	8483	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_011013	TTAA	3	8619	8629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_011013	TAATTT	3	8807	8825	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_011013	TCT	4	8956	8967	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_011013	TAAA	3	8984	8994	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_011013	TTTAT	3	9014	9028	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_011013	TTAA	3	9305	9317	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	192293801
22	NC_011013	TC	6	9323	9333	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	192293801
23	NC_011013	AATT	3	9466	9478	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	192293801
24	NC_011013	TTTTA	3	9769	9782	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_011013	TAAA	3	10117	10127	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	192293802
26	NC_011013	AT	6	10273	10284	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	192293802
27	NC_011013	TAA	4	10990	11001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	192293802
28	NC_011013	TGAA	3	11074	11084	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	192293802
29	NC_011013	GGCA	3	11116	11126	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	192293802
30	NC_011013	AAAT	3	11462	11473	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	192293802
31	NC_011013	AT	6	12548	12559	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	192293803
32	NC_011013	TAA	4	12566	12576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	192293803
33	NC_011013	TAATA	3	12812	12826	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	192293803
34	NC_011013	TAAA	3	12909	12919	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	192293803
35	NC_011013	AAAT	3	13068	13079	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	192293803
36	NC_011013	A	13	13123	13135	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	192293803
37	NC_011013	TCT	4	13151	13162	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	192293804
38	NC_011013	AAAAT	3	13249	13263	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	192293804
39	NC_011013	ATA	5	13392	13406	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	192293804
40	NC_011013	TATT	3	13528	13538	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	192293805
41	NC_011013	ATT	4	13548	13559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	192293805
42	NC_011013	TTTA	3	13712	13723	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	192293805

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Shinkaia crosnieri mitochondrion