Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Rhagophthalmus ohbai mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_010964AATT31021141350 %50 %0 %0 %7 %192293812
2NC_010964TCATTA34494661833.33 %50 %0 %16.67 %5 %192293812
3NC_010964TTTAAA3110411221950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
4NC_010964AGG4186918791133.33 %0 %66.67 %0 %9 %192293813
5NC_010964ATTT4222922441625 %75 %0 %0 %6 %192293813
6NC_010964AAT4272727391366.67 %33.33 %0 %0 %7 %192293813
7NC_010964ATT4305530651133.33 %66.67 %0 %0 %9 %192293814
8NC_010964TTAA5368337022050 %50 %0 %0 %10 %192293815
9NC_010964TTA4432143321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %192293816
10NC_010964TTA4433743481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %192293816
11NC_010964TTTTTG347264744190 %83.33 %16.67 %0 %10 %192293817
12NC_010964TAA5534853621566.67 %33.33 %0 %0 %6 %192293818
13NC_010964TAAATA3571557331966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
14NC_010964TTTATA3590859251833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
15NC_010964ATATT3609261051440 %60 %0 %0 %7 %192293819
16NC_010964ATAA3640864191275 %25 %0 %0 %8 %192293819
17NC_010964AAAT6661066322375 %25 %0 %0 %8 %192293819
18NC_010964TTA4690369141233.33 %66.67 %0 %0 %8 %192293819
19NC_010964TGAA3709071001150 %25 %25 %0 %9 %192293819
20NC_010964A267708773326100 %0 %0 %0 %7 %192293819
21NC_010964TAA4786978831566.67 %33.33 %0 %0 %6 %192293820
22NC_010964ATT4792379331133.33 %66.67 %0 %0 %9 %192293820
23NC_010964ATT4823682471233.33 %66.67 %0 %0 %0 %192293820
24NC_010964A138622863413100 %0 %0 %0 %0 %192293820
25NC_010964AT6871187211150 %50 %0 %0 %9 %192293820
26NC_010964TAAAAT3875787741866.67 %33.33 %0 %0 %5 %192293820
27NC_010964CAAA3879288021175 %0 %0 %25 %9 %192293820
28NC_010964TAAA4880388171575 %25 %0 %0 %6 %192293820
29NC_010964TAAA3883488441175 %25 %0 %0 %9 %192293820
30NC_010964A129052906312100 %0 %0 %0 %8 %192293820
31NC_010964A129279929012100 %0 %0 %0 %8 %192293821
32NC_010964A129389940012100 %0 %0 %0 %8 %192293821
33NC_010964ATA4955095611266.67 %33.33 %0 %0 %8 %192293822
34NC_010964TTA4982198311133.33 %66.67 %0 %0 %9 %192293822
35NC_010964AAT4983198421266.67 %33.33 %0 %0 %8 %192293822
36NC_010964TTA4990699171233.33 %66.67 %0 %0 %8 %192293822
37NC_010964TAA510081100951566.67 %33.33 %0 %0 %6 %192293823
38NC_010964AT610370103811250 %50 %0 %0 %8 %192293823
39NC_010964ATT410404104141133.33 %66.67 %0 %0 %9 %192293823
40NC_010964ATA410755107661266.67 %33.33 %0 %0 %8 %192293823
41NC_010964A12109741098512100 %0 %0 %0 %8 %192293823
42NC_010964AATT311315113261250 %50 %0 %0 %8 %192293824
43NC_010964A18114361145318100 %0 %0 %0 %0 %192293824
44NC_010964ATAAAA311941119581883.33 %16.67 %0 %0 %5 %192293824
45NC_010964ATA412171121811166.67 %33.33 %0 %0 %9 %192293824
46NC_010964TAA512188122021566.67 %33.33 %0 %0 %6 %192293824
47NC_010964TAA412278122881166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_010964ATTT312544125541125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
49NC_010964AAT412662126741366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
50NC_010964TAA412675126851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
51NC_010964TAT412968129791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_010964ATA413068130781166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
53NC_010964AAT413118131291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
54NC_010964TAA513132131461566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
55NC_010964TAAA313335133461275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
56NC_010964TAAA413500135141575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
57NC_010964TAAA314277142881275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_010964TAA515061150741466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
59NC_010964TTTAAT415283153062433.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
60NC_010964A72153961546772100 %0 %0 %0 %9 %Non-Coding
61NC_010964TTA515463154761433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding